More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3321 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3321  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  100 
 
 		 418 aa  784    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.395905  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2868  ATPase  81.06 
 
 		 414 aa  610  1e-173  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.249465  normal  0.109975 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8670  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  60 
 
 		 414 aa  408  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0965091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1910  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.72 
 
 		 360 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.15 
 
 		 398 aa  259  7e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0067351  normal  0.07307 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  50.76 
 
 		 361 aa  234  3e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.26531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5422  ATPase  42.14 
 
 		 368 aa  200  5e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3480  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  43.04 
 
 		 367 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5625  ATPase  39.77 
 
 		 368 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.486488  normal  0.318658 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5803  ATPase  39.77 
 
 		 368 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000039959 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2669  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.7 
 
 		 372 aa  187  3e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000749839  normal  0.0501266 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4134  ATPase  33.43 
 
 		 379 aa  144  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3478  transcriptional regulator, SARP family  34.84 
 
 		 365 aa  135  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0483  ATPase  33.88 
 
 		 327 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2964  hypothetical protein  36.04 
 
 		 348 aa  126  6e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.171946  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1729  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  33.98 
 
 		 330 aa  126  6e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000142331  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2569  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34.72 
 
 		 327 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0748  hypothetical protein  32.11 
 
 		 347 aa  119  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0872  ATPase  37.18 
 
 		 340 aa  119  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.571105  normal  0.718721 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1546  hypothetical protein  33 
 
 		 379 aa  116  6e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776475 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1782  ATPase  30.47 
 
 		 331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.860256  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2286  hypothetical protein  33 
 
 		 348 aa  114  5e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1251  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  37.93 
 
 		 347 aa  108  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0522  AAA family ATPase  29.39 
 
 		 332 aa  107  6e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.010453  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1600  MoxR-like ATPase  31.28 
 
 		 332 aa  105  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2697  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.1 
 
 		 347 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1120  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.54 
 
 		 354 aa  93.2  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1340  ATPase  32.68 
 
 		 372 aa  89.7  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1928  MoxR-like protein ATPase-like protein  32.54 
 
 		 353 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1490  AAA_3 ATPase  33.33 
 
 		 364 aa  88.6  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5603  ATPase  31.01 
 
 		 341 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6512  ATPase  27.98 
 
 		 342 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0152  P-loop ATPase  31.13 
 
 		 379 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1784  ATPase  31.13 
 
 		 372 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0249  hypothetical protein  29.79 
 
 		 367 aa  80.5  0.00000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.211939  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1319  hypothetical protein  27.39 
 
 		 369 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2040  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  39.57 
 
 		 364 aa  76.3  0.0000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0628555  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1218  hypothetical protein  26.8 
 
 		 369 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0256  hypothetical protein  25.79 
 
 		 368 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.143072  normal  0.216525 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0637  hypothetical protein  24.48 
 
 		 371 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.261889  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0623  hypothetical protein  24.83 
 
 		 371 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00147327  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1973  hypothetical protein  32.46 
 
 		 372 aa  75.5  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0367199  normal  0.929244 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1403  hypothetical protein  26.43 
 
 		 369 aa  73.2  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1448  ATPase  24.65 
 
 		 360 aa  70.9  0.00000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.440303  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5262  AAA ATPase  28.07 
 
 		 354 aa  69.7  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.786609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1621  AAA ATPase  28.07 
 
 		 354 aa  69.7  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1850  ATPase  31.54 
 
 		 351 aa  68.2  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1301  ATPase  30.77 
 
 		 328 aa  67.8  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.777797  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1222  AAA ATPase  26.32 
 
 		 505 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00799  ATPase  25 
 
 		 334 aa  65.5  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000387294  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16090  ATPase family protein associated with various cellular activities (AAA)  27.91 
 
 		 489 aa  64.7  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.454576  hitchhiker  0.000000267923 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1812  ATPase  30.87 
 
 		 351 aa  63.5  0.000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1462  ATPase  21.87 
 
 		 352 aa  62.4  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2042  AAA ATPase  22.95 
 
 		 396 aa  62  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0306993  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2494  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.27 
 
 		 521 aa  61.6  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1800  hypothetical protein  30.77 
 
 		 381 aa  61.2  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0934  ATPase  27.07 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5996  hypothetical protein  34.88 
 
 		 369 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0475  ATPase  28.87 
 
 		 383 aa  57.8  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1763  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  34.29 
 
 		 388 aa  57.8  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0456  MoxR-like ATPase  32.59 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3227  Fis family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 362 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1425  AAA ATPase  32.3 
 
 		 362 aa  55.1  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.113795 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2528  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  36.84 
 
 		 579 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0413  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  32.34 
 
 		 345 aa  54.3  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.961904 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1284  psp operon transcriptional activator  34.56 
 
 		 338 aa  53.9  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2625  formate hydrogenlyase transcriptional activator  33.33 
 
 		 648 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1185  NifA subfamily transcriptional regulator  32.1 
 
 		 670 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.132433 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0699  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.29 
 
 		 489 aa  53.5  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0760161 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0693  sigma-54 dependent transcriptional regulator  28.67 
 
 		 643 aa  53.1  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0274  sigma-54 dependent transcriptional regulator/sensory box protein  31.11 
 
 		 474 aa  53.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0842  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  28.67 
 
 		 697 aa  52.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.801762 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1259  AAA ATPase  26.29 
 
 		 412 aa  53.1  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0480  psp operon transcriptional activator PspF  36.29 
 
 		 340 aa  52.8  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3125  putative sigma54 specific transcriptional regulator  32.84 
 
 		 703 aa  52.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.189473  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3045  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  33.57 
 
 		 637 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3918  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  26.27 
 
 		 367 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4853  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  27.27 
 
 		 457 aa  52.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.231814  hitchhiker  0.00735887 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2825  MoxR-like protein ATPase-like protein  25.9 
 
 		 367 aa  52.8  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02383  DNA-binding transcriptional activator, formate sensing  32.65 
 
 		 668 aa  52  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1178  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  32.65 
 
 		 670 aa  52  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2259  GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  32.64 
 
 		 591 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.026618 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3479  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  31.94 
 
 		 582 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.496385  normal  0.125904 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02345  hypothetical protein  32.65 
 
 		 670 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3713  formate hydrogenlyase transcriptional activator  32.65 
 
 		 670 aa  52  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.574322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1542  Fis family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 586 aa  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.332914  normal  0.115616 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2638  hydrogenase-4 transcriptional regulator  32.65 
 
 		 670 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0291  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.66 
 
 		 444 aa  51.6  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00612417  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2773  formate hydrogenlyase transcriptional activator  32.65 
 
 		 670 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.309926  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01871  hypothetical protein  34.33 
 
 		 357 aa  51.6  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0601  ATPase  29.45 
 
 		 328 aa  51.6  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.122175  normal  0.0641018 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6646  xylR-like aromatic hydrocarbon degradgation transcriptional regulatory protein  32.54 
 
 		 587 aa  50.8  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1915  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  34.92 
 
 		 467 aa  51.2  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0712701  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1736  helix-turn-helix, Fis-type  34.38 
 
 		 617 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.590224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003815  Psp operon transcriptional activator  34.33 
 
 		 336 aa  50.4  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1649  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 479 aa  50.8  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5345  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.5 
 
 		 455 aa  50.4  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464024  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1513  phage shock protein operon transcriptional activator  36.29 
 
 		 325 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1816  phage shock protein operon transcriptional activator  37.1 
 
 		 331 aa  50.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.233716 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1877  phage shock protein operon transcriptional activator  37.1 
 
 		 331 aa  50.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.436401  normal  0.0112899 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>