More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_4358 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_4358  protein translocase subunit yidC  100 
 
 		 545 aa  1100    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4495  60 kDa inner membrane insertion protein  92.31 
 
 		 546 aa  952    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.605789  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4506  60 kDa inner membrane insertion protein  66.61 
 
 		 549 aa  701    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.417541  normal  0.699877 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4514  YidC translocase/secretase  95.24 
 
 		 546 aa  951    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4149  60 kDa inner membrane insertion protein  35.66 
 
 		 536 aa  288  2e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  32.38 
 
 		 542 aa  270  7e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4429  60 kDa inner membrane insertion protein  33.52 
 
 		 528 aa  259  6e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3087  60 kDa inner membrane insertion protein  38.93 
 
 		 545 aa  258  2e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.863197  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4059  60 kDa inner membrane insertion protein  34.23 
 
 		 537 aa  253  6e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.082021  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  34.14 
 
 		 556 aa  253  7e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3623  60 kDa inner membrane insertion protein  33.45 
 
 		 542 aa  253  8.000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3642  60 kDa inner membrane insertion protein  31.99 
 
 		 530 aa  252  1e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0951488  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6897  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  33.56 
 
 		 672 aa  251  2e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0033  60 kDa inner membrane insertion protein  33.82 
 
 		 528 aa  250  6e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.401707 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0032  inner membrane protein, 60 kDa  33.82 
 
 		 528 aa  250  6e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.98 
 
 		 575 aa  249  1e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  31.66 
 
 		 547 aa  247  4e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4257  60 kDa inner membrane insertion protein  33.16 
 
 		 545 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000606394  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1393  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  30.15 
 
 		 532 aa  245  9.999999999999999e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3866  60 kDa inner membrane insertion protein  33.21 
 
 		 542 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000155519  unclonable  0.00000398144 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2394  protein translocase subunit yidC  32.55 
 
 		 536 aa  242  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000698908  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.4 
 
 		 541 aa  241  2e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4485  60 kDa inner membrane insertion protein  39.25 
 
 		 551 aa  241  2.9999999999999997e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00386094  hitchhiker  0.00000000260158 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5444  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.99 
 
 		 560 aa  240  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4014  protein translocase subunit yidC  32.11 
 
 		 557 aa  240  5.999999999999999e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2600  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  32.2 
 
 		 567 aa  239  1e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.417089 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3466  hypothetical protein  33.39 
 
 		 531 aa  238  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4063  60 kDa inner membrane insertion protein  31.83 
 
 		 542 aa  238  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000239208  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0006  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.67 
 
 		 560 aa  238  3e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1967  YidC translocase/secretase  32.73 
 
 		 548 aa  238  3e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.537012  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.67 
 
 		 560 aa  238  3e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.53 
 
 		 560 aa  238  3e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4002  60 kDa inner membrane insertion protein  32.44 
 
 		 541 aa  237  4e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000355464  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3561  protein translocase subunit yidC  33.45 
 
 		 536 aa  237  4e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4521  60 kDa inner membrane insertion protein  32.69 
 
 		 541 aa  237  4e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000305334  hitchhiker  0.000938862 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  34.46 
 
 		 539 aa  237  5.0000000000000005e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4325  YidC translocase/secretase  32.69 
 
 		 541 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000679014  unclonable  0.00000000000486692 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4380  60 kDa inner membrane insertion protein  32.69 
 
 		 541 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000064378  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4379  60 kDa inner membrane insertion protein  32.69 
 
 		 541 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000322788  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3099  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.86 
 
 		 554 aa  236  6e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.0227553 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.03 
 
 		 517 aa  236  6e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3215  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.86 
 
 		 554 aa  236  6e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15042  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4032  protein translocase subunit yidC  32.45 
 
 		 541 aa  236  8e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000158142  hitchhiker  0.000218645 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0004  inner membrane protein, 60 kDa  31.86 
 
 		 541 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  35.19 
 
 		 553 aa  235  1.0000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002016  OxaI/YidC membrane insertion protein  31.1 
 
 		 540 aa  234  3e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000829805  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3940  protein translocase subunit yidC  32.45 
 
 		 541 aa  234  3e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000301662  unclonable  0.0000000000640431 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0006  protein translocase subunit yidC  32.98 
 
 		 541 aa  234  3e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101193  unclonable  0.0000000000873101 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6369  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.84 
 
 		 578 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3157  60 kDa inner membrane insertion protein  33.03 
 
 		 534 aa  233  6e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.199862  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5612  inner membrane protein, 60 kDa  40.89 
 
 		 562 aa  233  6e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5134  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.03 
 
 		 563 aa  233  6e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.51 
 
 		 581 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.69 
 
 		 541 aa  233  8.000000000000001e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0002  60 kDa inner membrane insertion protein  41.27 
 
 		 544 aa  232  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000135714  unclonable  0.000000000155498 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2882  protein translocase subunit yidC  41.2 
 
 		 562 aa  232  1e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.208936  normal  0.460711 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0009  inner membrane protein, 60 kDa  31.79 
 
 		 541 aa  232  1e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000942032  hitchhiker  0.000799802 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00436  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.25 
 
 		 540 aa  231  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73410  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.51 
 
 		 578 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.431479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2139  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  29.62 
 
 		 550 aa  231  2e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2331  60 kDa inner membrane insertion protein  42.62 
 
 		 552 aa  231  3e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0553  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.73 
 
 		 531 aa  231  3e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4466  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.51 
 
 		 552 aa  229  9e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2144  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.37 
 
 		 565 aa  229  1e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00651842  unclonable  0.00000165557 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.94 
 
 		 557 aa  229  1e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.32 
 
 		 567 aa  228  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2758  protein translocase subunit yidC  30.38 
 
 		 552 aa  228  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.174551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3154  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.91 
 
 		 553 aa  228  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000638548 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3098  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.23 
 
 		 550 aa  227  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113724 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5743  putative inner membrane protein translocase component YidC  40.51 
 
 		 560 aa  226  9e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00528765  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3550  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.2 
 
 		 558 aa  226  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2844  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.2 
 
 		 558 aa  226  1e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5050  inner membrane protein, 60 kDa  34.04 
 
 		 543 aa  225  1e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3986  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.7 
 
 		 552 aa  225  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3397  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.2 
 
 		 558 aa  226  1e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4929  60 kDa inner membrane insertion protein  41.48 
 
 		 544 aa  226  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000771873  unclonable  0.00000001353 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2411  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family domain containing  30.32 
 
 		 570 aa  225  1e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.705473  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2241  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.2 
 
 		 558 aa  226  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4220  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.6 
 
 		 548 aa  224  2e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.118855  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0028  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.65 
 
 		 545 aa  225  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.15409  normal  0.0935166 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3775  60 kDa inner membrane insertion protein  30.84 
 
 		 541 aa  225  2e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000106175  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03589  inner membrane protein translocase component YidC  36.6 
 
 		 548 aa  224  3e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4261  YidC translocase/secretase  36.6 
 
 		 548 aa  224  3e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0107  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.95 
 
 		 558 aa  224  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0304  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.95 
 
 		 558 aa  224  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3181  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.36 
 
 		 553 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118061 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6520  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.92 
 
 		 555 aa  224  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4289  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.6 
 
 		 548 aa  224  3e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0759973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0093  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.95 
 
 		 558 aa  224  3e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4215  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.6 
 
 		 548 aa  224  3e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5135  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.6 
 
 		 548 aa  224  3e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00207092  normal  0.0616185 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4072  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.6 
 
 		 548 aa  224  3e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.131417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3919  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.6 
 
 		 548 aa  224  3e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00313921  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2549  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.13 
 
 		 552 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03533  hypothetical protein  36.6 
 
 		 548 aa  224  3e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.534027  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3163  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.13 
 
 		 552 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133827  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2473  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.16 
 
 		 564 aa  224  4e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000743267 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3074  hypothetical protein  33.5 
 
 		 556 aa  223  7e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2930  hypothetical protein  33.5 
 
 		 556 aa  222  9.999999999999999e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1917  60 kDa inner membrane insertion protein  31.61 
 
 		 534 aa  223  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0379054  normal  0.178209 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>