More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0458 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0458  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 299 aa  586  1e-166  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3638  DeoR-family regulatory protein  39.01 
 
 		 271 aa  112  7.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0131254  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3184  DeoR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 269 aa  87  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.395611 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3420  regulatory protein, DeoR  31.72 
 
 		 439 aa  77.8  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.382426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03885  transcriptional regulator, DeoR family protein  30.06 
 
 		 269 aa  75.5  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.81593  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1449  DeoR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 271 aa  72.4  0.000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  26.17 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0940  putative DEOR-type transcriptional regulator  27.35 
 
 		 275 aa  70.1  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000268196  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2385  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  27.57 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  27.1 
 
 		 269 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  25.7 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  25.7 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  25.7 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1728  lactose transport regulator  28.37 
 
 		 252 aa  69.3  0.00000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  25.7 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  25.7 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  25.7 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3611  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  25.7 
 
 		 269 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3258  DeoR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000943791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3574  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  21.93 
 
 		 257 aa  65.9  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1644  DeoR family transcriptional regulator  25 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2802  DeoR family transcriptional regulator  21.3 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.364979  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1287  transcriptional regulator, DeoR family  25.35 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3270  DeoR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0656  DeoR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 284 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.936277  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2894  transcriptional regulator, DeoR family  27.75 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0151849 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3898  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  27.63 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3804  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  27.63 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3702  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  27.63 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.141419 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3620  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  27.63 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4730  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  27.63 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0291  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  27.63 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03274  DNA-binding transcriptional repressor  27.63 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324101  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03226  hypothetical protein  27.63 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.347967  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2227  DeoR family transcriptional regulator  21.72 
 
 		 263 aa  62.4  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2266  lactose phosphotransferase system repressor  21.72 
 
 		 263 aa  62.4  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45150  putative transcriptional regulator  27.82 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2691  DeoR family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 254 aa  62  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134445  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0324  transcriptional regulator, DeoR family  26.85 
 
 		 254 aa  61.6  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.479336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2991  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  24.31 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  28.77 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0268  DeoR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3170  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  24.31 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000701  putative regulatory protein  28 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.456965  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06583  hypothetical protein  28.86 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02557  DNA-bindng transcriptional repressor  24.31 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.632125  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0982  transcriptional regulator, DeoR family  24.31 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015396  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0326  DeoR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.281127  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2830  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  24.31 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000942539 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00243  Glycerol-3-phosphate regulon repressor  25.62 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02522  hypothetical protein  24.31 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.810713  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1005  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  24.31 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0173868  hitchhiker  0.000000410448 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2843  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  24.31 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0995  DeoR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.775359  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  33.59 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3377  DeoR-family regulatory protein  33.59 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.365901 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3957  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  24.31 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0291  transcriptional regulator, DeoR family  27.19 
 
 		 252 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3929  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  28.23 
 
 		 252 aa  58.5  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5727  DeoR family transcriptional regulator  30 
 
 		 258 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4122  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  28.23 
 
 		 252 aa  58.5  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0231  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  28.23 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2823  putative glucitol operon repressor  26.52 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5596  transcriptional regulator, DeoR family  29.61 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3264  DeoR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3397  DeoR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3880  DeoR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.46923  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7919  transcriptional regulator, DeoR family  34.71 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0344  transcriptional regulator, DeoR family  23.11 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273291  hitchhiker  0.00282371 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1716  transcriptional regulator, DeoR family  24.51 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.467325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3757  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  26.64 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3831  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  26.75 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.852277 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3893  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  26.75 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.256044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001644  transcriptional regulator of GlmS, DeoR family  28.49 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00296274  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3715  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  26.75 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3790  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  26.75 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3997  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  26.64 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3724  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  26.75 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0157  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  26.64 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  30.23 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0191  glycerol-3-phosphate regulon repressor  26.27 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.276628  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2155  transcriptional regulator, DeoR family  26.72 
 
 		 278 aa  57  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0313  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  27.75 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4893  DeoR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 256 aa  57  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.239282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00830  transcriptional regulator  27.33 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4235  DeoR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00275113  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4361  DeoR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.14783  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4503  DeoR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.259499  normal  0.116271 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3952  DeoR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00923928  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1790  transcriptional regulator, DeoR family  30.58 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.676123  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4362  DeoR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0187642  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4306  transcriptional regulator, DeoR family  27.62 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000121893 
 
 
-
 
NC_004310  BR0199  glycerol-3-phosphate transcriptional regulator  26.27 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.464707  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3640  DeoR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000875661  normal  0.0587725 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4041  transcriptional regulator, DeoR family protein  27.47 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.112055  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4742  DeoR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4640  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  26.2 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3921  DeoR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 260 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.230254  normal  0.0231627 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>