63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1239 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1239  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  436  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2900  import inner membrane translocase, subunit Tim44  99.54 
 
 		 219 aa  434  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.203769  normal  0.596808 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2676  import inner membrane translocase, subunit Tim44  91.78 
 
 		 219 aa  410  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.458481  normal  0.659475 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3445  import inner membrane translocase  63.8 
 
 		 221 aa  273  1.0000000000000001e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2855  import inner membrane translocase, subunit Tim44  61.47 
 
 		 218 aa  272  3e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.37899  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0191  import inner membrane translocase, subunit Tim44  66.5 
 
 		 235 aa  245  4e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2786  import inner membrane translocase, subunit Tim44  54.75 
 
 		 218 aa  236  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.242011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1374  import inner membrane translocase subunit Tim44  40.85 
 
 		 238 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.314839  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0998  import inner membrane translocase subunit Tim44  38.91 
 
 		 241 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3111  import inner membrane translocase subunit Tim44  36.25 
 
 		 260 aa  145  6e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.915706  normal  0.806338 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0400  import inner membrane translocase, subunit Tim44  35.83 
 
 		 235 aa  144  9e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0117  import inner membrane translocase, subunit Tim44  35 
 
 		 234 aa  143  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0729784  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0305  import inner membrane translocase subunit Tim44  34.73 
 
 		 235 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0299  import inner membrane translocase, subunit Tim44  35.59 
 
 		 233 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0156  hypothetical protein  33.33 
 
 		 233 aa  142  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1248  import inner membrane translocase subunit Tim44  41.45 
 
 		 247 aa  141  8e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.99982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0107  hypothetical protein  35.56 
 
 		 234 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0421  import inner membrane translocase, subunit Tim44  33.33 
 
 		 235 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2048  import inner membrane translocase subunit Tim44  35.93 
 
 		 250 aa  136  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.476328  normal  0.72544 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3608  hypothetical protein  35.85 
 
 		 219 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.765658  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4268  import inner membrane translocase subunit Tim44  36.64 
 
 		 234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.331754 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1560  import inner membrane translocase subunit Tim44  38.16 
 
 		 239 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.69866 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1839  import inner membrane translocase subunit Tim44  38.16 
 
 		 239 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.661091  normal  0.32542 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3713  import inner membrane translocase subunit Tim44  36.24 
 
 		 237 aa  132  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.500571 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3942  import inner membrane translocase subunit Tim44  36.21 
 
 		 234 aa  131  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.851876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1681  import inner membrane translocase subunit Tim44  37.66 
 
 		 242 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3216  import inner membrane translocase subunit Tim44  35.22 
 
 		 234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2016  import inner membrane translocase, subunit Tim44  35.02 
 
 		 221 aa  125  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00392424 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1142  import inner membrane translocase subunit Tim44  31.76 
 
 		 239 aa  124  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00140401 
 
 
-
 
NC_004310  BR2074  hypothetical protein  35.78 
 
 		 235 aa  124  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0009  Membrane associated transporter protein  36.68 
 
 		 232 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1994  hypothetical protein  35.32 
 
 		 231 aa  123  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.289958  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0138  import inner membrane translocase, subunit Tim44  36.7 
 
 		 221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0846  import inner membrane translocase subunit Tim44  34.56 
 
 		 231 aa  118  7.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.748239  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3485  import inner membrane translocase, subunit Tim44  34.68 
 
 		 235 aa  117  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1294  Tim44 domain-containing protein  31.65 
 
 		 230 aa  115  6e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.483295  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0584  import inner membrane translocase, subunit Tim44  31.49 
 
 		 247 aa  110  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0642637  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5038  import inner membrane translocase subunit Tim44  31.75 
 
 		 199 aa  102  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.356912 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3830  import inner membrane translocase, subunit Tim44  30.34 
 
 		 226 aa  101  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.492338  normal  0.0940527 
 
 
-
 
NC_002978  WD0107  hypothetical protein  26.85 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.262774  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0232  tim44-like domain-containing protein  22.62 
 
 		 212 aa  90.9  1e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.217806  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0288  import inner membrane translocase subunit Tim44  31.65 
 
 		 226 aa  90.5  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2980  import inner membrane translocase, subunit Tim44  30.81 
 
 		 206 aa  88.6  7e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0778  membrane translocase, subunit Tim44  23.39 
 
 		 212 aa  85.1  7e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.132332  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0360  Tim44-like domain-containing protein  29.63 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0482  import inner membrane translocase, subunit Tim44  27.91 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44351  predicted protein  21.88 
 
 		 510 aa  55.5  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3119  hypothetical protein  30.37 
 
 		 295 aa  53.5  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.448764 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_94921  MPT family transporter: inner membrane translocase (import) Tim44  21.38 
 
 		 286 aa  51.2  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.417325  normal  0.107445 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3607  import inner membrane translocase, subunit Tim44  23.47 
 
 		 291 aa  48.1  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1550  hypothetical protein  23.74 
 
 		 291 aa  47.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0535221  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3925  import inner membrane translocase subunit Tim44  22.69 
 
 		 287 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4001  import inner membrane translocase subunit Tim44  23.58 
 
 		 287 aa  45.8  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4024  import inner membrane translocase subunit Tim44  21.76 
 
 		 287 aa  45.4  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.149443  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1927  import inner membrane translocase, subunit Tim44  22.29 
 
 		 322 aa  45.1  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000885618  normal  0.873638 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1110  import inner membrane translocase subunit Tim44  26.92 
 
 		 298 aa  44.7  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.354142  normal  0.0303721 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4117  import inner membrane translocase subunit Tim44  21.76 
 
 		 287 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4340  hypothetical protein  22.22 
 
 		 291 aa  43.5  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3590  hypothetical protein  27.19 
 
 		 270 aa  43.5  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004023  hypothetical protein  25.56 
 
 		 290 aa  43.9  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000578853  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1091  putative lipoprotein  25.33 
 
 		 321 aa  43.5  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000494647  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2207  import inner membrane translocase subunit Tim44  23.58 
 
 		 329 aa  42.4  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0334  import inner membrane translocase subunit Tim44  26.27 
 
 		 321 aa  42.4  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  0.137155 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>