187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5656 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5656  Spermine synthase  100 
 
 		 281 aa  580  1.0000000000000001e-165  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24640  spermidine synthase  63.6 
 
 		 283 aa  367  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.845245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02190  spermidine synthase  58.95 
 
 		 299 aa  348  5e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1395  Spermine synthase  29.44 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1107  spermidine synthase  29.86 
 
 		 326 aa  87.8  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0120  spermidine synthase  30.94 
 
 		 304 aa  85.5  9e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4694  spermidine synthase  30.77 
 
 		 522 aa  82.8  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0855  spermidine synthase  32.24 
 
 		 567 aa  81.3  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00481823  normal  0.101312 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4961  Spermine synthase  27.27 
 
 		 313 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.787243 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40897  Spermidine synthase  28 
 
 		 328 aa  80.1  0.00000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.862336 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0602  spermidine synthase  28.06 
 
 		 279 aa  79.3  0.00000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4705  spermidine synthase  28.46 
 
 		 283 aa  78.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.725574 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1312  spermine synthase  26.3 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.690465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0383  spermine synthase  26.94 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0886  spermidine synthase  28.1 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.176516 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1858  Spermine synthase  29.07 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.252885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1864  spermidine synthase  27.48 
 
 		 286 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0174037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2590  spermidine synthase  26.67 
 
 		 280 aa  73.6  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.138188 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0515  spermidine synthase  23.05 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0628  spermidine synthase  30.41 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.414724  normal  0.905176 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29501  spermidine synthase  26.67 
 
 		 286 aa  73.2  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2253  spermine synthase / spermidine synthase  24.71 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.158612 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0529  spermidine synthase  23.05 
 
 		 283 aa  73.2  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1382  spermine synthase  28.71 
 
 		 305 aa  73.2  0.000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00501465  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2234  spermidine synthase  31.46 
 
 		 528 aa  72.8  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0284  spermine synthase  27.05 
 
 		 289 aa  72.8  0.000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.774661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1460  Spermine synthase  28.8 
 
 		 304 aa  72.4  0.000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1569  spermidine synthase  26.52 
 
 		 508 aa  72.8  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0126  spermidine synthase  31.67 
 
 		 519 aa  72.4  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.597506  decreased coverage  0.0000389155 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2020  Spermine synthase  26.41 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2046  Spermine synthase  26.41 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2743  Spermine synthase  28.72 
 
 		 536 aa  72.4  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.241267  hitchhiker  0.00393215 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42690  spermidine synthase  28.14 
 
 		 286 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23820  spermidine synthase  25.79 
 
 		 286 aa  72.4  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3584  spermidine synthase  28.14 
 
 		 286 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1222  spermidine synthase  26.56 
 
 		 510 aa  71.6  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00106657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0155  spermidine synthase  28.7 
 
 		 276 aa  71.6  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.164944  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0896  spermidine synthase  26.67 
 
 		 279 aa  72  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2055  spermidine synthase  25.79 
 
 		 286 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1732  spermidine synthase  27.64 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2229  spermidine synthase  26.84 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2319  Spermine synthase  24.6 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.961165  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0772  spermine synthase / spermidine synthase  26.63 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1825  spermidine synthase  26.8 
 
 		 280 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1086  spermidine synthase  26.8 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2411  spermidine synthase  27.46 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2836  spermidine synthase  23.53 
 
 		 287 aa  69.7  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0831  spermidine synthase  26.29 
 
 		 280 aa  69.3  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0239  spermine synthase  25.82 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.435342 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1016  spermidine synthase  23.53 
 
 		 287 aa  68.9  0.00000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0182  spermidine synthase  26.32 
 
 		 284 aa  68.9  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000125359  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21581  spermidine synthase  23.64 
 
 		 288 aa  68.9  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.703776 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1565  Spermine synthase  31.25 
 
 		 312 aa  68.9  0.00000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.673187  normal  0.0572452 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0701  Spermine synthase  28.57 
 
 		 533 aa  68.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3129  spermidine synthase  23.53 
 
 		 287 aa  68.6  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1879  Spermine synthase  28.94 
 
 		 287 aa  68.6  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18761  spermidine synthase  23.66 
 
 		 283 aa  68.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.443872  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0668  spermidine synthase  26.34 
 
 		 273 aa  67.8  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.672197  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2546  spermidine synthase  25 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18951  spermidine synthase  23.74 
 
 		 283 aa  67.8  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.454611  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0206  spermidine synthase  24.5 
 
 		 277 aa  67.8  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2794  spermidine synthase  23.65 
 
 		 286 aa  67  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1812  Spermine synthase  26.11 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1778  spermidine synthase  23.21 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.251916  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4001  spermidine synthase  23.96 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3054  spermidine synthase  22.65 
 
 		 283 aa  65.9  0.0000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5495  hypothetical protein  27.86 
 
 		 375 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0722  spermidine synthase  23.83 
 
 		 308 aa  65.5  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.441683 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0669  spermidine synthase  22.62 
 
 		 289 aa  65.5  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000146027  normal  0.395519 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5377  spermidine synthase  24.02 
 
 		 375 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1286  spermidine synthase  23.36 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1023  spermidine synthase  22.17 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0128  spermidine synthase  22.62 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000545109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1199  spermidine synthase  24.3 
 
 		 279 aa  64.7  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.928058  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63120  hypothetical protein  30.06 
 
 		 349 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00932566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3354  spermidine synthase  22.17 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000276507  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3482  spermidine synthase  22.17 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00378102  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00120  spermidine synthase  22.62 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00387054  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3481  spermidine synthase  22.62 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00013489  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00119  hypothetical protein  22.62 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00179737  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0336  spermine synthase  26.91 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3538  spermidine synthase  22.62 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00580941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0131  spermidine synthase  22.62 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.316229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0125  spermidine synthase  22.62 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567912  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0123  spermidine synthase  22.62 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.705101  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0185  spermidine synthase  22.77 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.506874 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40259  predicted protein  24.09 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0644688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0198  spermidine synthase  22.77 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0181  spermidine synthase  22.77 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0182  spermidine synthase  22.77 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1862  spermidine synthase  25.39 
 
 		 520 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0190  spermidine synthase  22.77 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.241142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1156  Spermine synthase  28.42 
 
 		 538 aa  62.8  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1306  spermidine synthase  25.65 
 
 		 525 aa  62.8  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4120  spermidine synthase  25.65 
 
 		 525 aa  62.4  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.139425  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3170  spermidine synthase  29.55 
 
 		 529 aa  62.8  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0139391  normal  0.072114 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4232  spermidine synthase  25.65 
 
 		 525 aa  62.4  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.716937  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5174  Spermine synthase  28.89 
 
 		 521 aa  62.4  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5332  spermidine synthase  22.91 
 
 		 363 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1928  spermidine synthase  25.91 
 
 		 520 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259816  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>