More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2745 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2745  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  100 
 
 
522 aa  1032    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0376  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  82.88 
 
 
520 aa  843    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.984009  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05860  methyl-accepting chemotaxis protein  62.33 
 
 
517 aa  597  1e-169  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1930  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.19 
 
 
517 aa  590  1e-167  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0153757  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4465  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.08 
 
 
532 aa  571  1e-161  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.857744  normal  0.045525 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2472  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  49.08 
 
 
519 aa  429  1e-119  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0704852  normal  0.0411737 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1909  chemotaxis sensory transducer  48.96 
 
 
965 aa  343  4e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.11776  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4261  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.79 
 
 
525 aa  334  2e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.545392  normal  0.505117 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3394  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  39.92 
 
 
516 aa  292  8e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2984  chemotaxis sensory transducer  52.33 
 
 
545 aa  159  8e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1751  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.19 
 
 
547 aa  157  4e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1613  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.25 
 
 
523 aa  156  7e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00385179  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.42 
 
 
904 aa  154  5e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3602  chemotaxis sensory transducer  47.09 
 
 
518 aa  151  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1293  chemotaxis sensory transducer  51.76 
 
 
542 aa  151  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.320257  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.62 
 
 
545 aa  149  9e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2095  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.16 
 
 
538 aa  149  9e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5009  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.35 
 
 
537 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0359  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.26 
 
 
542 aa  148  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06110  methyl-accepting chemotaxis protein  50 
 
 
533 aa  145  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.232988  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5008  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.18 
 
 
546 aa  144  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30970  methyl-accepting chemotaxis protein  51.18 
 
 
562 aa  143  7e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32360  methyl-accepting chemotaxis protein  55.86 
 
 
530 aa  142  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.91 
 
 
544 aa  142  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.03 
 
 
532 aa  142  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.570256  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32370  methyl-accepting chemotaxis protein  55.17 
 
 
531 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5010  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.59 
 
 
538 aa  141  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4229  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.35 
 
 
1150 aa  140  3.9999999999999997e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0198  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.57 
 
 
715 aa  140  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.419669  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2554  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.97 
 
 
644 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0186678  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36630  methyl-accepting chemotaxis protein  53.25 
 
 
540 aa  140  6e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1526  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.09 
 
 
858 aa  140  6e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.787952  normal  0.35844 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36620  methyl-accepting chemotaxis protein  53.25 
 
 
543 aa  139  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0835028  normal  0.811978 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4449  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.16 
 
 
538 aa  139  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018308  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2996  methyl-accepting chemotaxis protein  47.74 
 
 
698 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1995  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50 
 
 
394 aa  137  3.0000000000000003e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03110  methyl-accepting chemotaxis protein  54.05 
 
 
347 aa  137  5e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0123169  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4077  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.05 
 
 
545 aa  136  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0718  chemotaxis sensory transducer  50.97 
 
 
669 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.845917  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1755  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.7 
 
 
538 aa  135  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2460  chemotaxis sensory transducer  44.26 
 
 
565 aa  134  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0994  chemotaxis sensory transducer  41.53 
 
 
656 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05890  methyl-accepting chemotaxis protein  52.6 
 
 
538 aa  134  5e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2197  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.94 
 
 
522 aa  134  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0109  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.68 
 
 
528 aa  134  6e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.268294  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.1 
 
 
698 aa  133  6e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0139762  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.61 
 
 
702 aa  133  6.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105528  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1160  chemotaxis sensory transducer  48.39 
 
 
559 aa  133  9e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0421  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.84 
 
 
623 aa  133  1.0000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.308823 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.44 
 
 
656 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0651  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.34 
 
 
535 aa  131  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.406234  normal  0.0260089 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27420  methyl-accepting chemotaxis protein  54.36 
 
 
540 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.141989  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.74 
 
 
563 aa  131  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2460  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50 
 
 
531 aa  131  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30940  methyl-accepting chemotaxis protein  47.56 
 
 
407 aa  130  7.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.682285  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0995  chemotaxis sensory transducer  45.81 
 
 
656 aa  130  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.880627  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1857  chemotaxis sensory transducer  43.72 
 
 
563 aa  130  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1974  chemotaxis sensory transducer  44.19 
 
 
535 aa  129  9.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4269  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer protein  46.45 
 
 
691 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.35374 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2546  chemotaxis sensory transducer  47.74 
 
 
690 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07600  methyl-accepting chemotaxis protein  51.28 
 
 
533 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0696595 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4783  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.17 
 
 
730 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0673  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  46.47 
 
 
533 aa  129  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.349323 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30950  methyl-accepting chemotaxis protein  46.25 
 
 
540 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.664181  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0127  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.46 
 
 
397 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.362921  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.1 
 
 
563 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0336  chemotaxis sensory transducer  47.1 
 
 
563 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20550  methyl-accepting chemotaxis protein  45.91 
 
 
733 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.375054  normal  0.44591 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6993  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  47.74 
 
 
697 aa  128  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.98 
 
 
573 aa  128  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610641  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3504  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.78 
 
 
657 aa  127  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.193477  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.52 
 
 
675 aa  127  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0391093 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.81 
 
 
563 aa  127  5e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1867  chemotaxis sensory transducer  40.44 
 
 
714 aa  127  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.133032 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1002  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.72 
 
 
529 aa  126  8.000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00624598 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5110  hypothetical protein  46.45 
 
 
688 aa  126  9e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.791751 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1830  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.81 
 
 
563 aa  126  9e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.1 
 
 
560 aa  126  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.52 
 
 
536 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483396  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1712  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  41.94 
 
 
500 aa  126  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3409  chemotaxis sensory transducer  49.32 
 
 
651 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.304746  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3904  chemotaxis sensory transducer  44.52 
 
 
566 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1977  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.3 
 
 
651 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.064764  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.13 
 
 
670 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2843  putative histidine kinase, HAMP region  43.23 
 
 
682 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3610  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.6 
 
 
563 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.52 
 
 
731 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.072786  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4931  putative methyl-accepting chemotaxis protein  45.51 
 
 
567 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1918  chemotaxis sensory transducer  44.52 
 
 
688 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2076  chemotaxis sensory transducer  45.16 
 
 
561 aa  124  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.723039  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  45.16 
 
 
716 aa  125  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2078  chemotaxis sensory transducer  45.16 
 
 
561 aa  124  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.960991  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1317  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.87 
 
 
560 aa  124  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.14669 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0337  chemotaxis sensory transducer  45.81 
 
 
563 aa  124  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.760858  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1536  methyl-accepting chemotaxis protein  43.87 
 
 
716 aa  124  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.566253  normal  0.284447 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3378  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.13 
 
 
563 aa  124  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104618  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30960  methyl-accepting chemotaxis protein  50 
 
 
540 aa  124  5e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4787  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.52 
 
 
561 aa  124  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.708956  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.16 
 
 
561 aa  124  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0630329  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0644  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  43.87 
 
 
565 aa  124  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>