85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_0668 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_0668  Tim44-like domain-containing protein  100 
 
 
324 aa  640    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0845  transmembrane protein  98.15 
 
 
323 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376855  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2759  hypothetical protein  98.15 
 
 
323 aa  578  1e-164  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2319  hypothetical protein  98.15 
 
 
323 aa  578  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0187  hypothetical protein  98.15 
 
 
323 aa  578  1e-164  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2399  hypothetical protein  98.15 
 
 
323 aa  578  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0684  Tim44-like domain-containing protein  98.15 
 
 
323 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0554  Tim44-like domain-contain protein  90.77 
 
 
340 aa  555  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2731  import inner membrane translocase, subunit Tim44  75.08 
 
 
343 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.767216  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2119  import inner membrane translocase, subunit Tim44  75.08 
 
 
343 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434025  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2758  import inner membrane translocase subunit Tim44  74.77 
 
 
343 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.778073  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2649  import inner membrane translocase subunit Tim44  73.64 
 
 
344 aa  428  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.331938  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2782  import inner membrane translocase, subunit Tim44  73.33 
 
 
344 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6058  putative transporter  73.33 
 
 
344 aa  426  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0375  import inner membrane translocase subunit Tim44  66.57 
 
 
331 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0568  import inner membrane translocase subunit Tim44  72.64 
 
 
340 aa  392  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312734  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4049  hypothetical protein  64.55 
 
 
330 aa  346  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.631655 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0650  import inner membrane translocase subunit Tim44  65.05 
 
 
330 aa  340  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.983868 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0432  import inner membrane translocase, subunit Tim44  50.29 
 
 
327 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0349  import inner membrane translocase subunit Tim44  47.02 
 
 
339 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.415982 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0372  import inner membrane translocase, subunit Tim44  49.41 
 
 
329 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.18784  normal  0.460564 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0334  import inner membrane translocase subunit Tim44  47.02 
 
 
339 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.946204  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0459  hypothetical protein  45.43 
 
 
356 aa  211  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.923223 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2065  import inner membrane translocase subunit Tim44  45.21 
 
 
320 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0100272 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2096  hypothetical protein  42.57 
 
 
318 aa  193  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0739383  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4035  import inner membrane translocase, subunit Tim44  42.9 
 
 
288 aa  192  8e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0990  import inner membrane translocase, subunit Tim44  39.81 
 
 
295 aa  172  5e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0218  import inner membrane translocase subunit Tim44  45.14 
 
 
294 aa  172  6.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1601  import inner membrane translocase subunit Tim44  39.94 
 
 
303 aa  172  9e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2780  hypothetical protein  43.96 
 
 
273 aa  170  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.300996 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1896  import inner membrane translocase, subunit Tim44  37.99 
 
 
303 aa  169  5e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0839059  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2523  import inner membrane translocase subunit Tim44  38.49 
 
 
333 aa  158  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0253878 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2192  hypothetical protein  39.75 
 
 
311 aa  155  8e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.398942 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4128  import inner membrane translocase subunit Tim44  36.47 
 
 
337 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0106946  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0782  import inner membrane translocase, subunit Tim44  36.39 
 
 
330 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1292  import inner membrane translocase, subunit Tim44  36.34 
 
 
318 aa  147  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268135  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3643  import inner membrane translocase, subunit Tim44  38.66 
 
 
343 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.115775  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1319  import inner membrane translocase, subunit Tim44  39.18 
 
 
321 aa  142  9e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000259831  hitchhiker  0.00890559 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0861  import inner membrane translocase, subunit Tim44  36.68 
 
 
333 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0675238 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2676  hypothetical protein  33.12 
 
 
270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5460  import inner membrane translocase subunit Tim44  51.2 
 
 
338 aa  127  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.258661  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2548  hypothetical protein  32.81 
 
 
270 aa  126  5e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0868  import inner membrane translocase, subunit Tim44  44.68 
 
 
335 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0797  import inner membrane translocase subunit Tim44  44.68 
 
 
335 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5646  import inner membrane translocase, subunit Tim44  32.08 
 
 
292 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0169336 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1898  import inner membrane translocase subunit Tim44  34.25 
 
 
295 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.859506  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2861  import inner membrane translocase subunit Tim44  35.69 
 
 
308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0214  import inner membrane translocase, subunit Tim44  30.12 
 
 
306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.525387  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5517  hypothetical protein  29.97 
 
 
280 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3607  import inner membrane translocase, subunit Tim44  30.63 
 
 
291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3925  import inner membrane translocase subunit Tim44  31.8 
 
 
287 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4117  import inner membrane translocase subunit Tim44  31.19 
 
 
287 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4001  import inner membrane translocase subunit Tim44  31.19 
 
 
287 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00430  Tim44-like domain protein  31.89 
 
 
284 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.924994  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4024  import inner membrane translocase subunit Tim44  31.5 
 
 
287 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.149443  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5066  import inner membrane translocase, subunit Tim44  29.65 
 
 
281 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0773  hypothetical protein  33.64 
 
 
301 aa  106  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6329  hypothetical protein  32.34 
 
 
281 aa  106  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3047  import inner membrane translocase, subunit Tim44  32.82 
 
 
272 aa  103  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1256  hypothetical protein  35.43 
 
 
204 aa  102  9e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4340  hypothetical protein  31.58 
 
 
291 aa  101  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72930  hypothetical protein  32.35 
 
 
285 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5353  hypothetical protein  34.06 
 
 
284 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.116139  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1736  import inner membrane translocase subunit Tim44  34.74 
 
 
308 aa  99  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000113621  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3119  hypothetical protein  32.9 
 
 
295 aa  98.2  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.448764 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5131  import inner membrane translocase subunit Tim44  34.28 
 
 
284 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.499992  normal  0.12698 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0303  import inner membrane translocase subunit Tim44  30.46 
 
 
283 aa  94.7  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000256366  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1110  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.54 
 
 
298 aa  93.2  5e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.354142  normal  0.0303721 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5261  import inner membrane translocase, subunit Tim44  33.96 
 
 
297 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0538  import inner membrane translocase, subunit Tim44  30.86 
 
 
311 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1550  hypothetical protein  27.64 
 
 
291 aa  89.7  6e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0535221  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5402  import inner membrane translocase subunit Tim44  33.64 
 
 
284 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0843666 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1004  putative transport protein  26.85 
 
 
316 aa  82.4  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4517  import inner membrane translocase, subunit Tim44  34.27 
 
 
284 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3229  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.74 
 
 
289 aa  79  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000053282  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01439  hypothetical protein  24.54 
 
 
290 aa  73.6  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004023  hypothetical protein  23.53 
 
 
290 aa  72.4  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000578853  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4395  hypothetical protein  36.79 
 
 
146 aa  54.3  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.28787  normal  0.262018 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1091  putative lipoprotein  26.45 
 
 
321 aa  53.5  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000494647  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4404  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.63 
 
 
337 aa  46.6  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.583271  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0482  import inner membrane translocase, subunit Tim44  27.56 
 
 
331 aa  46.2  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0544  import inner membrane translocase subunit Tim44  24.48 
 
 
295 aa  46.2  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0138  import inner membrane translocase, subunit Tim44  28.77 
 
 
221 aa  45.8  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1927  import inner membrane translocase, subunit Tim44  24.63 
 
 
322 aa  43.5  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000885618  normal  0.873638 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0785  import inner membrane translocase, subunit Tim44  26.94 
 
 
314 aa  43.1  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0683467  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>