48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5038 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_5038  import inner membrane translocase subunit Tim44  100 
 
 
199 aa  389  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.356912 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0117  import inner membrane translocase, subunit Tim44  36.77 
 
 
234 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0729784  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0107  hypothetical protein  38.12 
 
 
234 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2048  import inner membrane translocase subunit Tim44  37.83 
 
 
250 aa  119  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.476328  normal  0.72544 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0400  import inner membrane translocase, subunit Tim44  35.27 
 
 
235 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1248  import inner membrane translocase subunit Tim44  48.06 
 
 
247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.99982  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0421  import inner membrane translocase, subunit Tim44  33.93 
 
 
235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3216  import inner membrane translocase subunit Tim44  33.78 
 
 
234 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0156  hypothetical protein  35.27 
 
 
233 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3942  import inner membrane translocase subunit Tim44  33.78 
 
 
234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.851876  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0299  import inner membrane translocase, subunit Tim44  36.04 
 
 
233 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1374  import inner membrane translocase subunit Tim44  34.23 
 
 
238 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.314839  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1239  hypothetical protein  32.23 
 
 
219 aa  108  5e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4268  import inner membrane translocase subunit Tim44  33.78 
 
 
234 aa  108  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.331754 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3485  import inner membrane translocase, subunit Tim44  34.78 
 
 
235 aa  107  8.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2900  import inner membrane translocase, subunit Tim44  32.23 
 
 
219 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.203769  normal  0.596808 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2676  import inner membrane translocase, subunit Tim44  31.75 
 
 
219 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.458481  normal  0.659475 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0305  import inner membrane translocase subunit Tim44  31.7 
 
 
235 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0009  Membrane associated transporter protein  34.84 
 
 
232 aa  105  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0846  import inner membrane translocase subunit Tim44  34.74 
 
 
231 aa  105  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.748239  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0584  import inner membrane translocase, subunit Tim44  35.17 
 
 
247 aa  104  8e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0642637  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2074  hypothetical protein  35.68 
 
 
235 aa  103  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1560  import inner membrane translocase subunit Tim44  31.72 
 
 
239 aa  102  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.69866 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1839  import inner membrane translocase subunit Tim44  31.72 
 
 
239 aa  102  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.661091  normal  0.32542 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3713  import inner membrane translocase subunit Tim44  33.78 
 
 
237 aa  102  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.500571 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1994  hypothetical protein  35.21 
 
 
231 aa  100  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.289958  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1681  import inner membrane translocase subunit Tim44  31.3 
 
 
242 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850912  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3608  hypothetical protein  33.17 
 
 
219 aa  99.8  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.765658  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2016  import inner membrane translocase, subunit Tim44  33.96 
 
 
221 aa  99  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00392424 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0998  import inner membrane translocase subunit Tim44  33.19 
 
 
241 aa  98.6  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3830  import inner membrane translocase, subunit Tim44  30.73 
 
 
226 aa  96.3  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.492338  normal  0.0940527 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1142  import inner membrane translocase subunit Tim44  31.7 
 
 
239 aa  94.7  8e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00140401 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3111  import inner membrane translocase subunit Tim44  32.07 
 
 
260 aa  93.6  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.915706  normal  0.806338 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0191  import inner membrane translocase, subunit Tim44  33.17 
 
 
235 aa  93.2  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2786  import inner membrane translocase, subunit Tim44  33.02 
 
 
218 aa  91.7  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.242011  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2855  import inner membrane translocase, subunit Tim44  28.37 
 
 
218 aa  90.9  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.37899  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2980  import inner membrane translocase, subunit Tim44  35.5 
 
 
206 aa  90.9  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0107  hypothetical protein  26.42 
 
 
216 aa  89.7  2e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.262774  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0138  import inner membrane translocase, subunit Tim44  32.85 
 
 
221 aa  89.7  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0778  membrane translocase, subunit Tim44  24.76 
 
 
212 aa  88.6  6e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.132332  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1294  Tim44 domain-containing protein  27.65 
 
 
230 aa  85.5  5e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.483295  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0232  tim44-like domain-containing protein  25.24 
 
 
212 aa  84  0.000000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.217806  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0288  import inner membrane translocase subunit Tim44  34.16 
 
 
226 aa  79.3  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3445  import inner membrane translocase  30.09 
 
 
221 aa  79.3  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0360  Tim44-like domain-containing protein  27.67 
 
 
208 aa  65.1  0.0000000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0482  import inner membrane translocase, subunit Tim44  26.44 
 
 
331 aa  55.8  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1550  hypothetical protein  24.39 
 
 
291 aa  48.1  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0535221  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1256  hypothetical protein  28.43 
 
 
204 aa  46.6  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>