70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3608 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3608  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  442  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.765658  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3485  import inner membrane translocase, subunit Tim44  42.98 
 
 		 235 aa  175  5e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1994  hypothetical protein  41.82 
 
 		 231 aa  164  9e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.289958  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0846  import inner membrane translocase subunit Tim44  41.82 
 
 		 231 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.748239  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2074  hypothetical protein  41.82 
 
 		 235 aa  162  3e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0305  import inner membrane translocase subunit Tim44  39.48 
 
 		 235 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0299  import inner membrane translocase, subunit Tim44  40.69 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0156  hypothetical protein  40 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0421  import inner membrane translocase, subunit Tim44  39.91 
 
 		 235 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0009  Membrane associated transporter protein  40.72 
 
 		 232 aa  156  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0117  import inner membrane translocase, subunit Tim44  38.36 
 
 		 234 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0729784  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0400  import inner membrane translocase, subunit Tim44  39.74 
 
 		 235 aa  154  9e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0107  hypothetical protein  39.83 
 
 		 234 aa  154  9e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3216  import inner membrane translocase subunit Tim44  41.05 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2048  import inner membrane translocase subunit Tim44  38.7 
 
 		 250 aa  153  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.476328  normal  0.72544 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3942  import inner membrane translocase subunit Tim44  38.33 
 
 		 234 aa  153  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.851876  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4268  import inner membrane translocase subunit Tim44  37.89 
 
 		 234 aa  151  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.331754 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3713  import inner membrane translocase subunit Tim44  39.08 
 
 		 237 aa  150  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.500571 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1560  import inner membrane translocase subunit Tim44  37.76 
 
 		 239 aa  149  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.69866 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1839  import inner membrane translocase subunit Tim44  37.76 
 
 		 239 aa  149  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.661091  normal  0.32542 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0998  import inner membrane translocase subunit Tim44  37.66 
 
 		 241 aa  148  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1374  import inner membrane translocase subunit Tim44  36.29 
 
 		 238 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.314839  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1681  import inner membrane translocase subunit Tim44  36.78 
 
 		 242 aa  145  6e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1248  import inner membrane translocase subunit Tim44  39.11 
 
 		 247 aa  144  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.99982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1142  import inner membrane translocase subunit Tim44  36.52 
 
 		 239 aa  143  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00140401 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1294  Tim44 domain-containing protein  34.96 
 
 		 230 aa  143  2e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.483295  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2676  import inner membrane translocase, subunit Tim44  35.91 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.458481  normal  0.659475 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0138  import inner membrane translocase, subunit Tim44  38.39 
 
 		 221 aa  137  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1239  hypothetical protein  35.85 
 
 		 219 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3111  import inner membrane translocase subunit Tim44  35.42 
 
 		 260 aa  135  4e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.915706  normal  0.806338 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2900  import inner membrane translocase, subunit Tim44  35.85 
 
 		 219 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.203769  normal  0.596808 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2855  import inner membrane translocase, subunit Tim44  34.55 
 
 		 218 aa  125  7e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.37899  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0584  import inner membrane translocase, subunit Tim44  36.49 
 
 		 247 aa  124  9e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0642637  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2016  import inner membrane translocase, subunit Tim44  36.36 
 
 		 221 aa  123  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00392424 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0778  membrane translocase, subunit Tim44  29.17 
 
 		 212 aa  122  6e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.132332  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3830  import inner membrane translocase, subunit Tim44  37.26 
 
 		 226 aa  120  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.492338  normal  0.0940527 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2980  import inner membrane translocase, subunit Tim44  39.8 
 
 		 206 aa  119  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3445  import inner membrane translocase  33.94 
 
 		 221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2786  import inner membrane translocase, subunit Tim44  33.94 
 
 		 218 aa  112  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.242011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0191  import inner membrane translocase, subunit Tim44  34.91 
 
 		 235 aa  112  4.0000000000000004e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0232  tim44-like domain-containing protein  27.91 
 
 		 212 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.217806  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0107  hypothetical protein  24.64 
 
 		 216 aa  105  4e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.262774  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5038  import inner membrane translocase subunit Tim44  33.17 
 
 		 199 aa  99  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.356912 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0288  import inner membrane translocase subunit Tim44  33.48 
 
 		 226 aa  98.6  7e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0360  Tim44-like domain-containing protein  29.41 
 
 		 208 aa  87  2e-16  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0482  import inner membrane translocase, subunit Tim44  32.37 
 
 		 331 aa  64.3  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_94921  MPT family transporter: inner membrane translocase (import) Tim44  24.83 
 
 		 286 aa  57  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.417325  normal  0.107445 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3119  hypothetical protein  23.87 
 
 		 295 aa  55.1  0.0000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.448764 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1004  putative transport protein  22.37 
 
 		 316 aa  55.1  0.0000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4340  hypothetical protein  23.25 
 
 		 291 aa  54.7  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3925  import inner membrane translocase subunit Tim44  21.72 
 
 		 287 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3607  import inner membrane translocase, subunit Tim44  22.37 
 
 		 291 aa  51.6  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1550  hypothetical protein  24.68 
 
 		 291 aa  51.2  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0535221  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4001  import inner membrane translocase subunit Tim44  20.36 
 
 		 287 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4024  import inner membrane translocase subunit Tim44  20.81 
 
 		 287 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.149443  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004023  hypothetical protein  23.18 
 
 		 290 aa  49.3  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000578853  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1256  hypothetical protein  26.09 
 
 		 204 aa  48.1  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4117  import inner membrane translocase subunit Tim44  20.36 
 
 		 287 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1091  putative lipoprotein  23.57 
 
 		 321 aa  47  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000494647  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3250  import inner membrane translocase subunit Tim44  24.41 
 
 		 321 aa  46.2  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44351  predicted protein  23.13 
 
 		 510 aa  45.8  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2938  import inner membrane translocase subunit Tim44  25.17 
 
 		 318 aa  45.1  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000555932  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1927  import inner membrane translocase, subunit Tim44  25.87 
 
 		 322 aa  44.7  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000885618  normal  0.873638 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01439  hypothetical protein  23.98 
 
 		 290 aa  44.3  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2135  import inner membrane translocase subunit Tim44  24.52 
 
 		 216 aa  42.7  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1284  import inner membrane translocase subunit Tim44  25.17 
 
 		 318 aa  42.4  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.45671e-16 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0785  import inner membrane translocase, subunit Tim44  27.69 
 
 		 314 aa  42.7  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0683467  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3295  import inner membrane translocase, subunit Tim44  26.06 
 
 		 318 aa  42.4  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081668  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1269  hypothetical protein  26.77 
 
 		 342 aa  42.4  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.753871  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3566  import inner membrane translocase, subunit Tim44  24 
 
 		 317 aa  42  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000205074  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>