59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3830 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3830  import inner membrane translocase, subunit Tim44  100 
 
 		 226 aa  451  1.0000000000000001e-126  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.492338  normal  0.0940527 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2016  import inner membrane translocase, subunit Tim44  50 
 
 		 221 aa  208  5e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00392424 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0584  import inner membrane translocase, subunit Tim44  50.66 
 
 		 247 aa  194  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0642637  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3485  import inner membrane translocase, subunit Tim44  36.56 
 
 		 235 aa  136  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3111  import inner membrane translocase subunit Tim44  37.55 
 
 		 260 aa  133  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.915706  normal  0.806338 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0305  import inner membrane translocase subunit Tim44  38.03 
 
 		 235 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0156  hypothetical protein  39.15 
 
 		 233 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2048  import inner membrane translocase subunit Tim44  37.76 
 
 		 250 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.476328  normal  0.72544 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0400  import inner membrane translocase, subunit Tim44  37.18 
 
 		 235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1142  import inner membrane translocase subunit Tim44  35.22 
 
 		 239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00140401 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1681  import inner membrane translocase subunit Tim44  35.47 
 
 		 242 aa  129  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3216  import inner membrane translocase subunit Tim44  36.24 
 
 		 234 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1839  import inner membrane translocase subunit Tim44  35.65 
 
 		 239 aa  128  6e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.661091  normal  0.32542 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1560  import inner membrane translocase subunit Tim44  35.65 
 
 		 239 aa  128  6e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.69866 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3713  import inner membrane translocase subunit Tim44  38.03 
 
 		 237 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.500571 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3608  hypothetical protein  37.26 
 
 		 219 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.765658  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0107  hypothetical protein  35.51 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_004310  BR2074  hypothetical protein  38.05 
 
 		 235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0846  import inner membrane translocase subunit Tim44  37.56 
 
 		 231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.748239  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1248  import inner membrane translocase subunit Tim44  37.39 
 
 		 247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.99982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0421  import inner membrane translocase, subunit Tim44  37.23 
 
 		 235 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0009  Membrane associated transporter protein  36 
 
 		 232 aa  125  5e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0299  import inner membrane translocase, subunit Tim44  36.4 
 
 		 233 aa  124  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0117  import inner membrane translocase, subunit Tim44  34.89 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0729784  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1994  hypothetical protein  37.17 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.289958  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4268  import inner membrane translocase subunit Tim44  37.17 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.331754 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3942  import inner membrane translocase subunit Tim44  36.73 
 
 		 234 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.851876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1374  import inner membrane translocase subunit Tim44  34.5 
 
 		 238 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.314839  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0138  import inner membrane translocase, subunit Tim44  37.38 
 
 		 221 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2676  import inner membrane translocase, subunit Tim44  34.65 
 
 		 219 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.458481  normal  0.659475 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0998  import inner membrane translocase subunit Tim44  33.91 
 
 		 241 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0191  import inner membrane translocase, subunit Tim44  33.02 
 
 		 235 aa  107  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1239  hypothetical protein  31.86 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2900  import inner membrane translocase, subunit Tim44  31.86 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.203769  normal  0.596808 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2855  import inner membrane translocase, subunit Tim44  29.02 
 
 		 218 aa  105  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.37899  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1294  Tim44 domain-containing protein  30.84 
 
 		 230 aa  102  4e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.483295  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2786  import inner membrane translocase, subunit Tim44  31.86 
 
 		 218 aa  101  9e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.242011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3445  import inner membrane translocase  31.53 
 
 		 221 aa  97.1  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2980  import inner membrane translocase, subunit Tim44  35.82 
 
 		 206 aa  96.3  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0778  membrane translocase, subunit Tim44  25.36 
 
 		 212 aa  96.3  4e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.132332  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0107  hypothetical protein  26.19 
 
 		 216 aa  92  6e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.262774  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0232  tim44-like domain-containing protein  24.4 
 
 		 212 aa  90.1  3e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.217806  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5038  import inner membrane translocase subunit Tim44  32.23 
 
 		 199 aa  89  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.356912 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0288  import inner membrane translocase subunit Tim44  34.65 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0360  Tim44-like domain-containing protein  23.44 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1256  hypothetical protein  28.24 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1091  putative lipoprotein  27.11 
 
 		 321 aa  55.1  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000494647  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1927  import inner membrane translocase, subunit Tim44  28.38 
 
 		 322 aa  55.1  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000885618  normal  0.873638 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0482  import inner membrane translocase, subunit Tim44  27.34 
 
 		 331 aa  52.8  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1284  import inner membrane translocase subunit Tim44  29.75 
 
 		 318 aa  47.8  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.45671e-16 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0785  import inner membrane translocase, subunit Tim44  28.57 
 
 		 314 aa  45.4  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0683467  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3119  hypothetical protein  25 
 
 		 295 aa  44.7  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.448764 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_94921  MPT family transporter: inner membrane translocase (import) Tim44  23.02 
 
 		 286 aa  43.5  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.417325  normal  0.107445 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1110  import inner membrane translocase subunit Tim44  26.92 
 
 		 298 aa  43.9  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.354142  normal  0.0303721 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4001  import inner membrane translocase subunit Tim44  23.75 
 
 		 287 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4024  import inner membrane translocase subunit Tim44  24.24 
 
 		 287 aa  42.4  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.149443  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3250  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.39 
 
 		 321 aa  42.4  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3295  import inner membrane translocase, subunit Tim44  25.16 
 
 		 318 aa  42.4  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081668  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2938  import inner membrane translocase subunit Tim44  25.61 
 
 		 318 aa  42  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000555932  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>