91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3295 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3295  import inner membrane translocase, subunit Tim44  100 
 
 		 318 aa  653    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081668  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0901  import inner membrane translocase, subunit Tim44  79.34 
 
 		 314 aa  434  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000201824  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3566  import inner membrane translocase, subunit Tim44  69.78 
 
 		 317 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000205074  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1284  import inner membrane translocase subunit Tim44  65.33 
 
 		 318 aa  362  4e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.45671e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2938  import inner membrane translocase subunit Tim44  65.12 
 
 		 318 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000555932  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0785  import inner membrane translocase, subunit Tim44  66.04 
 
 		 314 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0683467  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1010  import inner membrane translocase subunit Tim44  63.29 
 
 		 322 aa  300  3e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3250  import inner membrane translocase subunit Tim44  66.19 
 
 		 321 aa  293  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1091  putative lipoprotein  52.48 
 
 		 321 aa  259  4e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000494647  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1927  import inner membrane translocase, subunit Tim44  50.31 
 
 		 322 aa  218  1e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000885618  normal  0.873638 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1788  import inner membrane translocase, subunit Tim44  49.01 
 
 		 341 aa  200  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000825798  normal  0.448103 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0482  import inner membrane translocase, subunit Tim44  32.46 
 
 		 331 aa  103  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0544  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.94 
 
 		 295 aa  102  9e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0311  import inner membrane translocase subunit Tim44  36.67 
 
 		 320 aa  85.1  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.0470868 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6540  import inner membrane translocase subunit Tim44  29.81 
 
 		 332 aa  83.6  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.398166  normal  0.199544 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2165  hypothetical protein  27.46 
 
 		 312 aa  83.2  0.000000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.810394 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2207  import inner membrane translocase subunit Tim44  33.06 
 
 		 329 aa  81.6  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4404  import inner membrane translocase subunit Tim44  34.48 
 
 		 337 aa  79.7  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.583271  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5490  hypothetical protein  37.61 
 
 		 325 aa  79.3  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2280  import inner membrane translocase subunit Tim44  58.16 
 
 		 134 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000369229 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6128  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.57 
 
 		 331 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.418522  normal  0.280335 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1701  import inner membrane translocase, subunit Tim44  34.48 
 
 		 331 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0334  import inner membrane translocase subunit Tim44  26.64 
 
 		 321 aa  75.9  0.0000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  0.137155 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3768  import inner membrane translocase, subunit Tim44  34.48 
 
 		 338 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0773  hypothetical protein  26.87 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1269  hypothetical protein  30.23 
 
 		 342 aa  69.3  0.00000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.753871  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2119  import inner membrane translocase, subunit Tim44  25.74 
 
 		 343 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434025  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2731  import inner membrane translocase, subunit Tim44  25.74 
 
 		 343 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.767216  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2758  import inner membrane translocase subunit Tim44  25.74 
 
 		 343 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.778073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2211  import inner membrane translocase subunit Tim44  29.11 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.895169  normal  0.192893 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1240  hypothetical protein  33.65 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0197113  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0214  import inner membrane translocase, subunit Tim44  25 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.525387  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5842  import inner membrane translocase subunit Tim44  26.24 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1921  import inner membrane translocase subunit Tim44  30.08 
 
 		 348 aa  67.4  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.464054  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2135  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.22 
 
 		 216 aa  67  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3047  import inner membrane translocase, subunit Tim44  26.98 
 
 		 272 aa  65.1  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2529  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.36 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5103  import inner membrane translocase subunit Tim44  34.19 
 
 		 316 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2254  import inner membrane translocase subunit Tim44  31.62 
 
 		 319 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.349216  normal  0.0696359 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0684  Tim44-like domain-containing protein  25.52 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2319  hypothetical protein  25.52 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2399  hypothetical protein  25.52 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2759  hypothetical protein  25.52 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0187  hypothetical protein  25.52 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0845  transmembrane protein  25.52 
 
 		 323 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376855  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0554  Tim44-like domain-contain protein  24.26 
 
 		 340 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5066  import inner membrane translocase, subunit Tim44  24.8 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5517  hypothetical protein  25.78 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0668  Tim44-like domain-containing protein  24.85 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1858  import inner membrane translocase subunit Tim44  29.57 
 
 		 333 aa  59.3  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.767036  normal  0.41098 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5646  import inner membrane translocase, subunit Tim44  23.62 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169336 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0538  import inner membrane translocase, subunit Tim44  27.54 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0375  import inner membrane translocase subunit Tim44  25 
 
 		 331 aa  57  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3713  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.21 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.500571 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0551  import inner membrane translocase subunit Tim44  30.83 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031829 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6058  putative transporter  24.7 
 
 		 344 aa  55.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2782  import inner membrane translocase, subunit Tim44  23.81 
 
 		 344 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2649  import inner membrane translocase subunit Tim44  23.81 
 
 		 344 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.331938  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72930  hypothetical protein  24.22 
 
 		 285 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3590  hypothetical protein  29.48 
 
 		 270 aa  53.1  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1256  hypothetical protein  27.06 
 
 		 204 aa  53.1  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0138  import inner membrane translocase, subunit Tim44  26.05 
 
 		 221 aa  53.1  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4049  hypothetical protein  27 
 
 		 330 aa  52.4  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.631655 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1681  import inner membrane translocase subunit Tim44  25.17 
 
 		 242 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1560  import inner membrane translocase subunit Tim44  24.49 
 
 		 239 aa  52  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.69866 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1839  import inner membrane translocase subunit Tim44  24.49 
 
 		 239 aa  52  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.661091  normal  0.32542 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0650  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.16 
 
 		 330 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.983868 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6329  hypothetical protein  22.83 
 
 		 281 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2016  import inner membrane translocase, subunit Tim44  26.71 
 
 		 221 aa  51.2  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00392424 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00430  Tim44-like domain protein  28.09 
 
 		 284 aa  50.1  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.924994  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2074  hypothetical protein  22.78 
 
 		 235 aa  48.5  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0990  import inner membrane translocase, subunit Tim44  25.23 
 
 		 295 aa  48.9  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0305  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.76 
 
 		 235 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3485  import inner membrane translocase, subunit Tim44  25 
 
 		 235 aa  47.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2096  hypothetical protein  25 
 
 		 318 aa  47  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0739383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0107  hypothetical protein  23.18 
 
 		 234 aa  47  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1994  hypothetical protein  22.15 
 
 		 231 aa  45.8  0.0009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.289958  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1601  import inner membrane translocase subunit Tim44  23.96 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2861  import inner membrane translocase subunit Tim44  26.19 
 
 		 308 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3445  import inner membrane translocase  22.73 
 
 		 221 aa  45.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0421  import inner membrane translocase, subunit Tim44  24.23 
 
 		 235 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0998  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.46 
 
 		 241 aa  43.9  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1374  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.17 
 
 		 238 aa  43.9  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.314839  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2686  import inner membrane translocase subunit Tim44  25.98 
 
 		 462 aa  43.5  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0000948216  normal  0.213043 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2065  import inner membrane translocase subunit Tim44  21.72 
 
 		 320 aa  43.9  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0100272 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1736  import inner membrane translocase subunit Tim44  23.44 
 
 		 308 aa  43.5  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000113621  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0299  import inner membrane translocase, subunit Tim44  25.54 
 
 		 233 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2567  import inner membrane translocase, subunit Tim44  40 
 
 		 312 aa  43.5  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0846  import inner membrane translocase subunit Tim44  24.53 
 
 		 231 aa  42.7  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.748239  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3268  import inner membrane translocase subunit Tim44  37.93 
 
 		 325 aa  42.7  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0400  import inner membrane translocase, subunit Tim44  25.5 
 
 		 235 aa  42.4  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.363906 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>