More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4188 on replicon NC_008765
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008765  Ajs_4188  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 219 aa  444  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.141234  hitchhiker  0.000181264 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0815  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 213 aa  122  6e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3060  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.97 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 221 aa  117  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0242  two component LuxR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000159114 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3043  LuxR family DNA binding response regulator  32.54 
 
 		 209 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1714  two component LuxR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.975164  hitchhiker  0.000785935 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2471  two component LuxR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0816  two component LuxR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 212 aa  109  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000419268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06630  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  34.27 
 
 		 215 aa  107  2e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.252447  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4923  two component LuxR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 210 aa  105  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1030  two component LuxR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 215 aa  105  7e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1406  DNA-binding response regulator  29.25 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.253896  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0581  two component LuxR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4951  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.58 
 
 		 210 aa  102  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.710213  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0777  LuxR family DNA binding response regulator  31.63 
 
 		 215 aa  102  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.891731  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2780  two component LuxR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 226 aa  102  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8027  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.62 
 
 		 211 aa  102  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.982767  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1607  response regulator  31.28 
 
 		 214 aa  102  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000106395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5941  two component LuxR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 206 aa  102  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.234506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0485  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 208 aa  101  7e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3828  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.86 
 
 		 220 aa  101  9e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2562  response regulator  30.14 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0171044  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4197  two component LuxR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 230 aa  100  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.182672  normal  0.341651 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2600  response regulator  30.14 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000388579  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1547  response regulator  30.14 
 
 		 214 aa  101  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000288339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2677  response regulator  30.14 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0738952  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1608  response regulator  30.14 
 
 		 214 aa  101  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000660452  normal  0.150334 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1782  response regulator  30.14 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0381154  hitchhiker  0.0000000750596 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1860  response regulator  30.14 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1639  response regulator  29.67 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00137195  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3393  two component LuxR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0944476 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1614  response regulator  30.14 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000746753  normal  0.505035 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1123  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.66 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3597  two component LuxR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0090  two component LuxR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 210 aa  99.8  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2649  response regulator  30.23 
 
 		 214 aa  100  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2855  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.49 
 
 		 217 aa  99.4  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2141  response regulator  30.81 
 
 		 214 aa  99.4  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.126922  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3144  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.13 
 
 		 232 aa  99.4  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2236  two-component LuxR family response regulator  28.92 
 
 		 211 aa  98.6  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.520528  normal  0.548087 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3303  two component LuxR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 222 aa  98.2  8e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.248413 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2571  transmission activator LetA  30.81 
 
 		 219 aa  97.8  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2455  response regulator  29.77 
 
 		 214 aa  97.8  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.140183  normal  0.431169 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1824  response regulator  30.23 
 
 		 229 aa  97.4  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.152948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2290  two component LuxR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 215 aa  97.8  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0292  response regulator transcription regulator protein  31.6 
 
 		 210 aa  97.1  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2699  transmission activator LetA  30.81 
 
 		 219 aa  97.4  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1436  response regulator  30.7 
 
 		 214 aa  97.1  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.794512  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1953  response regulator  29.77 
 
 		 214 aa  96.7  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00404481  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2237  two component LuxR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 211 aa  96.3  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1743  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.02 
 
 		 214 aa  96.3  3e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.370009  normal  0.039988 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1026  response regulator protein  28.23 
 
 		 217 aa  96.3  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7764  two component LuxR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 210 aa  95.9  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.527093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0145  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.6 
 
 		 210 aa  95.9  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1168  LuxR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 216 aa  95.5  5e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0121  two component LuxR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 210 aa  95.5  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.830531  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0153  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.6 
 
 		 210 aa  95.1  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02748  response regulator  29.44 
 
 		 214 aa  95.5  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0876  two component LuxR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 233 aa  95.5  6e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.481499  normal  0.345787 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.5 
 
 		 210 aa  95.1  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.612124 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5014  two component LuxR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 209 aa  95.1  8e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.103708  normal  0.29037 
 
 
-
 
NC_004310  BR0342  LuxR family DNA-binding response regulator  32.24 
 
 		 213 aa  94.4  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0601944  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0474  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.81 
 
 		 211 aa  94.4  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1235  two component LuxR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 211 aa  94.4  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7525  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.19 
 
 		 210 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.588744  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0358  LuxR family DNA-binding response regulator  32.24 
 
 		 213 aa  94.4  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.363  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6558  two component LuxR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 210 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0682  LuxR family DNA-binding response regulator  31.02 
 
 		 215 aa  93.6  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.874366  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0833  response regulator  30.37 
 
 		 227 aa  94  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000189156  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0306  two component LuxR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 215 aa  94  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000161342  hitchhiker  0.00000159266 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2227  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.11 
 
 		 217 aa  94  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.632961  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4619  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.16 
 
 		 226 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.167951  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0828  response regulator  32.23 
 
 		 216 aa  93.6  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0183204  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4967  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.56 
 
 		 220 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.103677  normal  0.0219916 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4453  response regulator receiver  29.56 
 
 		 229 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.731843 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4917  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.56 
 
 		 221 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2172  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.44 
 
 		 210 aa  92.4  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2876  response regulator receiver  28.7 
 
 		 284 aa  92.4  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2450  two component LuxR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 214 aa  92  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00539256  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6527  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.96 
 
 		 215 aa  92  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1487  two component LuxR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 231 aa  92  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0122618  normal  0.753042 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2078  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.64 
 
 		 210 aa  91.3  9e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4137  response regulator receiver  30.65 
 
 		 225 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.218362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1247  LuxR family DNA-binding response regulator  30.14 
 
 		 215 aa  90.9  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32702  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4505  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.65 
 
 		 225 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.782253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2150  response regulator  29.49 
 
 		 216 aa  91.3  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0590135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3079  two component LuxR family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 233 aa  90.9  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1936  regulatory protein LuxR  30.14 
 
 		 218 aa  90.5  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.548655  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1785  two component LuxR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 206 aa  90.5  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.762084  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3509  two component LuxR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 239 aa  90.5  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1336  two component LuxR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 208 aa  90.5  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1762  two component LuxR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 210 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2832  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.52 
 
 		 210 aa  90.1  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.988429  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1167  two component LuxR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 213 aa  90.9  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5446  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.98 
 
 		 218 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0357  two-component response regulator  29.11 
 
 		 210 aa  90.5  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00848176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2669  response regulator  28.64 
 
 		 218 aa  89.7  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000700042  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0651  two component LuxR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 209 aa  89.7  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.713834 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1450  response regulator  28.44 
 
 		 218 aa  89.7  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>