82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3566 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_3566  import inner membrane translocase, subunit Tim44  100 
 
 
317 aa  648    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000205074  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0901  import inner membrane translocase, subunit Tim44  75.17 
 
 
314 aa  418  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000201824  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3295  import inner membrane translocase, subunit Tim44  70.72 
 
 
318 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081668  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1284  import inner membrane translocase subunit Tim44  63.04 
 
 
318 aa  348  5e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.45671e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2938  import inner membrane translocase subunit Tim44  61.8 
 
 
318 aa  330  1e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000555932  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0785  import inner membrane translocase, subunit Tim44  60.25 
 
 
314 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0683467  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1010  import inner membrane translocase subunit Tim44  56.23 
 
 
322 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3250  import inner membrane translocase subunit Tim44  65.55 
 
 
321 aa  282  5.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1091  putative lipoprotein  49.22 
 
 
321 aa  257  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000494647  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1927  import inner membrane translocase, subunit Tim44  48.62 
 
 
322 aa  218  1e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000885618  normal  0.873638 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1788  import inner membrane translocase, subunit Tim44  49.25 
 
 
341 aa  195  7e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000825798  normal  0.448103 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0482  import inner membrane translocase, subunit Tim44  32.63 
 
 
331 aa  97.1  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0544  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.99 
 
 
295 aa  95.5  9e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2280  import inner membrane translocase subunit Tim44  62.04 
 
 
134 aa  87.8  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000369229 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6540  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.4 
 
 
332 aa  82.8  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.398166  normal  0.199544 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4404  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.16 
 
 
337 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.583271  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2207  import inner membrane translocase subunit Tim44  33.88 
 
 
329 aa  79.7  0.00000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5490  hypothetical protein  36 
 
 
325 aa  78.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255501  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6128  import inner membrane translocase subunit Tim44  30.15 
 
 
331 aa  77.4  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.418522  normal  0.280335 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0311  import inner membrane translocase subunit Tim44  33.87 
 
 
320 aa  77  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.0470868 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2567  import inner membrane translocase, subunit Tim44  37.07 
 
 
312 aa  77  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1701  import inner membrane translocase, subunit Tim44  33.62 
 
 
331 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2165  hypothetical protein  29.35 
 
 
312 aa  74.3  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.810394 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3768  import inner membrane translocase, subunit Tim44  33.62 
 
 
338 aa  73.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5842  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.23 
 
 
318 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1240  hypothetical protein  33.05 
 
 
256 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0197113  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1269  hypothetical protein  30.08 
 
 
342 aa  70.1  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.753871  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0334  import inner membrane translocase subunit Tim44  33.05 
 
 
321 aa  69.3  0.00000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  0.137155 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2211  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.43 
 
 
318 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.895169  normal  0.192893 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1921  import inner membrane translocase subunit Tim44  30.08 
 
 
348 aa  68.6  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.464054  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2529  import inner membrane translocase subunit Tim44  26.47 
 
 
319 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2254  import inner membrane translocase subunit Tim44  26.47 
 
 
319 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.349216  normal  0.0696359 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5103  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.87 
 
 
316 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3590  hypothetical protein  25.35 
 
 
270 aa  62  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3268  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.52 
 
 
325 aa  62.4  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0214  import inner membrane translocase, subunit Tim44  23.19 
 
 
306 aa  61.2  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.525387  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2135  import inner membrane translocase subunit Tim44  26.49 
 
 
216 aa  60.1  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1858  import inner membrane translocase subunit Tim44  30.7 
 
 
333 aa  59.7  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.767036  normal  0.41098 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0554  Tim44-like domain-contain protein  25.58 
 
 
340 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5066  import inner membrane translocase, subunit Tim44  23.53 
 
 
281 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3713  import inner membrane translocase subunit Tim44  29.25 
 
 
237 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.500571 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0551  import inner membrane translocase subunit Tim44  32.76 
 
 
324 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0031829 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5517  hypothetical protein  24.9 
 
 
280 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0187  hypothetical protein  24.63 
 
 
323 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2399  hypothetical protein  24.63 
 
 
323 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0684  Tim44-like domain-containing protein  24.63 
 
 
323 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2319  hypothetical protein  24.63 
 
 
323 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2759  hypothetical protein  24.63 
 
 
323 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0845  transmembrane protein  24.63 
 
 
323 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376855  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6329  hypothetical protein  24 
 
 
281 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72930  hypothetical protein  22.55 
 
 
285 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2096  hypothetical protein  25.91 
 
 
318 aa  54.3  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0739383  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0668  Tim44-like domain-containing protein  24.56 
 
 
324 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1681  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.7 
 
 
242 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850912  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5646  import inner membrane translocase, subunit Tim44  22.77 
 
 
292 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0169336 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1256  hypothetical protein  27.14 
 
 
204 aa  52.4  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0773  hypothetical protein  24.72 
 
 
301 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1374  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.49 
 
 
238 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.314839  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1560  import inner membrane translocase subunit Tim44  26.53 
 
 
239 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.69866 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1839  import inner membrane translocase subunit Tim44  26.53 
 
 
239 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.661091  normal  0.32542 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2016  import inner membrane translocase, subunit Tim44  24.55 
 
 
221 aa  50.8  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00392424 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0305  import inner membrane translocase subunit Tim44  29.31 
 
 
235 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0138  import inner membrane translocase, subunit Tim44  26.17 
 
 
221 aa  50.8  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0538  import inner membrane translocase, subunit Tim44  24.77 
 
 
311 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0375  import inner membrane translocase subunit Tim44  26.44 
 
 
331 aa  50.1  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2731  import inner membrane translocase, subunit Tim44  24.65 
 
 
343 aa  49.7  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.767216  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2119  import inner membrane translocase, subunit Tim44  24.65 
 
 
343 aa  49.7  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434025  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2758  import inner membrane translocase subunit Tim44  24.65 
 
 
343 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.778073  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2074  hypothetical protein  24.67 
 
 
235 aa  48.1  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2065  import inner membrane translocase subunit Tim44  22.36 
 
 
320 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0100272 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0400  import inner membrane translocase, subunit Tim44  27.71 
 
 
235 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0990  import inner membrane translocase, subunit Tim44  25.54 
 
 
295 aa  47.8  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0998  import inner membrane translocase subunit Tim44  26.92 
 
 
241 aa  47  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3047  import inner membrane translocase, subunit Tim44  25 
 
 
272 aa  47  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00430  Tim44-like domain protein  25.61 
 
 
284 aa  46.6  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.924994  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3485  import inner membrane translocase, subunit Tim44  23.49 
 
 
235 aa  46.2  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1994  hypothetical protein  24 
 
 
231 aa  45.4  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.289958  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3111  import inner membrane translocase subunit Tim44  24.72 
 
 
260 aa  45.4  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.915706  normal  0.806338 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1601  import inner membrane translocase subunit Tim44  24.77 
 
 
303 aa  44.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2861  import inner membrane translocase subunit Tim44  24.4 
 
 
308 aa  43.5  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6058  putative transporter  23.85 
 
 
344 aa  42.7  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0421  import inner membrane translocase, subunit Tim44  25.9 
 
 
235 aa  42.4  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>