More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4189 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4189  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 281 aa  533  1e-150  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8637  alpha/beta hydrolase fold protein  54.63 
 
 		 370 aa  325  4.0000000000000003e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal  0.751963 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2119  alpha/beta hydrolase fold  61.07 
 
 		 307 aa  292  3e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  35.56 
 
 		 324 aa  153  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  37.05 
 
 		 290 aa  153  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2996  alpha/beta hydrolase fold protein  34.26 
 
 		 335 aa  141  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.761802  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2869  alpha/beta hydrolase fold protein  28.21 
 
 		 291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.415646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02030  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  34.83 
 
 		 341 aa  138  8.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3105  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 		 291 aa  138  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6445  alpha/beta hydrolase fold protein  32.65 
 
 		 340 aa  136  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.668195  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2211  putative hydrolase  30.94 
 
 		 320 aa  136  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498461  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  32.25 
 
 		 283 aa  135  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3580  alpha/beta hydrolase fold  30.36 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4419  alpha/beta hydrolase fold  30.36 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3948  alpha/beta hydrolase fold  30.36 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4626  alpha/beta hydrolase fold protein  33.22 
 
 		 348 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.804772 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2970  alpha/beta hydrolase fold  37.11 
 
 		 315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  32.62 
 
 		 321 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6868  Alpha/beta hydrolase  31.58 
 
 		 312 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1800  alpha/beta hydrolase fold  31.54 
 
 		 351 aa  128  8.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0840608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  30.27 
 
 		 291 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  31.65 
 
 		 306 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  31.65 
 
 		 306 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  29.25 
 
 		 291 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32.26 
 
 		 293 aa  119  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4310  alpha/beta hydrolase fold protein  28.99 
 
 		 309 aa  119  7.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.680972  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4769  alpha/beta hydrolase fold  32.59 
 
 		 282 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 		 287 aa  117  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1225  alpha/beta hydrolase fold  36.03 
 
 		 292 aa  116  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.475843  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  29.25 
 
 		 291 aa  115  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 		 288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3621  alpha/beta hydrolase fold protein  29.89 
 
 		 335 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  28.07 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4288  alpha/beta hydrolase fold protein  27.06 
 
 		 262 aa  110  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262225  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  32.65 
 
 		 301 aa  110  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2767  alpha/beta hydrolase fold  32.62 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  29.79 
 
 		 287 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26090  putative hydrolase  28.11 
 
 		 319 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.860193 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2809  alpha/beta hydrolase fold protein  30.27 
 
 		 302 aa  106  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0732  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  29.68 
 
 		 346 aa  106  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  28.93 
 
 		 302 aa  105  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4088  alpha/beta hydrolase fold protein  37.19 
 
 		 309 aa  105  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.90454  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  25.96 
 
 		 311 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  26.09 
 
 		 290 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5344  putative hydrolase  29.56 
 
 		 317 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.824632  normal  0.198209 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  28.37 
 
 		 303 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 		 286 aa  102  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  24.91 
 
 		 289 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3091  Alpha/beta hydrolase  29.5 
 
 		 294 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.1055 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2543  alpha/beta hydrolase fold  28.87 
 
 		 298 aa  101  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.239971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 		 287 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1465  alpha/beta hydrolase fold  31.79 
 
 		 296 aa  100  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  29.14 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  24.56 
 
 		 289 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2732  alpha/beta hydrolase fold  31.8 
 
 		 292 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  29.32 
 
 		 302 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0533  alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 		 284 aa  97.8  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3063  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 		 295 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.841817  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3925  alpha/beta hydrolase fold  29.82 
 
 		 298 aa  95.9  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0345488  normal  0.030729 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 		 288 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  29.55 
 
 		 283 aa  94  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1373  alpha/beta hydrolase fold protein  26.64 
 
 		 290 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.292438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  28.67 
 
 		 288 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  33.22 
 
 		 307 aa  93.2  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09470  Alpha/beta hydrolase fold protein  31.89 
 
 		 290 aa  92.8  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.688745  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  26.25 
 
 		 290 aa  92.4  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0146  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 306 aa  92.4  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  29.09 
 
 		 278 aa  92  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0684332 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00788  epoxide hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08810)  29.66 
 
 		 313 aa  90.9  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0593995  normal  0.200969 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1001  alpha/beta hydrolase fold  31.09 
 
 		 291 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3459  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 		 297 aa  91.3  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0167  alpha/beta hydrolase fold  26.87 
 
 		 304 aa  90.5  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.105219 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1787  alpha/beta hydrolase fold protein  31.36 
 
 		 304 aa  90.1  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1601  alpha/beta hydrolase fold  29.38 
 
 		 328 aa  90.1  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  26.24 
 
 		 284 aa  89.7  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  31.67 
 
 		 298 aa  89.4  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.0369902 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10135  epoxide hydrolase ephF  29.21 
 
 		 300 aa  89  7e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.890635 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4283  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 		 300 aa  87.8  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5068  alpha/beta hydrolase fold protein  31.58 
 
 		 297 aa  87.4  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4032  alpha/beta hydrolase  29.9 
 
 		 294 aa  87.8  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3670  alpha/beta hydrolase fold  27.36 
 
 		 315 aa  87.4  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0409253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  31.48 
 
 		 291 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1770  hydrolase protein  29.9 
 
 		 311 aa  86.7  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  32.48 
 
 		 270 aa  86.7  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3822  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 		 291 aa  86.3  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3843  alpha/beta hydrolase fold  28.16 
 
 		 316 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  27.72 
 
 		 300 aa  85.9  8e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  27.56 
 
 		 288 aa  85.5  8e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0481  alpha/beta hydrolase fold  33.05 
 
 		 303 aa  85.5  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.838629  normal  0.605944 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1436  alpha/beta hydrolase fold  28.28 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205853 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1919  alpha/beta hydrolase fold  27.1 
 
 		 309 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3998  alpha/beta hydrolase fold  27.51 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  0.902376 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3835  Alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0435059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  28.09 
 
 		 341 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1728  alpha/beta hydrolase fold protein  29.82 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.0268844 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  42.86 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2775  alpha/beta hydrolase  30.36 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>