101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1110 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1110  import inner membrane translocase subunit Tim44  100 
 
 		 298 aa  600  1e-170  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.354142  normal  0.0303721 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0773  hypothetical protein  39 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2861  import inner membrane translocase subunit Tim44  34.63 
 
 		 308 aa  150  3e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0303  import inner membrane translocase subunit Tim44  37.64 
 
 		 283 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000256366  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1736  import inner membrane translocase subunit Tim44  34.07 
 
 		 308 aa  136  5e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000113621  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0538  import inner membrane translocase, subunit Tim44  37.37 
 
 		 311 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0990  import inner membrane translocase, subunit Tim44  33.75 
 
 		 295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3047  import inner membrane translocase, subunit Tim44  33.33 
 
 		 272 aa  124  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1256  hypothetical protein  35.65 
 
 		 204 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3925  import inner membrane translocase subunit Tim44  30.23 
 
 		 287 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4117  import inner membrane translocase subunit Tim44  29.9 
 
 		 287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4024  import inner membrane translocase subunit Tim44  29.9 
 
 		 287 aa  112  5e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.149443  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2676  hypothetical protein  30.82 
 
 		 270 aa  112  9e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4001  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.96 
 
 		 287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2548  hypothetical protein  30.82 
 
 		 270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3607  import inner membrane translocase, subunit Tim44  28.9 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4340  hypothetical protein  28.81 
 
 		 291 aa  107  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0375  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.48 
 
 		 331 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4035  import inner membrane translocase, subunit Tim44  30.26 
 
 		 288 aa  99  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0845  transmembrane protein  26.89 
 
 		 323 aa  95.9  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376855  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4049  hypothetical protein  28.66 
 
 		 330 aa  95.5  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.631655 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3119  hypothetical protein  27.7 
 
 		 295 aa  95.5  9e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.448764 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5646  import inner membrane translocase, subunit Tim44  25.89 
 
 		 292 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169336 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2119  import inner membrane translocase, subunit Tim44  28.31 
 
 		 343 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434025  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2731  import inner membrane translocase, subunit Tim44  28.31 
 
 		 343 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.767216  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0187  hypothetical protein  27.54 
 
 		 323 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2759  hypothetical protein  27.54 
 
 		 323 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2319  hypothetical protein  27.54 
 
 		 323 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2399  hypothetical protein  27.54 
 
 		 323 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3229  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.15 
 
 		 289 aa  93.6  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000053282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0650  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.59 
 
 		 330 aa  92.8  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.983868 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0432  import inner membrane translocase, subunit Tim44  28.22 
 
 		 327 aa  92.4  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2758  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.01 
 
 		 343 aa  92.4  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.778073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0554  Tim44-like domain-contain protein  28.35 
 
 		 340 aa  91.7  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1004  putative transport protein  24.1 
 
 		 316 aa  92  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2782  import inner membrane translocase, subunit Tim44  39.2 
 
 		 344 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0668  Tim44-like domain-containing protein  26.47 
 
 		 324 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2649  import inner membrane translocase subunit Tim44  39.2 
 
 		 344 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.331938  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0349  import inner membrane translocase subunit Tim44  36.8 
 
 		 339 aa  90.9  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.415982 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1898  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.2 
 
 		 295 aa  91.3  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.859506  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6058  putative transporter  40 
 
 		 344 aa  90.1  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0684  Tim44-like domain-containing protein  26.89 
 
 		 323 aa  90.1  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0334  import inner membrane translocase subunit Tim44  36.8 
 
 		 339 aa  90.1  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.946204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004023  hypothetical protein  23.1 
 
 		 290 aa  89.7  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000578853  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0218  import inner membrane translocase subunit Tim44  30 
 
 		 294 aa  89  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0372  import inner membrane translocase, subunit Tim44  37.1 
 
 		 329 aa  87.4  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.18784  normal  0.460564 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5066  import inner membrane translocase, subunit Tim44  25.5 
 
 		 281 aa  87  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0459  hypothetical protein  35.2 
 
 		 356 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.923223 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2192  hypothetical protein  37.32 
 
 		 311 aa  85.1  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.398942 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0214  import inner membrane translocase, subunit Tim44  25.93 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.525387  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1550  hypothetical protein  25.26 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0535221  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01439  hypothetical protein  23.94 
 
 		 290 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0568  import inner membrane translocase subunit Tim44  39.67 
 
 		 340 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2523  import inner membrane translocase subunit Tim44  38.19 
 
 		 333 aa  83.2  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0253878 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5517  hypothetical protein  24.16 
 
 		 280 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1601  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.28 
 
 		 303 aa  81.3  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1896  import inner membrane translocase, subunit Tim44  27.78 
 
 		 303 aa  79  0.00000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0839059  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0782  import inner membrane translocase, subunit Tim44  27.13 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2096  hypothetical protein  30 
 
 		 318 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0739383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72930  hypothetical protein  25.41 
 
 		 285 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1319  import inner membrane translocase, subunit Tim44  26.58 
 
 		 321 aa  75.5  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000259831  hitchhiker  0.00890559 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2065  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.33 
 
 		 320 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0100272 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3643  import inner membrane translocase, subunit Tim44  29.8 
 
 		 343 aa  74.7  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.115775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6329  hypothetical protein  24.16 
 
 		 281 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1292  import inner membrane translocase, subunit Tim44  26.69 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268135  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5460  import inner membrane translocase subunit Tim44  34.35 
 
 		 338 aa  73.2  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.258661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4517  import inner membrane translocase, subunit Tim44  25.5 
 
 		 284 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0868  import inner membrane translocase, subunit Tim44  31.54 
 
 		 335 aa  72  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0797  import inner membrane translocase subunit Tim44  31.54 
 
 		 335 aa  72  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4128  import inner membrane translocase subunit Tim44  25.93 
 
 		 337 aa  71.2  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0106946  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2780  hypothetical protein  32 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.300996 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5353  hypothetical protein  26.14 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.116139  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0861  import inner membrane translocase, subunit Tim44  28.68 
 
 		 333 aa  67.4  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0675238 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5261  import inner membrane translocase, subunit Tim44  26.07 
 
 		 297 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00430  Tim44-like domain protein  27.45 
 
 		 284 aa  65.9  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.924994  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5131  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.03 
 
 		 284 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.499992  normal  0.12698 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5402  import inner membrane translocase subunit Tim44  25.5 
 
 		 284 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843666 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2676  import inner membrane translocase, subunit Tim44  26.94 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.458481  normal  0.659475 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2786  import inner membrane translocase, subunit Tim44  28.97 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.242011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2900  import inner membrane translocase, subunit Tim44  26.64 
 
 		 219 aa  57  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.203769  normal  0.596808 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0482  import inner membrane translocase, subunit Tim44  23.5 
 
 		 331 aa  54.3  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3445  import inner membrane translocase  26.94 
 
 		 221 aa  54.7  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1239  hypothetical protein  26.17 
 
 		 219 aa  53.9  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3268  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.97 
 
 		 325 aa  52  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1788  import inner membrane translocase, subunit Tim44  23.98 
 
 		 341 aa  50.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000825798  normal  0.448103 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1248  import inner membrane translocase subunit Tim44  23.45 
 
 		 247 aa  48.5  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.99982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3768  import inner membrane translocase, subunit Tim44  26.62 
 
 		 338 aa  45.8  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2855  import inner membrane translocase, subunit Tim44  22.44 
 
 		 218 aa  45.1  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.37899  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1091  putative lipoprotein  25 
 
 		 321 aa  44.3  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000494647  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3830  import inner membrane translocase, subunit Tim44  27.1 
 
 		 226 aa  43.9  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.492338  normal  0.0940527 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3216  import inner membrane translocase subunit Tim44  25.93 
 
 		 234 aa  43.5  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0584  import inner membrane translocase, subunit Tim44  25.58 
 
 		 247 aa  43.1  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0642637  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2016  import inner membrane translocase, subunit Tim44  25.11 
 
 		 221 aa  43.5  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00392424 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0138  import inner membrane translocase, subunit Tim44  23.44 
 
 		 221 aa  43.1  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0156  hypothetical protein  20.7 
 
 		 233 aa  43.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3713  import inner membrane translocase subunit Tim44  23.56 
 
 		 237 aa  43.5  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.500571 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4404  import inner membrane translocase subunit Tim44  23.74 
 
 		 337 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.583271  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0846  import inner membrane translocase subunit Tim44  21.97 
 
 		 231 aa  43.1  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.748239  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3295  import inner membrane translocase, subunit Tim44  21.92 
 
 		 318 aa  42.7  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081668  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3485  import inner membrane translocase, subunit Tim44  24.09 
 
 		 235 aa  42.4  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>