100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2780 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2780  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  546  1e-154  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.300996 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4035  import inner membrane translocase, subunit Tim44  53.26 
 
 		 288 aa  250  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0218  import inner membrane translocase subunit Tim44  53.54 
 
 		 294 aa  242  6e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0375  import inner membrane translocase subunit Tim44  41.35 
 
 		 331 aa  210  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0845  transmembrane protein  44.07 
 
 		 323 aa  206  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376855  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2399  hypothetical protein  44.07 
 
 		 323 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0187  hypothetical protein  44.07 
 
 		 323 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2319  hypothetical protein  44.07 
 
 		 323 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2759  hypothetical protein  44.07 
 
 		 323 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0668  Tim44-like domain-containing protein  43.94 
 
 		 324 aa  205  7e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0554  Tim44-like domain-contain protein  42.63 
 
 		 340 aa  203  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0684  Tim44-like domain-containing protein  44.07 
 
 		 323 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2192  hypothetical protein  48.86 
 
 		 311 aa  194  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.398942 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2523  import inner membrane translocase subunit Tim44  42.9 
 
 		 333 aa  194  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0253878 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2758  import inner membrane translocase subunit Tim44  40.38 
 
 		 343 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.778073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2119  import inner membrane translocase, subunit Tim44  40.38 
 
 		 343 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434025  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2731  import inner membrane translocase, subunit Tim44  40.38 
 
 		 343 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.767216  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2782  import inner membrane translocase, subunit Tim44  39.17 
 
 		 344 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2649  import inner membrane translocase subunit Tim44  39.17 
 
 		 344 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.331938  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6058  putative transporter  38.75 
 
 		 344 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4049  hypothetical protein  39.29 
 
 		 330 aa  183  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.631655 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0650  import inner membrane translocase subunit Tim44  39.29 
 
 		 330 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.983868 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0568  import inner membrane translocase subunit Tim44  39.94 
 
 		 340 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0432  import inner membrane translocase, subunit Tim44  38.63 
 
 		 327 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0990  import inner membrane translocase, subunit Tim44  41.98 
 
 		 295 aa  167  1e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0372  import inner membrane translocase, subunit Tim44  37.61 
 
 		 329 aa  153  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.18784  normal  0.460564 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2096  hypothetical protein  37.59 
 
 		 318 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0739383  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2548  hypothetical protein  36.73 
 
 		 270 aa  148  7e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2676  hypothetical protein  36.36 
 
 		 270 aa  146  3e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2065  import inner membrane translocase subunit Tim44  36.55 
 
 		 320 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0100272 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1601  import inner membrane translocase subunit Tim44  34.33 
 
 		 303 aa  141  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1896  import inner membrane translocase, subunit Tim44  35.33 
 
 		 303 aa  139  7e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0839059  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0459  hypothetical protein  51.22 
 
 		 356 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.923223 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0861  import inner membrane translocase, subunit Tim44  35.45 
 
 		 333 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0675238 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0334  import inner membrane translocase subunit Tim44  52.03 
 
 		 339 aa  136  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.946204  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0349  import inner membrane translocase subunit Tim44  52.03 
 
 		 339 aa  136  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.415982 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0782  import inner membrane translocase, subunit Tim44  32.43 
 
 		 330 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1292  import inner membrane translocase, subunit Tim44  33.96 
 
 		 318 aa  124  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268135  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4128  import inner membrane translocase subunit Tim44  34.33 
 
 		 337 aa  123  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0106946  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2861  import inner membrane translocase subunit Tim44  34.31 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1898  import inner membrane translocase subunit Tim44  35.54 
 
 		 295 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.859506  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1319  import inner membrane translocase, subunit Tim44  35.2 
 
 		 321 aa  119  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000259831  hitchhiker  0.00890559 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0214  import inner membrane translocase, subunit Tim44  31.78 
 
 		 306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.525387  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5460  import inner membrane translocase subunit Tim44  42.52 
 
 		 338 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.258661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0538  import inner membrane translocase, subunit Tim44  32.9 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3643  import inner membrane translocase, subunit Tim44  33.53 
 
 		 343 aa  106  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.115775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5066  import inner membrane translocase, subunit Tim44  29.12 
 
 		 281 aa  106  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0303  import inner membrane translocase subunit Tim44  34.73 
 
 		 283 aa  103  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000256366  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5517  hypothetical protein  29.97 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1550  hypothetical protein  30.17 
 
 		 291 aa  103  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0535221  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3119  hypothetical protein  34.33 
 
 		 295 aa  102  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.448764 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0797  import inner membrane translocase subunit Tim44  41.73 
 
 		 335 aa  102  6e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0868  import inner membrane translocase, subunit Tim44  41.73 
 
 		 335 aa  102  6e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3229  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.08 
 
 		 289 aa  100  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000053282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72930  hypothetical protein  29.76 
 
 		 285 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5646  import inner membrane translocase, subunit Tim44  28.9 
 
 		 292 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169336 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3925  import inner membrane translocase subunit Tim44  29.59 
 
 		 287 aa  99.4  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3607  import inner membrane translocase, subunit Tim44  29.29 
 
 		 291 aa  98.6  9e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1004  putative transport protein  30.13 
 
 		 316 aa  98.6  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4001  import inner membrane translocase subunit Tim44  31.31 
 
 		 287 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4024  import inner membrane translocase subunit Tim44  29.59 
 
 		 287 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.149443  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4117  import inner membrane translocase subunit Tim44  30.64 
 
 		 287 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0773  hypothetical protein  30.94 
 
 		 301 aa  96.7  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6329  hypothetical protein  30.53 
 
 		 281 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4340  hypothetical protein  27.74 
 
 		 291 aa  94  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00430  Tim44-like domain protein  30.24 
 
 		 284 aa  92  8e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.924994  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004023  hypothetical protein  28.91 
 
 		 290 aa  92  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000578853  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3047  import inner membrane translocase, subunit Tim44  31.32 
 
 		 272 aa  89.7  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1736  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.1 
 
 		 308 aa  89.7  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000113621  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1256  hypothetical protein  33.85 
 
 		 204 aa  88.2  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01439  hypothetical protein  29.59 
 
 		 290 aa  87  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5353  hypothetical protein  31.27 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.116139  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4517  import inner membrane translocase, subunit Tim44  31.65 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1110  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.96 
 
 		 298 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.354142  normal  0.0303721 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5261  import inner membrane translocase, subunit Tim44  31.27 
 
 		 297 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5131  import inner membrane translocase subunit Tim44  30.03 
 
 		 284 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.499992  normal  0.12698 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5402  import inner membrane translocase subunit Tim44  31.96 
 
 		 284 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843666 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4404  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.45 
 
 		 337 aa  65.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.583271  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4395  hypothetical protein  36.19 
 
 		 146 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.28787  normal  0.262018 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0334  import inner membrane translocase subunit Tim44  31.68 
 
 		 321 aa  58.9  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  0.137155 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1091  putative lipoprotein  27.71 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000494647  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2211  import inner membrane translocase subunit Tim44  30.05 
 
 		 318 aa  57  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.895169  normal  0.192893 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1927  import inner membrane translocase, subunit Tim44  24.63 
 
 		 322 aa  52.4  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000885618  normal  0.873638 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1701  import inner membrane translocase, subunit Tim44  26.7 
 
 		 331 aa  52.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2207  import inner membrane translocase subunit Tim44  30.51 
 
 		 329 aa  51.6  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1788  import inner membrane translocase, subunit Tim44  26.28 
 
 		 341 aa  51.2  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000825798  normal  0.448103 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2529  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.29 
 
 		 319 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0311  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.5 
 
 		 320 aa  49.7  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.0470868 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0138  import inner membrane translocase, subunit Tim44  30.11 
 
 		 221 aa  49.3  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2254  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.78 
 
 		 319 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.349216  normal  0.0696359 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2165  hypothetical protein  25 
 
 		 312 aa  49.3  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.810394 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3268  import inner membrane translocase subunit Tim44  33.76 
 
 		 325 aa  47.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5103  import inner membrane translocase subunit Tim44  31.55 
 
 		 316 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3445  import inner membrane translocase  26.92 
 
 		 221 aa  46.6  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0901  import inner membrane translocase, subunit Tim44  22.95 
 
 		 314 aa  46.2  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000201824  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0785  import inner membrane translocase, subunit Tim44  23.12 
 
 		 314 aa  45.4  0.0009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0683467  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1284  import inner membrane translocase subunit Tim44  23.57 
 
 		 318 aa  45.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.45671e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2938  import inner membrane translocase subunit Tim44  23.89 
 
 		 318 aa  43.5  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000555932  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6540  import inner membrane translocase subunit Tim44  25.86 
 
 		 332 aa  43.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.398166  normal  0.199544 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2567  import inner membrane translocase, subunit Tim44  25.47 
 
 		 312 aa  42.7  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>