264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1157 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1157  Prephenate dehydrogenase  100 
 
 
324 aa  607  1e-173  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.190693  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0799  Prephenate dehydrogenase  37.89 
 
 
329 aa  102  1e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.253718 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26030  prephenate dehydrogenase  36.19 
 
 
334 aa  95.9  9e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0165  prephenate dehydrogenase  27.72 
 
 
275 aa  95.9  9e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000395758  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0143  prephenate dehydrogenase  27.72 
 
 
275 aa  95.5  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000169587  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2151  prephenate dehydrogenase  37.55 
 
 
388 aa  94.7  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.317719  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1162  prephenate dehydrogenase  34.55 
 
 
286 aa  93.6  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0125  prephenate dehydrogenase  27.72 
 
 
275 aa  93.2  5e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1058  Prephenate dehydrogenase  29.28 
 
 
281 aa  93.2  6e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4139  prephenate dehydrogenase  34.3 
 
 
348 aa  92.8  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.343894  normal  0.0588335 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0216  prephenate dehydrogenase  21.43 
 
 
275 aa  91.7  1e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00047126  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0968  Prephenate dehydrogenase  38.49 
 
 
331 aa  89  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1175  Prephenate dehydrogenase  32.56 
 
 
369 aa  87.4  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.349516 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36910  prephenate dehydrogenase  35.67 
 
 
322 aa  87  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0782999 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2794  prephenate dehydrogenase  30.86 
 
 
292 aa  86.7  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146158 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0175  prephenate dehydrogenase  31.2 
 
 
297 aa  86.7  6e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1040  prephenate dehydrogenase  34.69 
 
 
370 aa  86.3  7e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0214321 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0576  prephenate dehydrogenase  29.44 
 
 
253 aa  85.9  9e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00152184  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0591  prephenate dehydrogenase  29.44 
 
 
253 aa  85.9  9e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.366481  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1009  Prephenate dehydrogenase  29.8 
 
 
364 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000207637 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1791  prephenate dehydrogenase  29.69 
 
 
292 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108335 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2165  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.28 
 
 
750 aa  84.7  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.166945  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1248  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  29.45 
 
 
770 aa  84.3  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.757925  normal  0.0192474 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2023  prephenate dehydrogenase  32.26 
 
 
328 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000998915 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1685  prephenate dehydrogenase  24.29 
 
 
276 aa  84  0.000000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.138002  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1150  Prephenate dehydrogenase  32.16 
 
 
367 aa  83.6  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0725  prephenate dehydrogenase  34 
 
 
339 aa  83.2  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0130127  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1927  Prephenate dehydrogenase  37.15 
 
 
369 aa  83.2  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.127558  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1613  Prephenate dehydrogenase  31.76 
 
 
360 aa  82.8  0.000000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0483  prephenate dehydrogenase  38.78 
 
 
361 aa  82.4  0.00000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1455  prephenate dehydrogenase  25.76 
 
 
363 aa  82.4  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1426  prephenate dehydrogenase  25.76 
 
 
363 aa  82.4  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0249  prephenate dehydrogenase  34.66 
 
 
354 aa  82  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.524671  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0168  prephenate dehydrogenase  36.6 
 
 
318 aa  82  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.538726  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2998  Prephenate dehydrogenase-like protein  36.49 
 
 
357 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.753078  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3757  prephenate dehydrogenase  35.31 
 
 
361 aa  81.6  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.673917  normal  0.511297 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1495  prephenate dehydrogenase  36.96 
 
 
363 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.970852  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1150  prephenate dehydrogenase  28.04 
 
 
299 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0141038  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0230  Prephenate dehydrogenase  24.26 
 
 
275 aa  81.3  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1568  prephenate dehydrogenase  28.96 
 
 
290 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.513698  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1803  Prephenate dehydrogenase  31.06 
 
 
373 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.411636  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0692  prephenate dehydrogenase  26.67 
 
 
368 aa  81.3  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1426  prephenate dehydrogenase  24.71 
 
 
280 aa  80.9  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000102552  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1163  prephenate dehydrogenase  23.66 
 
 
283 aa  80.9  0.00000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1429  prephenate dehydrogenase  29.04 
 
 
279 aa  80.5  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.394252  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4079  prephenate dehydrogenase  31.33 
 
 
330 aa  80.5  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2225  prephenate dehydrogenase  24.34 
 
 
276 aa  80.1  0.00000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000370984  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0106  Prephenate dehydrogenase  30.14 
 
 
290 aa  79.7  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2748  prephenate dehydrogenase  29.18 
 
 
369 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2136  prephenate dehydrogenase  25.95 
 
 
367 aa  79.3  0.00000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.535624  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0863  prephenate dehydrogenase  29.64 
 
 
286 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1796  prephenate dehydrogenase  23.74 
 
 
365 aa  79  0.00000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3872  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.48 
 
 
307 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.0868763 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2995  prephenate dehydrogenase  27.91 
 
 
378 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15809  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1184  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  27.37 
 
 
778 aa  79  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.372461 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0308  Prephenate dehydrogenase  36.92 
 
 
325 aa  78.6  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3118  prephenate dehydrogenase  34.98 
 
 
370 aa  78.6  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.724958  hitchhiker  0.00209537 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0943  prephenate dehydrogenase  25.22 
 
 
276 aa  79  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000180721  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3122  prephenate dehydrogenase  29.12 
 
 
300 aa  78.6  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0305088 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1416  prephenate dehydrogenase  31.9 
 
 
290 aa  77.8  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0973759  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1208  prephenate dehydrogenase  35.94 
 
 
355 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86807  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0423  Prephenate dehydrogenase  21.54 
 
 
287 aa  77.8  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00223859  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1665  Prephenate dehydrogenase  33.58 
 
 
281 aa  77.8  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000668166  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0483  prephenate dehydrogenase  28.63 
 
 
367 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1182  prephenate dehydrogenase  31.97 
 
 
364 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1206  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  27.74 
 
 
780 aa  78.6  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.610993 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1393  Prephenate dehydrogenase  29.89 
 
 
294 aa  78.2  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0627077  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1852  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.3 
 
 
746 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0962  prephenate dehydrogenase  27.56 
 
 
293 aa  76.6  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0308  arogenate dehydrogenase  27.95 
 
 
320 aa  76.6  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.582436  normal  0.172957 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1455  prephenate dehydrogenase  33.2 
 
 
370 aa  76.6  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00804434 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1203  prephenate dehydrogenase  23.75 
 
 
280 aa  76.6  0.0000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1500  prephenate dehydrogenase  22.51 
 
 
276 aa  76.6  0.0000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2467  prephenate dehydrogenase  29.43 
 
 
294 aa  76.6  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.200219 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3803  Prephenate dehydrogenase  31.5 
 
 
322 aa  76.6  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000296114  normal  0.352645 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1535  prephenate dehydrogenase  30.48 
 
 
369 aa  76.6  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000209792 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1333  prephenate dehydrogenase  33.01 
 
 
375 aa  76.6  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000339582  normal  0.134491 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0936  prephenate dehydrogenase  24.9 
 
 
362 aa  76.3  0.0000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1334  Prephenate dehydrogenase  30.22 
 
 
292 aa  76.3  0.0000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.530233  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3001  prephenate dehydrogenase  27.52 
 
 
366 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1620  Prephenate dehydrogenase  23.7 
 
 
270 aa  76.3  0.0000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.908357  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  30.43 
 
 
290 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2695  prephenate dehydrogenase  27.91 
 
 
366 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06830  prephenate dehydrogenase  26.44 
 
 
379 aa  76.3  0.0000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.397178 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0566  prephenate dehydrogenase  30.53 
 
 
291 aa  75.9  0.0000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1886  cyclohexadienyl/prephenate dehydrogenase  30.29 
 
 
288 aa  75.5  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000040742  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0978  Prephenate dehydrogenase  36.71 
 
 
387 aa  75.5  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1535  prephenate dehydrogenase  31.29 
 
 
369 aa  75.1  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0206592  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2500  prephenate dehydrogenase  31.4 
 
 
361 aa  75.5  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2283  prephenate dehydrogenase  27.48 
 
 
366 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000918278 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2745  prephenate dehydrogenase  27.52 
 
 
366 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1234  prephenate dehydrogenase  29 
 
 
289 aa  74.7  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3579  cyclohexadienyl dehydrogenase  30.86 
 
 
308 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0900  prephenate dehydrogenase  33.73 
 
 
301 aa  74.7  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1022  Prephenate dehydrogenase  33.73 
 
 
291 aa  74.7  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.108849  unclonable  0.0000000000327113 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2954  prephenate dehydrogenase  27.52 
 
 
378 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.140403  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2954  prephenate dehydrogenase  27.52 
 
 
366 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0651000000000002e-25 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2103  Prephenate dehydrogenase  33.07 
 
 
360 aa  74.7  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2957  prephenate dehydrogenase  27.13 
 
 
366 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2242  prephenate dehydrogenase  29.84 
 
 
294 aa  74.3  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>