69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1681 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1681  import inner membrane translocase subunit Tim44  100 
 
 		 242 aa  480  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1560  import inner membrane translocase subunit Tim44  93.39 
 
 		 239 aa  435  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.69866 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1839  import inner membrane translocase subunit Tim44  93.39 
 
 		 239 aa  435  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.661091  normal  0.32542 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3713  import inner membrane translocase subunit Tim44  77.27 
 
 		 237 aa  369  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.500571 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1374  import inner membrane translocase subunit Tim44  68.18 
 
 		 238 aa  321  5e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.314839  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0998  import inner membrane translocase subunit Tim44  68.6 
 
 		 241 aa  316  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0299  import inner membrane translocase, subunit Tim44  52.99 
 
 		 233 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0156  hypothetical protein  51.49 
 
 		 233 aa  239  4e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2048  import inner membrane translocase subunit Tim44  51.05 
 
 		 250 aa  237  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.476328  normal  0.72544 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0305  import inner membrane translocase subunit Tim44  48.32 
 
 		 235 aa  222  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0421  import inner membrane translocase, subunit Tim44  48.32 
 
 		 235 aa  221  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0107  hypothetical protein  47.86 
 
 		 234 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0400  import inner membrane translocase, subunit Tim44  48.73 
 
 		 235 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0117  import inner membrane translocase, subunit Tim44  48.73 
 
 		 234 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0729784  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3485  import inner membrane translocase, subunit Tim44  47.48 
 
 		 235 aa  214  8e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0009  Membrane associated transporter protein  49.37 
 
 		 232 aa  210  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3216  import inner membrane translocase subunit Tim44  47.48 
 
 		 234 aa  209  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1142  import inner membrane translocase subunit Tim44  47.52 
 
 		 239 aa  203  3e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00140401 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1994  hypothetical protein  48.46 
 
 		 231 aa  196  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.289958  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2074  hypothetical protein  48.46 
 
 		 235 aa  196  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0846  import inner membrane translocase subunit Tim44  46.46 
 
 		 231 aa  194  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.748239  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3111  import inner membrane translocase subunit Tim44  41.53 
 
 		 260 aa  189  5e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.915706  normal  0.806338 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3942  import inner membrane translocase subunit Tim44  46.84 
 
 		 234 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.851876  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4268  import inner membrane translocase subunit Tim44  47.26 
 
 		 234 aa  186  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.331754 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1248  import inner membrane translocase subunit Tim44  43.83 
 
 		 247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.99982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1294  Tim44 domain-containing protein  39.57 
 
 		 230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.483295  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3608  hypothetical protein  37.6 
 
 		 219 aa  149  3e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.765658  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2016  import inner membrane translocase, subunit Tim44  40.87 
 
 		 221 aa  149  4e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00392424 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2786  import inner membrane translocase, subunit Tim44  39.48 
 
 		 218 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.242011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0138  import inner membrane translocase, subunit Tim44  36.1 
 
 		 221 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2676  import inner membrane translocase, subunit Tim44  37.23 
 
 		 219 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.458481  normal  0.659475 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1239  hypothetical protein  37.66 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2900  import inner membrane translocase, subunit Tim44  37.66 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.203769  normal  0.596808 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3830  import inner membrane translocase, subunit Tim44  35.62 
 
 		 226 aa  123  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.492338  normal  0.0940527 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0584  import inner membrane translocase, subunit Tim44  35.22 
 
 		 247 aa  122  4e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0642637  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3445  import inner membrane translocase  35.93 
 
 		 221 aa  122  6e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0191  import inner membrane translocase, subunit Tim44  34.93 
 
 		 235 aa  113  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2855  import inner membrane translocase, subunit Tim44  31.76 
 
 		 218 aa  112  5e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.37899  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5038  import inner membrane translocase subunit Tim44  37.34 
 
 		 199 aa  98.6  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.356912 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0778  membrane translocase, subunit Tim44  23.79 
 
 		 212 aa  92.4  6e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.132332  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2980  import inner membrane translocase, subunit Tim44  32.47 
 
 		 206 aa  91.7  9e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0107  hypothetical protein  25.64 
 
 		 216 aa  89.4  5e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.262774  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0288  import inner membrane translocase subunit Tim44  31.05 
 
 		 226 aa  88.6  7e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0482  import inner membrane translocase, subunit Tim44  31.69 
 
 		 331 aa  78.6  0.00000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0232  tim44-like domain-containing protein  20.89 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.217806  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0360  Tim44-like domain-containing protein  27.01 
 
 		 208 aa  72  0.000000000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3119  hypothetical protein  29.59 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.448764 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2938  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.6 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000555932  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1284  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.14 
 
 		 318 aa  62.4  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.45671e-16 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1091  putative lipoprotein  27.52 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000494647  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0785  import inner membrane translocase, subunit Tim44  28.09 
 
 		 314 aa  58.5  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0683467  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1927  import inner membrane translocase, subunit Tim44  28.48 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000885618  normal  0.873638 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3250  import inner membrane translocase subunit Tim44  30.1 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1788  import inner membrane translocase, subunit Tim44  25.17 
 
 		 341 aa  56.6  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000825798  normal  0.448103 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1010  import inner membrane translocase subunit Tim44  25.37 
 
 		 322 aa  56.2  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3566  import inner membrane translocase, subunit Tim44  27.7 
 
 		 317 aa  55.5  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000205074  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3295  import inner membrane translocase, subunit Tim44  25.57 
 
 		 318 aa  54.3  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081668  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1256  hypothetical protein  32.64 
 
 		 204 aa  52.4  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3607  import inner membrane translocase, subunit Tim44  22.94 
 
 		 291 aa  49.3  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0901  import inner membrane translocase, subunit Tim44  26.63 
 
 		 314 aa  48.9  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000201824  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3925  import inner membrane translocase subunit Tim44  24.24 
 
 		 287 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4117  import inner membrane translocase subunit Tim44  23.38 
 
 		 287 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4001  import inner membrane translocase subunit Tim44  23.38 
 
 		 287 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4024  import inner membrane translocase subunit Tim44  23.38 
 
 		 287 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.149443  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004023  hypothetical protein  22.55 
 
 		 290 aa  46.2  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000578853  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4340  hypothetical protein  23.61 
 
 		 291 aa  45.8  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01439  hypothetical protein  24.19 
 
 		 290 aa  45.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2207  import inner membrane translocase subunit Tim44  24.28 
 
 		 329 aa  44.3  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1550  hypothetical protein  23.65 
 
 		 291 aa  42  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0535221  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>