90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4340 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4340  hypothetical protein  100 
 
 		 291 aa  594  1e-169  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3925  import inner membrane translocase subunit Tim44  89.69 
 
 		 287 aa  488  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4024  import inner membrane translocase subunit Tim44  89.35 
 
 		 287 aa  487  1e-137  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.149443  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4117  import inner membrane translocase subunit Tim44  89 
 
 		 287 aa  487  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4001  import inner membrane translocase subunit Tim44  88.66 
 
 		 287 aa  484  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3607  import inner membrane translocase, subunit Tim44  88.47 
 
 		 291 aa  484  1e-136  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3119  hypothetical protein  77.44 
 
 		 295 aa  379  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.448764 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1004  putative transport protein  54.18 
 
 		 316 aa  269  5e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1550  hypothetical protein  48.84 
 
 		 291 aa  248  1e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0535221  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004023  hypothetical protein  48.5 
 
 		 290 aa  240  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000578853  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01439  hypothetical protein  49.33 
 
 		 290 aa  218  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1898  import inner membrane translocase subunit Tim44  37.37 
 
 		 295 aa  135  9e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.859506  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5646  import inner membrane translocase, subunit Tim44  36.67 
 
 		 292 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169336 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0990  import inner membrane translocase, subunit Tim44  35.45 
 
 		 295 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3047  import inner membrane translocase, subunit Tim44  34.69 
 
 		 272 aa  135  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3229  import inner membrane translocase subunit Tim44  36.45 
 
 		 289 aa  133  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000053282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0214  import inner membrane translocase, subunit Tim44  35.18 
 
 		 306 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.525387  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5517  hypothetical protein  32.3 
 
 		 280 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5066  import inner membrane translocase, subunit Tim44  33.79 
 
 		 281 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6329  hypothetical protein  35.86 
 
 		 281 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72930  hypothetical protein  34.83 
 
 		 285 aa  122  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0554  Tim44-like domain-contain protein  31.87 
 
 		 340 aa  122  8e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1110  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.48 
 
 		 298 aa  118  9e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.354142  normal  0.0303721 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5353  hypothetical protein  35.17 
 
 		 284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.116139  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0845  transmembrane protein  32.71 
 
 		 323 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376855  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0668  Tim44-like domain-containing protein  32.09 
 
 		 324 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2399  hypothetical protein  32.4 
 
 		 323 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0684  Tim44-like domain-containing protein  32.71 
 
 		 323 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2319  hypothetical protein  32.4 
 
 		 323 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4517  import inner membrane translocase, subunit Tim44  35.96 
 
 		 284 aa  113  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2759  hypothetical protein  32.4 
 
 		 323 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0187  hypothetical protein  32.4 
 
 		 323 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0375  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.12 
 
 		 331 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00430  Tim44-like domain protein  33.01 
 
 		 284 aa  109  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.924994  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2758  import inner membrane translocase subunit Tim44  26.3 
 
 		 343 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.778073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2731  import inner membrane translocase, subunit Tim44  26.3 
 
 		 343 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.767216  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2119  import inner membrane translocase, subunit Tim44  26.3 
 
 		 343 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434025  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5131  import inner membrane translocase subunit Tim44  34.83 
 
 		 284 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.499992  normal  0.12698 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5261  import inner membrane translocase, subunit Tim44  35.37 
 
 		 297 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0218  import inner membrane translocase subunit Tim44  33.33 
 
 		 294 aa  103  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5402  import inner membrane translocase subunit Tim44  34.83 
 
 		 284 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843666 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1256  hypothetical protein  30.19 
 
 		 204 aa  99  7e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2782  import inner membrane translocase, subunit Tim44  26.22 
 
 		 344 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2861  import inner membrane translocase subunit Tim44  31.27 
 
 		 308 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2649  import inner membrane translocase subunit Tim44  26.22 
 
 		 344 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.331938  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6058  putative transporter  25.91 
 
 		 344 aa  95.1  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4049  hypothetical protein  28.71 
 
 		 330 aa  91.3  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.631655 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2780  hypothetical protein  29.53 
 
 		 273 aa  89.7  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.300996 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0650  import inner membrane translocase subunit Tim44  29.78 
 
 		 330 aa  89.7  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.983868 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4035  import inner membrane translocase, subunit Tim44  28.81 
 
 		 288 aa  89  9e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1896  import inner membrane translocase, subunit Tim44  30.62 
 
 		 303 aa  88.2  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0839059  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0568  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.78 
 
 		 340 aa  87.4  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2065  import inner membrane translocase subunit Tim44  30.03 
 
 		 320 aa  85.5  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0100272 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1601  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.64 
 
 		 303 aa  84.7  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0773  hypothetical protein  28.99 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0372  import inner membrane translocase, subunit Tim44  29.67 
 
 		 329 aa  82  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.18784  normal  0.460564 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0432  import inner membrane translocase, subunit Tim44  27.24 
 
 		 327 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0349  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.06 
 
 		 339 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.415982 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4128  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.91 
 
 		 337 aa  78.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0106946  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1319  import inner membrane translocase, subunit Tim44  27.04 
 
 		 321 aa  77.8  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000259831  hitchhiker  0.00890559 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1736  import inner membrane translocase subunit Tim44  29.73 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000113621  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0782  import inner membrane translocase, subunit Tim44  25.6 
 
 		 330 aa  76.3  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0538  import inner membrane translocase, subunit Tim44  23.64 
 
 		 311 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3643  import inner membrane translocase, subunit Tim44  27.91 
 
 		 343 aa  72  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.115775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0861  import inner membrane translocase, subunit Tim44  23.63 
 
 		 333 aa  70.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0675238 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2096  hypothetical protein  26.76 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0739383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0303  import inner membrane translocase subunit Tim44  29.14 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000256366  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2192  hypothetical protein  28.92 
 
 		 311 aa  70.1  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.398942 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5460  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.34 
 
 		 338 aa  69.3  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.258661  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0459  hypothetical protein  29.46 
 
 		 356 aa  69.3  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.923223 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2676  hypothetical protein  29.78 
 
 		 270 aa  65.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1292  import inner membrane translocase, subunit Tim44  25.97 
 
 		 318 aa  65.1  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268135  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2548  hypothetical protein  29.41 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2523  import inner membrane translocase subunit Tim44  29.01 
 
 		 333 aa  59.3  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0253878 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0299  import inner membrane translocase, subunit Tim44  26.64 
 
 		 233 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3608  hypothetical protein  23.25 
 
 		 219 aa  53.5  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.765658  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0117  import inner membrane translocase, subunit Tim44  24.14 
 
 		 234 aa  52.4  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0729784  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0156  hypothetical protein  29.77 
 
 		 233 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0107  hypothetical protein  24.57 
 
 		 234 aa  51.2  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0421  import inner membrane translocase, subunit Tim44  26.29 
 
 		 235 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0400  import inner membrane translocase, subunit Tim44  25.86 
 
 		 235 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2676  import inner membrane translocase, subunit Tim44  21.7 
 
 		 219 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.458481  normal  0.659475 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1374  import inner membrane translocase subunit Tim44  21.58 
 
 		 238 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.314839  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0138  import inner membrane translocase, subunit Tim44  23.08 
 
 		 221 aa  45.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0482  import inner membrane translocase, subunit Tim44  25.23 
 
 		 331 aa  43.9  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3445  import inner membrane translocase  21.52 
 
 		 221 aa  43.9  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0584  import inner membrane translocase, subunit Tim44  20.52 
 
 		 247 aa  43.5  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0642637  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1142  import inner membrane translocase subunit Tim44  24.03 
 
 		 239 aa  43.1  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00140401 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0305  import inner membrane translocase subunit Tim44  21.67 
 
 		 235 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3713  import inner membrane translocase subunit Tim44  22.75 
 
 		 237 aa  42.7  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.500571 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>