More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0632 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0632  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 
177 aa  342  1e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.263263  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1410  lipoprotein signal peptidase  54.97 
 
 
174 aa  138  3.9999999999999997e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4860  lipoprotein signal peptidase  48.67 
 
 
164 aa  134  9e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.777227  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1007  lipoprotein signal peptidase  44.85 
 
 
167 aa  129  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2326  lipoprotein signal peptidase  51.43 
 
 
171 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231394  normal  0.6435 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2281  lipoprotein signal peptidase  49.67 
 
 
171 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4181  lipoprotein signal peptidase  46.36 
 
 
165 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.797741  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4037  lipoprotein signal peptidase  45.7 
 
 
165 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2603  lipoprotein signal peptidase  50.71 
 
 
171 aa  124  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.172447 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3163  lipoprotein signal peptidase  45.27 
 
 
164 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2861  lipoprotein signal peptidase  43.97 
 
 
171 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0978018 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2543  lipoprotein signal peptidase  44.6 
 
 
165 aa  111  5e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3203  lipoprotein signal peptidase  42 
 
 
154 aa  108  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4058  lipoprotein signal peptidase  44.22 
 
 
169 aa  107  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113935  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0288  lipoprotein signal peptidase  41.5 
 
 
184 aa  107  9.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.869766 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1799  lipoprotein signal peptidase  44.16 
 
 
171 aa  106  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.408205  normal  0.0603455 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0392  lipoprotein signal peptidase  44.37 
 
 
165 aa  104  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.034269  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2219  lipoprotein signal peptidase  45.7 
 
 
165 aa  102  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.031599 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  41.26 
 
 
154 aa  100  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  41.25 
 
 
160 aa  98.2  6e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4211  lipoprotein signal peptidase  41.18 
 
 
174 aa  97.4  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1715  lipoprotein signal peptidase  49.29 
 
 
165 aa  95.9  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.488769  normal  0.154369 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  41.67 
 
 
168 aa  95.5  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  42.86 
 
 
170 aa  95.1  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  41.55 
 
 
170 aa  93.6  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1000  lipoprotein signal peptidase  37.58 
 
 
154 aa  93.6  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0969  lipoprotein signal peptidase  37.58 
 
 
154 aa  93.6  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  40.69 
 
 
170 aa  93.6  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  42.25 
 
 
170 aa  93.6  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  42.25 
 
 
170 aa  93.6  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  42.25 
 
 
170 aa  93.6  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2762  lipoprotein signal peptidase  40.24 
 
 
185 aa  92.8  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.145338  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  35.98 
 
 
176 aa  92.4  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  38.62 
 
 
176 aa  92  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4414  signal peptidase II  45.54 
 
 
123 aa  91.7  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849735  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0359  lipoprotein signal peptidase  42.18 
 
 
158 aa  91.3  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  37.67 
 
 
168 aa  91.3  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1099  lipoprotein signal peptidase  41.1 
 
 
185 aa  90.1  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0915  signal peptidase II  37.41 
 
 
184 aa  90.5  1e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.00000000140419  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0614  lipoprotein signal peptidase  40.11 
 
 
199 aa  90.1  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.107984 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3614  lipoprotein signal peptidase  42.25 
 
 
157 aa  89.7  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.463393  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  40.24 
 
 
169 aa  89.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  40.41 
 
 
171 aa  90.1  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3952  lipoprotein signal peptidase  42.25 
 
 
157 aa  89.7  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.386002  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3652  lipoprotein signal peptidase  41.1 
 
 
170 aa  89.4  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3845  lipoprotein signal peptidase  39.73 
 
 
170 aa  89  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2206  lipoprotein signal peptidase  40.82 
 
 
177 aa  89  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.252335  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  37.75 
 
 
182 aa  89  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1394  lipoprotein signal peptidase  42.34 
 
 
190 aa  88.6  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.660722  normal  0.96884 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3783  lipoprotein signal peptidase  37.91 
 
 
172 aa  87.8  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.800649  normal  0.222823 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  39.73 
 
 
171 aa  87.8  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  39.73 
 
 
171 aa  87.8  8e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  39.73 
 
 
171 aa  87.8  8e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  34.36 
 
 
180 aa  87.4  9e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  34.57 
 
 
170 aa  87  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  37.27 
 
 
170 aa  87  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  37.41 
 
 
164 aa  87  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1671  lipoprotein signal peptidase  36.99 
 
 
165 aa  86.3  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  33.12 
 
 
172 aa  86.3  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0509  lipoprotein signal peptidase  36.99 
 
 
163 aa  86.3  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2929  lipoprotein signal peptidase  43.31 
 
 
186 aa  86.3  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0877107  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  38.22 
 
 
202 aa  86.3  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  39.04 
 
 
171 aa  86.3  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  36.88 
 
 
160 aa  86.7  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0092  lipoprotein signal peptidase  38.97 
 
 
160 aa  85.5  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.142417  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2717  lipoprotein signal peptidase  36.14 
 
 
227 aa  85.1  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.702732 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  42.95 
 
 
157 aa  85.5  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  37.09 
 
 
158 aa  85.1  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  35.92 
 
 
161 aa  84.3  7e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  37.41 
 
 
162 aa  84.3  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1257  lipoprotein signal peptidase  35.17 
 
 
160 aa  84.3  8e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  33.12 
 
 
173 aa  84.3  8e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  37.82 
 
 
163 aa  84.3  9e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4439  signal peptidase II  38.22 
 
 
165 aa  83.6  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0699  lipoprotein signal peptidase  39.13 
 
 
169 aa  83.6  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.390058  normal  0.0603607 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  36.67 
 
 
145 aa  82.8  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1577  lipoprotein signal peptidase  38.95 
 
 
167 aa  82.8  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1520  lipoprotein signal peptidase  38.95 
 
 
167 aa  82.8  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0161435  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  38.36 
 
 
155 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05536  lipoprotein signal peptidase  39.22 
 
 
166 aa  82.4  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192233  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2146  lipoprotein signal peptidase  40.38 
 
 
167 aa  82  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.669133  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  38.1 
 
 
157 aa  82  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  40.28 
 
 
166 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  40.28 
 
 
166 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  40.28 
 
 
166 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  40.28 
 
 
166 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  39.16 
 
 
166 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  40.28 
 
 
166 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  40.28 
 
 
166 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  40.28 
 
 
166 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0026  lipoprotein signal peptidase  33.94 
 
 
165 aa  81.3  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138167 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0487  lipoprotein signal peptidase  36.08 
 
 
178 aa  81.3  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  36.42 
 
 
235 aa  81.3  0.000000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2364  lipoprotein signal peptidase  37.58 
 
 
158 aa  80.9  0.000000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2818  signal peptidase II  39.73 
 
 
160 aa  80.9  0.000000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  33.55 
 
 
164 aa  80.9  0.000000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  36.3 
 
 
169 aa  80.5  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  36.3 
 
 
169 aa  80.5  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0480  lipoprotein signal peptidase  39.74 
 
 
159 aa  80.1  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  37.16 
 
 
182 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>