79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3643 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3643  import inner membrane translocase, subunit Tim44  100 
 
 		 343 aa  678    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.115775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0797  import inner membrane translocase subunit Tim44  76.09 
 
 		 335 aa  369  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0868  import inner membrane translocase, subunit Tim44  73.47 
 
 		 335 aa  363  2e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1319  import inner membrane translocase, subunit Tim44  66.47 
 
 		 321 aa  362  4e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000259831  hitchhiker  0.00890559 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0861  import inner membrane translocase, subunit Tim44  62.11 
 
 		 333 aa  335  9e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0675238 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1292  import inner membrane translocase, subunit Tim44  59.06 
 
 		 318 aa  322  6e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268135  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4128  import inner membrane translocase subunit Tim44  60.8 
 
 		 337 aa  322  7e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0106946  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0782  import inner membrane translocase, subunit Tim44  61.65 
 
 		 330 aa  321  9.999999999999999e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5460  import inner membrane translocase subunit Tim44  64.67 
 
 		 338 aa  321  9.999999999999999e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.258661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0432  import inner membrane translocase, subunit Tim44  42.23 
 
 		 327 aa  182  7e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0349  import inner membrane translocase subunit Tim44  41.48 
 
 		 339 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.415982 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2731  import inner membrane translocase, subunit Tim44  39 
 
 		 343 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.767216  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2119  import inner membrane translocase, subunit Tim44  39 
 
 		 343 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434025  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0554  Tim44-like domain-contain protein  40.17 
 
 		 340 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2758  import inner membrane translocase subunit Tim44  38.71 
 
 		 343 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.778073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0668  Tim44-like domain-containing protein  40.35 
 
 		 324 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0845  transmembrane protein  40.64 
 
 		 323 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376855  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0375  import inner membrane translocase subunit Tim44  36 
 
 		 331 aa  168  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0684  Tim44-like domain-containing protein  40.64 
 
 		 323 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2319  hypothetical protein  40.35 
 
 		 323 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2399  hypothetical protein  40.35 
 
 		 323 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2759  hypothetical protein  40.35 
 
 		 323 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0187  hypothetical protein  40.35 
 
 		 323 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6058  putative transporter  38 
 
 		 344 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0568  import inner membrane translocase subunit Tim44  37.03 
 
 		 340 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2649  import inner membrane translocase subunit Tim44  37.94 
 
 		 344 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.331938  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0334  import inner membrane translocase subunit Tim44  42.05 
 
 		 339 aa  162  9e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.946204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2782  import inner membrane translocase, subunit Tim44  37.94 
 
 		 344 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0372  import inner membrane translocase, subunit Tim44  41.36 
 
 		 329 aa  159  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.18784  normal  0.460564 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4049  hypothetical protein  34.1 
 
 		 330 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.631655 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0650  import inner membrane translocase subunit Tim44  32.94 
 
 		 330 aa  149  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.983868 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0459  hypothetical protein  54.89 
 
 		 356 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.923223 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0218  import inner membrane translocase subunit Tim44  37.1 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4035  import inner membrane translocase, subunit Tim44  34.85 
 
 		 288 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1601  import inner membrane translocase subunit Tim44  34.86 
 
 		 303 aa  129  6e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2096  hypothetical protein  32.44 
 
 		 318 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0739383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0990  import inner membrane translocase, subunit Tim44  31.75 
 
 		 295 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1896  import inner membrane translocase, subunit Tim44  35.95 
 
 		 303 aa  117  3e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0839059  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2523  import inner membrane translocase subunit Tim44  35.09 
 
 		 333 aa  112  9e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0253878 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2780  hypothetical protein  34.5 
 
 		 273 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.300996 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2065  import inner membrane translocase subunit Tim44  30.59 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0100272 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2192  hypothetical protein  33.59 
 
 		 311 aa  100  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.398942 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3607  import inner membrane translocase, subunit Tim44  26.8 
 
 		 291 aa  97.8  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1898  import inner membrane translocase subunit Tim44  30.29 
 
 		 295 aa  94.4  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.859506  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1256  hypothetical protein  30.71 
 
 		 204 aa  90.5  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4001  import inner membrane translocase subunit Tim44  26.51 
 
 		 287 aa  90.1  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3925  import inner membrane translocase subunit Tim44  26.81 
 
 		 287 aa  89  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4024  import inner membrane translocase subunit Tim44  26.81 
 
 		 287 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.149443  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00430  Tim44-like domain protein  28.86 
 
 		 284 aa  87.4  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.924994  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4117  import inner membrane translocase subunit Tim44  26.51 
 
 		 287 aa  87.4  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0214  import inner membrane translocase, subunit Tim44  27.74 
 
 		 306 aa  86.3  7e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.525387  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5517  hypothetical protein  29.19 
 
 		 280 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5646  import inner membrane translocase, subunit Tim44  28.28 
 
 		 292 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169336 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0303  import inner membrane translocase subunit Tim44  34.35 
 
 		 283 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000256366  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4340  hypothetical protein  26.72 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0538  import inner membrane translocase, subunit Tim44  33.33 
 
 		 311 aa  82.8  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5066  import inner membrane translocase, subunit Tim44  28.61 
 
 		 281 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1004  putative transport protein  26.57 
 
 		 316 aa  82.4  0.000000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0773  hypothetical protein  32.31 
 
 		 301 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3047  import inner membrane translocase, subunit Tim44  27.88 
 
 		 272 aa  81.6  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1550  hypothetical protein  26.55 
 
 		 291 aa  79  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0535221  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1736  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.57 
 
 		 308 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000113621  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3119  hypothetical protein  28.92 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.448764 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1110  import inner membrane translocase subunit Tim44  29.8 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.354142  normal  0.0303721 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2548  hypothetical protein  25.36 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5353  hypothetical protein  28.03 
 
 		 284 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.116139  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2676  hypothetical protein  25.36 
 
 		 270 aa  75.5  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6329  hypothetical protein  28.32 
 
 		 281 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2861  import inner membrane translocase subunit Tim44  32.06 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5131  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.03 
 
 		 284 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.499992  normal  0.12698 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72930  hypothetical protein  26.59 
 
 		 285 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5261  import inner membrane translocase, subunit Tim44  27.46 
 
 		 297 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5402  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.75 
 
 		 284 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843666 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4517  import inner membrane translocase, subunit Tim44  26.49 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3229  import inner membrane translocase subunit Tim44  30.66 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000053282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01439  hypothetical protein  23.48 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004023  hypothetical protein  22.9 
 
 		 290 aa  62.8  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000578853  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1927  import inner membrane translocase, subunit Tim44  24.68 
 
 		 322 aa  47.4  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000885618  normal  0.873638 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0482  import inner membrane translocase, subunit Tim44  25 
 
 		 331 aa  45.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>