60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3111 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3111  import inner membrane translocase subunit Tim44  100 
 
 		 260 aa  530  1e-150  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.915706  normal  0.806338 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1374  import inner membrane translocase subunit Tim44  46.91 
 
 		 238 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.314839  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0998  import inner membrane translocase subunit Tim44  47.54 
 
 		 241 aa  208  5e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1142  import inner membrane translocase subunit Tim44  44.49 
 
 		 239 aa  196  3e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00140401 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0156  hypothetical protein  42.45 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1560  import inner membrane translocase subunit Tim44  41.22 
 
 		 239 aa  185  6e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.69866 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1839  import inner membrane translocase subunit Tim44  41.22 
 
 		 239 aa  185  6e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.661091  normal  0.32542 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0299  import inner membrane translocase, subunit Tim44  42.08 
 
 		 233 aa  185  8e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2048  import inner membrane translocase subunit Tim44  41.56 
 
 		 250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.476328  normal  0.72544 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0107  hypothetical protein  41.39 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0009  Membrane associated transporter protein  43.51 
 
 		 232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1681  import inner membrane translocase subunit Tim44  41.53 
 
 		 242 aa  183  3e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3713  import inner membrane translocase subunit Tim44  42.34 
 
 		 237 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.500571 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0421  import inner membrane translocase, subunit Tim44  39.92 
 
 		 235 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3942  import inner membrane translocase subunit Tim44  45 
 
 		 234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.851876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0117  import inner membrane translocase, subunit Tim44  41.25 
 
 		 234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0729784  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0305  import inner membrane translocase subunit Tim44  41.04 
 
 		 235 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4268  import inner membrane translocase subunit Tim44  44.58 
 
 		 234 aa  178  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.331754 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0400  import inner membrane translocase, subunit Tim44  41.3 
 
 		 235 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3216  import inner membrane translocase subunit Tim44  44.13 
 
 		 234 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3485  import inner membrane translocase, subunit Tim44  39.34 
 
 		 235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1248  import inner membrane translocase subunit Tim44  40.68 
 
 		 247 aa  160  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.99982  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2074  hypothetical protein  39.33 
 
 		 235 aa  157  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1994  hypothetical protein  38.91 
 
 		 231 aa  155  7e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.289958  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0846  import inner membrane translocase subunit Tim44  36.17 
 
 		 231 aa  148  7e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.748239  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2016  import inner membrane translocase, subunit Tim44  40.6 
 
 		 221 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00392424 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1239  hypothetical protein  36.25 
 
 		 219 aa  145  9e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2900  import inner membrane translocase, subunit Tim44  36.25 
 
 		 219 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.203769  normal  0.596808 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2676  import inner membrane translocase, subunit Tim44  35.83 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.458481  normal  0.659475 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3608  hypothetical protein  35.42 
 
 		 219 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.765658  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3830  import inner membrane translocase, subunit Tim44  37.55 
 
 		 226 aa  133  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.492338  normal  0.0940527 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2786  import inner membrane translocase, subunit Tim44  34.85 
 
 		 218 aa  129  5.0000000000000004e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.242011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0584  import inner membrane translocase, subunit Tim44  36.51 
 
 		 247 aa  128  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0642637  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0138  import inner membrane translocase, subunit Tim44  34.16 
 
 		 221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1294  Tim44 domain-containing protein  31.82 
 
 		 230 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.483295  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2855  import inner membrane translocase, subunit Tim44  31.67 
 
 		 218 aa  124  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.37899  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0191  import inner membrane translocase, subunit Tim44  34.91 
 
 		 235 aa  115  7.999999999999999e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3445  import inner membrane translocase  32.08 
 
 		 221 aa  109  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0288  import inner membrane translocase subunit Tim44  32.54 
 
 		 226 aa  96.7  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0778  membrane translocase, subunit Tim44  26.69 
 
 		 212 aa  91.7  1e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.132332  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5038  import inner membrane translocase subunit Tim44  39.22 
 
 		 199 aa  89  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.356912 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2980  import inner membrane translocase, subunit Tim44  32.91 
 
 		 206 aa  86.7  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0107  hypothetical protein  23.32 
 
 		 216 aa  85.9  5e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.262774  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0232  tim44-like domain-containing protein  24.58 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.217806  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0360  Tim44-like domain-containing protein  29.08 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0482  import inner membrane translocase, subunit Tim44  25.35 
 
 		 331 aa  68.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1927  import inner membrane translocase, subunit Tim44  28.66 
 
 		 322 aa  60.1  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000885618  normal  0.873638 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3119  hypothetical protein  25.1 
 
 		 295 aa  58.9  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.448764 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1091  putative lipoprotein  25.17 
 
 		 321 aa  55.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000494647  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33251  predicted protein  24.05 
 
 		 221 aa  51.6  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3590  hypothetical protein  33.05 
 
 		 270 aa  48.5  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3250  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.87 
 
 		 321 aa  48.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1010  import inner membrane translocase subunit Tim44  25.41 
 
 		 322 aa  47  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1921  import inner membrane translocase subunit Tim44  30.51 
 
 		 348 aa  47  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.464054  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3566  import inner membrane translocase, subunit Tim44  24.72 
 
 		 317 aa  47  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000205074  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0311  import inner membrane translocase subunit Tim44  25.42 
 
 		 320 aa  46.2  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.0470868 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_94921  MPT family transporter: inner membrane translocase (import) Tim44  23.39 
 
 		 286 aa  46.2  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.417325  normal  0.107445 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1788  import inner membrane translocase, subunit Tim44  23.17 
 
 		 341 aa  45.8  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000825798  normal  0.448103 
 
 
-
 
NC_004310  BR1269  hypothetical protein  30.51 
 
 		 342 aa  44.7  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.753871  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0785  import inner membrane translocase, subunit Tim44  26.17 
 
 		 314 aa  44.3  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0683467  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>