58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4268 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4268  import inner membrane translocase subunit Tim44  100 
 
 		 234 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.331754 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3942  import inner membrane translocase subunit Tim44  98.29 
 
 		 234 aa  467  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.851876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3216  import inner membrane translocase subunit Tim44  72.22 
 
 		 234 aa  340  9e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0009  Membrane associated transporter protein  71.67 
 
 		 232 aa  338  4e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3485  import inner membrane translocase, subunit Tim44  64.83 
 
 		 235 aa  300  1e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0846  import inner membrane translocase subunit Tim44  62.33 
 
 		 231 aa  273  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.748239  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2074  hypothetical protein  60.54 
 
 		 235 aa  266  2e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1994  hypothetical protein  60.54 
 
 		 231 aa  266  2e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.289958  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0299  import inner membrane translocase, subunit Tim44  47.88 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1294  Tim44 domain-containing protein  44.74 
 
 		 230 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.483295  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0421  import inner membrane translocase, subunit Tim44  48.32 
 
 		 235 aa  211  7e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0117  import inner membrane translocase, subunit Tim44  47.66 
 
 		 234 aa  211  1e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0729784  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0107  hypothetical protein  46.81 
 
 		 234 aa  206  3e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0156  hypothetical protein  46.09 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0400  import inner membrane translocase, subunit Tim44  46.84 
 
 		 235 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0305  import inner membrane translocase subunit Tim44  45.42 
 
 		 235 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1839  import inner membrane translocase subunit Tim44  47.86 
 
 		 239 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.661091  normal  0.32542 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1560  import inner membrane translocase subunit Tim44  47.86 
 
 		 239 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.69866 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2048  import inner membrane translocase subunit Tim44  46.38 
 
 		 250 aa  195  6e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.476328  normal  0.72544 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0998  import inner membrane translocase subunit Tim44  46.22 
 
 		 241 aa  193  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1248  import inner membrane translocase subunit Tim44  49.14 
 
 		 247 aa  191  9e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.99982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1142  import inner membrane translocase subunit Tim44  43.78 
 
 		 239 aa  191  1e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00140401 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1374  import inner membrane translocase subunit Tim44  45.38 
 
 		 238 aa  190  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.314839  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1681  import inner membrane translocase subunit Tim44  46.84 
 
 		 242 aa  190  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3713  import inner membrane translocase subunit Tim44  45.11 
 
 		 237 aa  186  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.500571 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3111  import inner membrane translocase subunit Tim44  44.58 
 
 		 260 aa  182  3e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.915706  normal  0.806338 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3608  hypothetical protein  39.65 
 
 		 219 aa  156  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.765658  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2676  import inner membrane translocase, subunit Tim44  36.52 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.458481  normal  0.659475 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1239  hypothetical protein  36.64 
 
 		 219 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2900  import inner membrane translocase, subunit Tim44  36.64 
 
 		 219 aa  134  9e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.203769  normal  0.596808 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2855  import inner membrane translocase, subunit Tim44  34.06 
 
 		 218 aa  128  8.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.37899  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2016  import inner membrane translocase, subunit Tim44  37.13 
 
 		 221 aa  125  6e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00392424 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3445  import inner membrane translocase  34.91 
 
 		 221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2786  import inner membrane translocase, subunit Tim44  34.35 
 
 		 218 aa  117  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.242011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3830  import inner membrane translocase, subunit Tim44  36.28 
 
 		 226 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.492338  normal  0.0940527 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0138  import inner membrane translocase, subunit Tim44  35.11 
 
 		 221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0191  import inner membrane translocase, subunit Tim44  34.7 
 
 		 235 aa  112  4.0000000000000004e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5038  import inner membrane translocase subunit Tim44  35.59 
 
 		 199 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.356912 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0584  import inner membrane translocase, subunit Tim44  31.56 
 
 		 247 aa  105  6e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0642637  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2980  import inner membrane translocase, subunit Tim44  33.78 
 
 		 206 aa  99.8  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0288  import inner membrane translocase subunit Tim44  33.77 
 
 		 226 aa  90.9  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0232  tim44-like domain-containing protein  26.15 
 
 		 212 aa  89.7  3e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.217806  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0778  membrane translocase, subunit Tim44  26.43 
 
 		 212 aa  89  6e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.132332  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0107  hypothetical protein  28.47 
 
 		 216 aa  72  0.000000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.262774  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0482  import inner membrane translocase, subunit Tim44  25.52 
 
 		 331 aa  69.3  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0360  Tim44-like domain-containing protein  28.68 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0544  import inner membrane translocase subunit Tim44  25.38 
 
 		 295 aa  53.5  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1091  putative lipoprotein  23.5 
 
 		 321 aa  52.8  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000494647  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1256  hypothetical protein  31.34 
 
 		 204 aa  52.4  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_94921  MPT family transporter: inner membrane translocase (import) Tim44  21.21 
 
 		 286 aa  48.5  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.417325  normal  0.107445 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44351  predicted protein  25 
 
 		 510 aa  45.8  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1788  import inner membrane translocase, subunit Tim44  21.52 
 
 		 341 aa  45.8  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000825798  normal  0.448103 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2207  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.33 
 
 		 329 aa  45.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1004  putative transport protein  25.93 
 
 		 316 aa  43.9  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2567  import inner membrane translocase, subunit Tim44  28.03 
 
 		 312 aa  43.9  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1526  import inner membrane translocase, subunit Tim44  29.06 
 
 		 332 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.496585  normal  0.854494 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1927  import inner membrane translocase, subunit Tim44  24.52 
 
 		 322 aa  43.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000885618  normal  0.873638 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3119  hypothetical protein  23.81 
 
 		 295 aa  42.4  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.448764 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>