More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4931 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_4931  putative methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 
567 aa  1125    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.55 
 
 
572 aa  364  3e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696609  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.09 
 
 
562 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.98 
 
 
563 aa  318  2e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.29 
 
 
573 aa  316  6e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610641  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.15 
 
 
572 aa  311  2e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.47 
 
 
688 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0110809  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.1 
 
 
567 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5403  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.35 
 
 
538 aa  307  3e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1918  chemotaxis sensory transducer  48.79 
 
 
688 aa  306  8.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3107  chemotaxis sensory transducer  47.76 
 
 
674 aa  302  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0664997 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0065  chemotaxis sensory transducer  47.64 
 
 
688 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0714339 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.09 
 
 
566 aa  301  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0330  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  48.3 
 
 
676 aa  299  8e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0869057 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4941  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.88 
 
 
563 aa  299  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.396774  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3545  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47 
 
 
689 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.457552  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.47 
 
 
566 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0575  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.29 
 
 
681 aa  297  3e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0192  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50 
 
 
688 aa  296  7e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0061  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.49 
 
 
674 aa  296  8e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.14 
 
 
567 aa  293  5e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0914  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.55 
 
 
689 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50 
 
 
675 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0391093 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.34 
 
 
672 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.24 
 
 
673 aa  290  4e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6483  methyl-accepting chemotaxis protein  45.57 
 
 
565 aa  289  9e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.877741  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4527  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.12 
 
 
667 aa  289  9e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.527831 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6635  methyl-accepting chemotaxis protein  46.09 
 
 
565 aa  288  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459746  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1843  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.86 
 
 
568 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.618754 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1388  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.41 
 
 
656 aa  286  5.999999999999999e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0527529  normal  0.207734 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.73 
 
 
681 aa  286  7e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.19 
 
 
567 aa  286  9e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.49 
 
 
670 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1253  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.87 
 
 
567 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.010155 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2905  putative methyl-accepting chemotaxis protein  48.12 
 
 
542 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.234112  normal  0.211145 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7508  putative methyl-accepting chemotaxis protein (with a HAMP region)  48.57 
 
 
552 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.692825  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.79 
 
 
731 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.072786  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.42 
 
 
567 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0981346  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2901  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.14 
 
 
674 aa  283  5.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.22504 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.97 
 
 
568 aa  283  7.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.55655  normal  0.12205 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2904  putative methyl-accepting chemotaxis protein  45.19 
 
 
568 aa  282  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal  0.283558 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.73 
 
 
563 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.53 
 
 
655 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.772812  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5144  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.01 
 
 
686 aa  281  3e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0153  chemotaxis sensory transducer  45.29 
 
 
602 aa  281  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3547  chemotaxis sensory transducer  46.35 
 
 
566 aa  281  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2996  methyl-accepting chemotaxis protein  44.91 
 
 
698 aa  280  6e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2903  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.23 
 
 
568 aa  280  6e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335645  normal  0.0996392 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.37 
 
 
698 aa  279  1e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0139762  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4269  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer protein  49.86 
 
 
691 aa  279  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.35374 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0885  putative methyl-accepting chemotaxis protein  46.4 
 
 
691 aa  279  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.493714  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.87 
 
 
730 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0177086  normal  0.260794 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3379  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.8 
 
 
587 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.787169  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0994  chemotaxis sensory transducer  46.15 
 
 
656 aa  277  4e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.3 
 
 
691 aa  276  5e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00184965  normal  0.0777916 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0995  chemotaxis sensory transducer  47.18 
 
 
656 aa  276  7e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.880627  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  46.6 
 
 
716 aa  276  8e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.17 
 
 
560 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1867  chemotaxis sensory transducer  46.15 
 
 
714 aa  273  9e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.133032 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.88 
 
 
561 aa  272  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0323515 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3378  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.19 
 
 
563 aa  272  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104618  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0497  chemotaxis sensory transducer  47.35 
 
 
577 aa  272  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2908  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  48.06 
 
 
561 aa  271  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4783  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.74 
 
 
730 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2465  chemotaxis sensory transducer  44.71 
 
 
561 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5909  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2900  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer (chemoreceptor)  47.4 
 
 
675 aa  269  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.142675  normal  0.173139 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.99 
 
 
563 aa  269  1e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.65 
 
 
561 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0630329  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4101  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.78 
 
 
698 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.18 
 
 
563 aa  267  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.174371  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.44 
 
 
563 aa  266  7e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.74 
 
 
656 aa  266  8e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2368  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer precursor  45.16 
 
 
561 aa  265  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2906  putative methyl-accepting chemotaxis protein  45.7 
 
 
564 aa  264  4e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.106702 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.99 
 
 
561 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6717  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.1 
 
 
741 aa  263  6e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447835  normal  0.587139 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2907  putative methyl-accepting chemotaxis protein  47.43 
 
 
556 aa  262  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.835875  normal  0.0729634 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0369  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.16 
 
 
615 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00881781 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3377  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.27 
 
 
563 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.528008  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.63 
 
 
563 aa  261  3e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.35 
 
 
561 aa  259  7e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.432423  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0772  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.04 
 
 
561 aa  258  2e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1427  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.36 
 
 
562 aa  258  2e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309452  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2799  putative receptor/sensory transducer  49.13 
 
 
707 aa  258  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0655652  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1830  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.97 
 
 
563 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1536  methyl-accepting chemotaxis protein  48.06 
 
 
716 aa  258  3e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.566253  normal  0.284447 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1857  chemotaxis sensory transducer  45.08 
 
 
563 aa  256  7e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1266  chemotaxis sensory transducer  45.82 
 
 
562 aa  256  9e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.75 
 
 
428 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.293169  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2902  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.51 
 
 
563 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.32606  normal  0.0943242 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1045  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  43.73 
 
 
564 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1716  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.74 
 
 
564 aa  253  7e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0822312  normal  0.62395 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0401  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.06 
 
 
615 aa  253  9.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000192098 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3904  chemotaxis sensory transducer  38.5 
 
 
566 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0158  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.68 
 
 
561 aa  251  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2367  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer precursor  46.88 
 
 
562 aa  251  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.287749 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3147  chemotaxis sensory transducer  41.38 
 
 
561 aa  250  4e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0908078  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.38 
 
 
561 aa  250  5e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130295  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.13 
 
 
559 aa  250  5e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.50218 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1739  chemotaxis sensory transducer  46.02 
 
 
559 aa  249  7e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>