68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3445 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3445  import inner membrane translocase  100 
 
 		 221 aa  440  1e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2676  import inner membrane translocase, subunit Tim44  64.71 
 
 		 219 aa  298  3e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.458481  normal  0.659475 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1239  hypothetical protein  63.8 
 
 		 219 aa  293  1e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2900  import inner membrane translocase, subunit Tim44  63.8 
 
 		 219 aa  292  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.203769  normal  0.596808 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0191  import inner membrane translocase, subunit Tim44  73.06 
 
 		 235 aa  262  3e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2855  import inner membrane translocase, subunit Tim44  57.08 
 
 		 218 aa  258  6e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.37899  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2786  import inner membrane translocase, subunit Tim44  53.81 
 
 		 218 aa  233  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.242011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3713  import inner membrane translocase subunit Tim44  38.05 
 
 		 237 aa  144  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.500571 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0299  import inner membrane translocase, subunit Tim44  37.5 
 
 		 233 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2048  import inner membrane translocase subunit Tim44  36.91 
 
 		 250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.476328  normal  0.72544 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1374  import inner membrane translocase subunit Tim44  37.55 
 
 		 238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.314839  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0400  import inner membrane translocase, subunit Tim44  37.18 
 
 		 235 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0305  import inner membrane translocase subunit Tim44  36.17 
 
 		 235 aa  135  5e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0156  hypothetical protein  33.88 
 
 		 233 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0421  import inner membrane translocase, subunit Tim44  35.47 
 
 		 235 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0998  import inner membrane translocase subunit Tim44  36.48 
 
 		 241 aa  131  6e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0117  import inner membrane translocase, subunit Tim44  35.04 
 
 		 234 aa  131  6.999999999999999e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0729784  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3216  import inner membrane translocase subunit Tim44  36.94 
 
 		 234 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3485  import inner membrane translocase, subunit Tim44  37 
 
 		 235 aa  129  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0107  hypothetical protein  34.75 
 
 		 234 aa  128  7.000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1560  import inner membrane translocase subunit Tim44  35.65 
 
 		 239 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.69866 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4268  import inner membrane translocase subunit Tim44  35.06 
 
 		 234 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.331754 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3942  import inner membrane translocase subunit Tim44  34.63 
 
 		 234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.851876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1839  import inner membrane translocase subunit Tim44  35.65 
 
 		 239 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.661091  normal  0.32542 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1294  Tim44 domain-containing protein  33.94 
 
 		 230 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.483295  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1681  import inner membrane translocase subunit Tim44  35.5 
 
 		 242 aa  125  5e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0009  Membrane associated transporter protein  35.93 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1142  import inner membrane translocase subunit Tim44  29.75 
 
 		 239 aa  124  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00140401 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1994  hypothetical protein  36.07 
 
 		 231 aa  123  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.289958  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2074  hypothetical protein  36.07 
 
 		 235 aa  122  4e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3608  hypothetical protein  34.84 
 
 		 219 aa  121  8e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.765658  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0846  import inner membrane translocase subunit Tim44  34.53 
 
 		 231 aa  117  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.748239  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1248  import inner membrane translocase subunit Tim44  34.78 
 
 		 247 aa  117  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.99982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3111  import inner membrane translocase subunit Tim44  32.08 
 
 		 260 aa  116  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.915706  normal  0.806338 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0584  import inner membrane translocase, subunit Tim44  32.52 
 
 		 247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0642637  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2016  import inner membrane translocase, subunit Tim44  30.49 
 
 		 221 aa  108  8.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00392424 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0138  import inner membrane translocase, subunit Tim44  35.16 
 
 		 221 aa  105  7e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3830  import inner membrane translocase, subunit Tim44  30.91 
 
 		 226 aa  96.3  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.492338  normal  0.0940527 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0288  import inner membrane translocase subunit Tim44  33.64 
 
 		 226 aa  87.4  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0107  hypothetical protein  26.48 
 
 		 216 aa  82.4  0.000000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.262774  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5038  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.7 
 
 		 199 aa  80.5  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.356912 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2980  import inner membrane translocase, subunit Tim44  29.68 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0778  membrane translocase, subunit Tim44  23.96 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.132332  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0482  import inner membrane translocase, subunit Tim44  26.18 
 
 		 331 aa  67.4  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0360  Tim44-like domain-containing protein  30.14 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0232  tim44-like domain-containing protein  21.46 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.217806  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1788  import inner membrane translocase, subunit Tim44  24.05 
 
 		 341 aa  56.6  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000825798  normal  0.448103 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3607  import inner membrane translocase, subunit Tim44  23.5 
 
 		 291 aa  54.3  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3119  hypothetical protein  22.86 
 
 		 295 aa  53.5  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.448764 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3295  import inner membrane translocase, subunit Tim44  23.08 
 
 		 318 aa  53.5  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081668  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4117  import inner membrane translocase subunit Tim44  22.77 
 
 		 287 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0785  import inner membrane translocase, subunit Tim44  24.84 
 
 		 314 aa  49.7  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0683467  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3925  import inner membrane translocase subunit Tim44  23.21 
 
 		 287 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4001  import inner membrane translocase subunit Tim44  23.04 
 
 		 287 aa  48.5  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4340  hypothetical protein  22.42 
 
 		 291 aa  48.5  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1110  import inner membrane translocase subunit Tim44  25.6 
 
 		 298 aa  47.8  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.354142  normal  0.0303721 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1736  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.4 
 
 		 308 aa  47  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000113621  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4024  import inner membrane translocase subunit Tim44  22.32 
 
 		 287 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.149443  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3566  import inner membrane translocase, subunit Tim44  23.29 
 
 		 317 aa  46.6  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000205074  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2938  import inner membrane translocase subunit Tim44  23.32 
 
 		 318 aa  46.2  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000555932  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1284  import inner membrane translocase subunit Tim44  23.15 
 
 		 318 aa  45.8  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.45671e-16 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2207  import inner membrane translocase subunit Tim44  22.81 
 
 		 329 aa  45.4  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3250  import inner membrane translocase subunit Tim44  22.37 
 
 		 321 aa  45.4  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1091  putative lipoprotein  25.23 
 
 		 321 aa  45.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000494647  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1010  import inner membrane translocase subunit Tim44  22.22 
 
 		 322 aa  43.9  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2780  hypothetical protein  28.47 
 
 		 273 aa  43.1  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.300996 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0334  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.35 
 
 		 321 aa  43.5  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  0.137155 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1927  import inner membrane translocase, subunit Tim44  24.48 
 
 		 322 aa  42.7  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000885618  normal  0.873638 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>