49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2980 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2980  import inner membrane translocase, subunit Tim44  100 
 
 
206 aa  410  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3608  hypothetical protein  39.8 
 
 
219 aa  128  6e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.765658  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0299  import inner membrane translocase, subunit Tim44  34.48 
 
 
233 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0117  import inner membrane translocase, subunit Tim44  33.48 
 
 
234 aa  118  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0729784  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0584  import inner membrane translocase, subunit Tim44  36.49 
 
 
247 aa  117  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0642637  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2016  import inner membrane translocase, subunit Tim44  36.36 
 
 
221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00392424 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0107  hypothetical protein  33.92 
 
 
234 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0156  hypothetical protein  33.92 
 
 
233 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2048  import inner membrane translocase subunit Tim44  35.93 
 
 
250 aa  112  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.476328  normal  0.72544 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0009  Membrane associated transporter protein  35.29 
 
 
232 aa  109  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2074  hypothetical protein  35 
 
 
235 aa  108  6e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0846  import inner membrane translocase subunit Tim44  34.43 
 
 
231 aa  108  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.748239  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1994  hypothetical protein  35 
 
 
231 aa  108  8.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.289958  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3485  import inner membrane translocase, subunit Tim44  33.04 
 
 
235 aa  107  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0421  import inner membrane translocase, subunit Tim44  31.14 
 
 
235 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0305  import inner membrane translocase subunit Tim44  33.77 
 
 
235 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3111  import inner membrane translocase subunit Tim44  32.91 
 
 
260 aa  103  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.915706  normal  0.806338 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3713  import inner membrane translocase subunit Tim44  33.19 
 
 
237 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.500571 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3942  import inner membrane translocase subunit Tim44  33.18 
 
 
234 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.851876  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0138  import inner membrane translocase, subunit Tim44  33.99 
 
 
221 aa  102  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3830  import inner membrane translocase, subunit Tim44  34.76 
 
 
226 aa  101  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.492338  normal  0.0940527 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4268  import inner membrane translocase subunit Tim44  33.18 
 
 
234 aa  101  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.331754 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0400  import inner membrane translocase, subunit Tim44  32.02 
 
 
235 aa  101  9e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1560  import inner membrane translocase subunit Tim44  33.33 
 
 
239 aa  101  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.69866 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1839  import inner membrane translocase subunit Tim44  33.33 
 
 
239 aa  101  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.661091  normal  0.32542 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1142  import inner membrane translocase subunit Tim44  33.04 
 
 
239 aa  100  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00140401 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3216  import inner membrane translocase subunit Tim44  30.8 
 
 
234 aa  99.8  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0998  import inner membrane translocase subunit Tim44  31.76 
 
 
241 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1681  import inner membrane translocase subunit Tim44  33.77 
 
 
242 aa  99.4  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850912  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2855  import inner membrane translocase, subunit Tim44  31.16 
 
 
218 aa  99  4e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.37899  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2900  import inner membrane translocase, subunit Tim44  31.28 
 
 
219 aa  97.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.203769  normal  0.596808 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1374  import inner membrane translocase subunit Tim44  31.42 
 
 
238 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.314839  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1239  hypothetical protein  30.81 
 
 
219 aa  94.4  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1248  import inner membrane translocase subunit Tim44  35.45 
 
 
247 aa  94  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.99982  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5038  import inner membrane translocase subunit Tim44  35.5 
 
 
199 aa  93.2  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.356912 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2676  import inner membrane translocase, subunit Tim44  29.25 
 
 
219 aa  92.4  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.458481  normal  0.659475 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2786  import inner membrane translocase, subunit Tim44  32.39 
 
 
218 aa  84.7  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.242011  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1294  Tim44 domain-containing protein  28.05 
 
 
230 aa  84  0.000000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.483295  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0191  import inner membrane translocase, subunit Tim44  30.77 
 
 
235 aa  82.4  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3445  import inner membrane translocase  29.68 
 
 
221 aa  79  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0232  tim44-like domain-containing protein  22.12 
 
 
212 aa  75.5  0.0000000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.217806  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0360  Tim44-like domain-containing protein  27.18 
 
 
208 aa  72  0.000000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0288  import inner membrane translocase subunit Tim44  32.14 
 
 
226 aa  72.4  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0778  membrane translocase, subunit Tim44  22.33 
 
 
212 aa  72  0.000000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.132332  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0107  hypothetical protein  22.44 
 
 
216 aa  69.7  0.00000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.262774  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0482  import inner membrane translocase, subunit Tim44  24.82 
 
 
331 aa  60.8  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2135  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.89 
 
 
216 aa  55.1  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1927  import inner membrane translocase, subunit Tim44  26.57 
 
 
322 aa  52.8  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000885618  normal  0.873638 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1091  putative lipoprotein  24.75 
 
 
321 aa  50.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000494647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>