101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0138 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0138  import inner membrane translocase, subunit Tim44  100 
 
 		 221 aa  434  1e-121  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0288  import inner membrane translocase subunit Tim44  53.07 
 
 		 226 aa  194  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3608  hypothetical protein  38.39 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.765658  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0107  hypothetical protein  36.77 
 
 		 234 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1681  import inner membrane translocase subunit Tim44  35.68 
 
 		 242 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1142  import inner membrane translocase subunit Tim44  37.87 
 
 		 239 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00140401 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1374  import inner membrane translocase subunit Tim44  34.58 
 
 		 238 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.314839  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0117  import inner membrane translocase, subunit Tim44  35.87 
 
 		 234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0729784  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2016  import inner membrane translocase, subunit Tim44  37.33 
 
 		 221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00392424 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1560  import inner membrane translocase subunit Tim44  35.68 
 
 		 239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.69866 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3713  import inner membrane translocase subunit Tim44  35.17 
 
 		 237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.500571 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1839  import inner membrane translocase subunit Tim44  35.68 
 
 		 239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.661091  normal  0.32542 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0299  import inner membrane translocase, subunit Tim44  37.05 
 
 		 233 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3216  import inner membrane translocase subunit Tim44  35.84 
 
 		 234 aa  128  6e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0305  import inner membrane translocase subunit Tim44  34.78 
 
 		 235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3111  import inner membrane translocase subunit Tim44  34.16 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.915706  normal  0.806338 
 
 
-
 
NC_004310  BR2074  hypothetical protein  36.41 
 
 		 235 aa  124  8.000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0156  hypothetical protein  36.32 
 
 		 233 aa  124  8.000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0421  import inner membrane translocase, subunit Tim44  34.89 
 
 		 235 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3485  import inner membrane translocase, subunit Tim44  34.93 
 
 		 235 aa  123  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1994  hypothetical protein  35.94 
 
 		 231 aa  123  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.289958  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2900  import inner membrane translocase, subunit Tim44  37.16 
 
 		 219 aa  122  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.203769  normal  0.596808 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0400  import inner membrane translocase, subunit Tim44  33.62 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2676  import inner membrane translocase, subunit Tim44  36.57 
 
 		 219 aa  119  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.458481  normal  0.659475 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2048  import inner membrane translocase subunit Tim44  36.28 
 
 		 250 aa  119  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.476328  normal  0.72544 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1239  hypothetical protein  36.7 
 
 		 219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0998  import inner membrane translocase subunit Tim44  33.33 
 
 		 241 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0846  import inner membrane translocase subunit Tim44  35.19 
 
 		 231 aa  118  6e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.748239  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1248  import inner membrane translocase subunit Tim44  36.61 
 
 		 247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.99982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0009  Membrane associated transporter protein  36.16 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0584  import inner membrane translocase, subunit Tim44  37 
 
 		 247 aa  116  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0642637  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3942  import inner membrane translocase subunit Tim44  34.67 
 
 		 234 aa  115  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.851876  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0107  hypothetical protein  27.36 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.262774  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3830  import inner membrane translocase, subunit Tim44  37.91 
 
 		 226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.492338  normal  0.0940527 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4268  import inner membrane translocase subunit Tim44  34.22 
 
 		 234 aa  112  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.331754 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2855  import inner membrane translocase, subunit Tim44  30.41 
 
 		 218 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.37899  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0191  import inner membrane translocase, subunit Tim44  37.02 
 
 		 235 aa  106  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2786  import inner membrane translocase, subunit Tim44  35.35 
 
 		 218 aa  105  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.242011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1294  Tim44 domain-containing protein  30.22 
 
 		 230 aa  102  5e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.483295  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0778  membrane translocase, subunit Tim44  25.11 
 
 		 212 aa  99.4  4e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.132332  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2980  import inner membrane translocase, subunit Tim44  33.99 
 
 		 206 aa  97.8  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3445  import inner membrane translocase  35 
 
 		 221 aa  97.4  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0232  tim44-like domain-containing protein  23.29 
 
 		 212 aa  97.1  2e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.217806  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5038  import inner membrane translocase subunit Tim44  30.92 
 
 		 199 aa  82.8  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.356912 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0360  Tim44-like domain-containing protein  26.27 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1927  import inner membrane translocase, subunit Tim44  29.58 
 
 		 322 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000885618  normal  0.873638 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0482  import inner membrane translocase, subunit Tim44  30.28 
 
 		 331 aa  74.3  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1284  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.65 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.45671e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2938  import inner membrane translocase subunit Tim44  25.24 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000555932  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004023  hypothetical protein  23.47 
 
 		 290 aa  58.5  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000578853  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1256  hypothetical protein  29.91 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1091  putative lipoprotein  26.61 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000494647  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3250  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.91 
 
 		 321 aa  55.8  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3295  import inner membrane translocase, subunit Tim44  26.05 
 
 		 318 aa  54.7  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081668  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1601  import inner membrane translocase subunit Tim44  26.76 
 
 		 303 aa  54.7  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1550  hypothetical protein  22.9 
 
 		 291 aa  52.8  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0535221  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3566  import inner membrane translocase, subunit Tim44  26.17 
 
 		 317 aa  52  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000205074  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3119  hypothetical protein  25.68 
 
 		 295 aa  52  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.448764 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0785  import inner membrane translocase, subunit Tim44  28.37 
 
 		 314 aa  51.6  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0683467  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1010  import inner membrane translocase subunit Tim44  26.17 
 
 		 322 aa  51.6  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0375  import inner membrane translocase subunit Tim44  26.55 
 
 		 331 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01439  hypothetical protein  22.99 
 
 		 290 aa  49.3  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2780  hypothetical protein  36.47 
 
 		 273 aa  49.3  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.300996 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0334  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.1 
 
 		 321 aa  48.1  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  0.137155 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1896  import inner membrane translocase, subunit Tim44  30.51 
 
 		 303 aa  47.4  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0839059  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4001  import inner membrane translocase subunit Tim44  22.12 
 
 		 287 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4117  import inner membrane translocase subunit Tim44  22.12 
 
 		 287 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3925  import inner membrane translocase subunit Tim44  23.08 
 
 		 287 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3607  import inner membrane translocase, subunit Tim44  23.26 
 
 		 291 aa  46.6  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1858  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.8 
 
 		 333 aa  45.8  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.767036  normal  0.41098 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0187  hypothetical protein  28.38 
 
 		 323 aa  45.8  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2759  hypothetical protein  28.38 
 
 		 323 aa  45.8  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2319  hypothetical protein  28.38 
 
 		 323 aa  45.8  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2399  hypothetical protein  28.38 
 
 		 323 aa  45.8  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2135  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.82 
 
 		 216 aa  45.8  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4340  hypothetical protein  23.08 
 
 		 291 aa  45.4  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3047  import inner membrane translocase, subunit Tim44  25.45 
 
 		 272 aa  45.4  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5103  import inner membrane translocase subunit Tim44  26.26 
 
 		 316 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0303  import inner membrane translocase subunit Tim44  32.14 
 
 		 283 aa  45.4  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000256366  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0554  Tim44-like domain-contain protein  35.04 
 
 		 340 aa  45.1  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4024  import inner membrane translocase subunit Tim44  22.12 
 
 		 287 aa  45.1  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.149443  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4404  import inner membrane translocase subunit Tim44  25.93 
 
 		 337 aa  45.1  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.583271  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0432  import inner membrane translocase, subunit Tim44  28.3 
 
 		 327 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1788  import inner membrane translocase, subunit Tim44  23.33 
 
 		 341 aa  44.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000825798  normal  0.448103 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0845  transmembrane protein  33.33 
 
 		 323 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376855  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3268  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.87 
 
 		 325 aa  43.9  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0568  import inner membrane translocase subunit Tim44  24.89 
 
 		 340 aa  43.5  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0218  import inner membrane translocase subunit Tim44  35.66 
 
 		 294 aa  43.9  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2207  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.59 
 
 		 329 aa  43.9  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4035  import inner membrane translocase, subunit Tim44  28.76 
 
 		 288 aa  43.1  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0668  Tim44-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 324 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0990  import inner membrane translocase, subunit Tim44  25.23 
 
 		 295 aa  42.7  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5066  import inner membrane translocase, subunit Tim44  22.12 
 
 		 281 aa  42  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0901  import inner membrane translocase, subunit Tim44  24.5 
 
 		 314 aa  42  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000201824  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0684  Tim44-like domain-containing protein  32.81 
 
 		 323 aa  42  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1110  import inner membrane translocase subunit Tim44  25.98 
 
 		 298 aa  42  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.354142  normal  0.0303721 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0214  import inner membrane translocase, subunit Tim44  26.39 
 
 		 306 aa  41.6  0.009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.525387  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5490  hypothetical protein  26.96 
 
 		 325 aa  41.6  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5646  import inner membrane translocase, subunit Tim44  21.3 
 
 		 292 aa  41.6  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169336 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2065  import inner membrane translocase subunit Tim44  25.12 
 
 		 320 aa  41.6  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0100272 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>