64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3485 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3485  import inner membrane translocase, subunit Tim44  100 
 
 		 235 aa  471  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0846  import inner membrane translocase subunit Tim44  69.06 
 
 		 231 aa  308  6.999999999999999e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.748239  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3216  import inner membrane translocase subunit Tim44  64.26 
 
 		 234 aa  301  5.000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2074  hypothetical protein  66.37 
 
 		 235 aa  300  1e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1994  hypothetical protein  65.92 
 
 		 231 aa  299  2e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.289958  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3942  import inner membrane translocase subunit Tim44  63.56 
 
 		 234 aa  293  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.851876  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4268  import inner membrane translocase subunit Tim44  63.56 
 
 		 234 aa  291  5e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.331754 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0009  Membrane associated transporter protein  59.74 
 
 		 232 aa  278  6e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0305  import inner membrane translocase subunit Tim44  50.85 
 
 		 235 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1294  Tim44 domain-containing protein  47.62 
 
 		 230 aa  227  2e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.483295  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3713  import inner membrane translocase subunit Tim44  49.57 
 
 		 237 aa  224  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.500571 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0299  import inner membrane translocase, subunit Tim44  50.21 
 
 		 233 aa  222  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0117  import inner membrane translocase, subunit Tim44  48.93 
 
 		 234 aa  219  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0729784  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1374  import inner membrane translocase subunit Tim44  47.46 
 
 		 238 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.314839  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0421  import inner membrane translocase, subunit Tim44  49.15 
 
 		 235 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0400  import inner membrane translocase, subunit Tim44  48.95 
 
 		 235 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0107  hypothetical protein  49.15 
 
 		 234 aa  218  6e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0156  hypothetical protein  50.42 
 
 		 233 aa  218  7e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2048  import inner membrane translocase subunit Tim44  49.37 
 
 		 250 aa  217  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.476328  normal  0.72544 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0998  import inner membrane translocase subunit Tim44  46.64 
 
 		 241 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1560  import inner membrane translocase subunit Tim44  48.51 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.69866 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1839  import inner membrane translocase subunit Tim44  48.51 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.661091  normal  0.32542 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1681  import inner membrane translocase subunit Tim44  47.48 
 
 		 242 aa  209  4e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1142  import inner membrane translocase subunit Tim44  44.07 
 
 		 239 aa  203  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00140401 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1248  import inner membrane translocase subunit Tim44  47.9 
 
 		 247 aa  201  6e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.99982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3608  hypothetical protein  42.98 
 
 		 219 aa  175  6e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.765658  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3111  import inner membrane translocase subunit Tim44  39.34 
 
 		 260 aa  164  9e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.915706  normal  0.806338 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2016  import inner membrane translocase, subunit Tim44  36.89 
 
 		 221 aa  137  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00392424 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2855  import inner membrane translocase, subunit Tim44  36.49 
 
 		 218 aa  135  5e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.37899  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3830  import inner membrane translocase, subunit Tim44  35.47 
 
 		 226 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.492338  normal  0.0940527 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2786  import inner membrane translocase, subunit Tim44  35.4 
 
 		 218 aa  128  8.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.242011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2676  import inner membrane translocase, subunit Tim44  35.16 
 
 		 219 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.458481  normal  0.659475 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0138  import inner membrane translocase, subunit Tim44  34.93 
 
 		 221 aa  123  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0584  import inner membrane translocase, subunit Tim44  34.91 
 
 		 247 aa  123  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0642637  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3445  import inner membrane translocase  37 
 
 		 221 aa  120  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2900  import inner membrane translocase, subunit Tim44  34.68 
 
 		 219 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.203769  normal  0.596808 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1239  hypothetical protein  34.68 
 
 		 219 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0191  import inner membrane translocase, subunit Tim44  36.65 
 
 		 235 aa  117  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5038  import inner membrane translocase subunit Tim44  34.35 
 
 		 199 aa  103  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.356912 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2980  import inner membrane translocase, subunit Tim44  32.44 
 
 		 206 aa  99.4  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0778  membrane translocase, subunit Tim44  25.55 
 
 		 212 aa  93.2  3e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.132332  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0232  tim44-like domain-containing protein  26.36 
 
 		 212 aa  89.4  5e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.217806  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0107  hypothetical protein  27.07 
 
 		 216 aa  84.7  0.000000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.262774  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0482  import inner membrane translocase, subunit Tim44  25.45 
 
 		 331 aa  82.8  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0288  import inner membrane translocase subunit Tim44  29.06 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0360  Tim44-like domain-containing protein  30.95 
 
 		 208 aa  81.3  0.00000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1927  import inner membrane translocase, subunit Tim44  25.49 
 
 		 322 aa  54.7  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000885618  normal  0.873638 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3250  import inner membrane translocase subunit Tim44  26.14 
 
 		 321 aa  54.3  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0785  import inner membrane translocase, subunit Tim44  28.47 
 
 		 314 aa  54.3  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0683467  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2938  import inner membrane translocase subunit Tim44  26.95 
 
 		 318 aa  52.4  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000555932  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1010  import inner membrane translocase subunit Tim44  25 
 
 		 322 aa  51.6  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1284  import inner membrane translocase subunit Tim44  26.24 
 
 		 318 aa  50.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.45671e-16 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1788  import inner membrane translocase, subunit Tim44  23.04 
 
 		 341 aa  49.7  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000825798  normal  0.448103 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3295  import inner membrane translocase, subunit Tim44  25 
 
 		 318 aa  48.9  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081668  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_94921  MPT family transporter: inner membrane translocase (import) Tim44  20.13 
 
 		 286 aa  48.9  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.417325  normal  0.107445 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1004  putative transport protein  23.53 
 
 		 316 aa  47  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3566  import inner membrane translocase, subunit Tim44  23.49 
 
 		 317 aa  47.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000205074  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1256  hypothetical protein  28.91 
 
 		 204 aa  46.2  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2207  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.69 
 
 		 329 aa  44.3  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1091  putative lipoprotein  21.85 
 
 		 321 aa  44.7  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000494647  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004023  hypothetical protein  21.76 
 
 		 290 aa  42.4  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000578853  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0544  import inner membrane translocase subunit Tim44  24.11 
 
 		 295 aa  42.4  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1110  import inner membrane translocase subunit Tim44  24.09 
 
 		 298 aa  42  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.354142  normal  0.0303721 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3590  hypothetical protein  24.35 
 
 		 270 aa  41.6  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>