47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4395 on replicon NC_008757
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008757  Pnap_4395  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  295  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.28787  normal  0.262018 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4035  import inner membrane translocase, subunit Tim44  39.62 
 
 		 288 aa  77.8  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0990  import inner membrane translocase, subunit Tim44  35.17 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2523  import inner membrane translocase subunit Tim44  33.99 
 
 		 333 aa  71.6  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0253878 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0218  import inner membrane translocase subunit Tim44  40 
 
 		 294 aa  70.9  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2780  hypothetical protein  36.19 
 
 		 273 aa  63.9  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.300996 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2192  hypothetical protein  37.38 
 
 		 311 aa  60.8  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.398942 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0372  import inner membrane translocase, subunit Tim44  34.29 
 
 		 329 aa  60.5  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.18784  normal  0.460564 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0650  import inner membrane translocase subunit Tim44  31.25 
 
 		 330 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.983868 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0432  import inner membrane translocase, subunit Tim44  33.33 
 
 		 327 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0349  import inner membrane translocase subunit Tim44  33.02 
 
 		 339 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.415982 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0334  import inner membrane translocase subunit Tim44  33.02 
 
 		 339 aa  58.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.946204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4049  hypothetical protein  30.82 
 
 		 330 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.631655 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0459  hypothetical protein  33.02 
 
 		 356 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.923223 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2649  import inner membrane translocase subunit Tim44  34.91 
 
 		 344 aa  57  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.331938  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2782  import inner membrane translocase, subunit Tim44  34.91 
 
 		 344 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0568  import inner membrane translocase subunit Tim44  36.45 
 
 		 340 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0538  import inner membrane translocase, subunit Tim44  32.71 
 
 		 311 aa  55.1  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0668  Tim44-like domain-containing protein  34.91 
 
 		 324 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0554  Tim44-like domain-contain protein  35.85 
 
 		 340 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2758  import inner membrane translocase subunit Tim44  34.92 
 
 		 343 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.778073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0845  transmembrane protein  34.91 
 
 		 323 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376855  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2119  import inner membrane translocase, subunit Tim44  33.96 
 
 		 343 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434025  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2731  import inner membrane translocase, subunit Tim44  33.96 
 
 		 343 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.767216  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0684  Tim44-like domain-containing protein  34.91 
 
 		 323 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2399  hypothetical protein  34.91 
 
 		 323 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0187  hypothetical protein  34.91 
 
 		 323 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2759  hypothetical protein  34.91 
 
 		 323 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2319  hypothetical protein  34.91 
 
 		 323 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6058  putative transporter  33.96 
 
 		 344 aa  53.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0375  import inner membrane translocase subunit Tim44  33.33 
 
 		 331 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2861  import inner membrane translocase subunit Tim44  31.78 
 
 		 308 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2065  import inner membrane translocase subunit Tim44  33.03 
 
 		 320 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0100272 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0773  hypothetical protein  30.84 
 
 		 301 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2096  hypothetical protein  31.85 
 
 		 318 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0739383  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2676  hypothetical protein  30.77 
 
 		 270 aa  50.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1898  import inner membrane translocase subunit Tim44  31.43 
 
 		 295 aa  48.9  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.859506  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2548  hypothetical protein  29.81 
 
 		 270 aa  47.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0861  import inner membrane translocase, subunit Tim44  25.33 
 
 		 333 aa  47.4  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0675238 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1601  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.78 
 
 		 303 aa  47.4  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1256  hypothetical protein  33.03 
 
 		 204 aa  47.4  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0782  import inner membrane translocase, subunit Tim44  26.62 
 
 		 330 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4128  import inner membrane translocase subunit Tim44  26.43 
 
 		 337 aa  45.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0106946  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5460  import inner membrane translocase subunit Tim44  23.66 
 
 		 338 aa  44.3  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.258661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1896  import inner membrane translocase, subunit Tim44  26.85 
 
 		 303 aa  43.9  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0839059  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3643  import inner membrane translocase, subunit Tim44  25.23 
 
 		 343 aa  41.2  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.115775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0214  import inner membrane translocase, subunit Tim44  26.6 
 
 		 306 aa  40.4  0.008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.525387  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>