97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3607 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3607  import inner membrane translocase, subunit Tim44  100 
 
 		 291 aa  597  1e-170  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4117  import inner membrane translocase subunit Tim44  90.38 
 
 		 287 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4001  import inner membrane translocase subunit Tim44  89.35 
 
 		 287 aa  487  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3925  import inner membrane translocase subunit Tim44  89.69 
 
 		 287 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4024  import inner membrane translocase subunit Tim44  89.35 
 
 		 287 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.149443  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4340  hypothetical protein  83.73 
 
 		 291 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3119  hypothetical protein  73.75 
 
 		 295 aa  366  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.448764 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1004  putative transport protein  51.51 
 
 		 316 aa  256  4e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004023  hypothetical protein  48.49 
 
 		 290 aa  243  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000578853  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1550  hypothetical protein  48.83 
 
 		 291 aa  241  9e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0535221  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01439  hypothetical protein  46.15 
 
 		 290 aa  226  4e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5646  import inner membrane translocase, subunit Tim44  35.53 
 
 		 292 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169336 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0990  import inner membrane translocase, subunit Tim44  34.32 
 
 		 295 aa  135  8e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5066  import inner membrane translocase, subunit Tim44  34.47 
 
 		 281 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5517  hypothetical protein  35.84 
 
 		 280 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3047  import inner membrane translocase, subunit Tim44  34.13 
 
 		 272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3229  import inner membrane translocase subunit Tim44  35.31 
 
 		 289 aa  129  5.0000000000000004e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000053282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1898  import inner membrane translocase subunit Tim44  36.27 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.859506  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0214  import inner membrane translocase, subunit Tim44  33.87 
 
 		 306 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.525387  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6329  hypothetical protein  34.35 
 
 		 281 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0554  Tim44-like domain-contain protein  31.66 
 
 		 340 aa  122  8e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72930  hypothetical protein  33.67 
 
 		 285 aa  122  8e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5353  hypothetical protein  36.39 
 
 		 284 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.116139  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1110  import inner membrane translocase subunit Tim44  29.24 
 
 		 298 aa  113  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.354142  normal  0.0303721 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0375  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.16 
 
 		 331 aa  112  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0668  Tim44-like domain-containing protein  32.09 
 
 		 324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4517  import inner membrane translocase, subunit Tim44  35.47 
 
 		 284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0845  transmembrane protein  31.87 
 
 		 323 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376855  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00430  Tim44-like domain protein  31.65 
 
 		 284 aa  111  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.924994  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2759  hypothetical protein  31.87 
 
 		 323 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2399  hypothetical protein  31.87 
 
 		 323 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2319  hypothetical protein  31.87 
 
 		 323 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0187  hypothetical protein  31.87 
 
 		 323 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0684  Tim44-like domain-containing protein  31.87 
 
 		 323 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2758  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.87 
 
 		 343 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.778073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2119  import inner membrane translocase, subunit Tim44  27.87 
 
 		 343 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434025  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2731  import inner membrane translocase, subunit Tim44  27.87 
 
 		 343 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.767216  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2861  import inner membrane translocase subunit Tim44  29.49 
 
 		 308 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5131  import inner membrane translocase subunit Tim44  34.47 
 
 		 284 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.499992  normal  0.12698 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5261  import inner membrane translocase, subunit Tim44  34.01 
 
 		 297 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0218  import inner membrane translocase subunit Tim44  30.49 
 
 		 294 aa  98.2  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2782  import inner membrane translocase, subunit Tim44  27.12 
 
 		 344 aa  96.7  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0303  import inner membrane translocase subunit Tim44  30.6 
 
 		 283 aa  96.7  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000256366  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2649  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.12 
 
 		 344 aa  96.3  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.331938  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5402  import inner membrane translocase subunit Tim44  33.45 
 
 		 284 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843666 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1256  hypothetical protein  29.25 
 
 		 204 aa  94  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6058  putative transporter  27.04 
 
 		 344 aa  92.8  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0568  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.08 
 
 		 340 aa  92.4  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0650  import inner membrane translocase subunit Tim44  29.06 
 
 		 330 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.983868 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4049  hypothetical protein  29.21 
 
 		 330 aa  89  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.631655 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1896  import inner membrane translocase, subunit Tim44  30.88 
 
 		 303 aa  89  9e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0839059  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0372  import inner membrane translocase, subunit Tim44  30.62 
 
 		 329 aa  88.2  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.18784  normal  0.460564 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2780  hypothetical protein  29.1 
 
 		 273 aa  87.4  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.300996 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0432  import inner membrane translocase, subunit Tim44  28.31 
 
 		 327 aa  85.9  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2065  import inner membrane translocase subunit Tim44  30.24 
 
 		 320 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0100272 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4128  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.28 
 
 		 337 aa  84.7  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0106946  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1601  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.4 
 
 		 303 aa  83.6  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0773  hypothetical protein  30.52 
 
 		 301 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0349  import inner membrane translocase subunit Tim44  26.69 
 
 		 339 aa  82.4  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.415982 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4035  import inner membrane translocase, subunit Tim44  26.67 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1319  import inner membrane translocase, subunit Tim44  26.72 
 
 		 321 aa  77.8  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000259831  hitchhiker  0.00890559 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0782  import inner membrane translocase, subunit Tim44  25.97 
 
 		 330 aa  77.4  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2096  hypothetical protein  27.99 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0739383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1736  import inner membrane translocase subunit Tim44  30.33 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000113621  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3643  import inner membrane translocase, subunit Tim44  26.42 
 
 		 343 aa  75.9  0.0000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.115775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2192  hypothetical protein  26.3 
 
 		 311 aa  75.1  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.398942 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2548  hypothetical protein  28.62 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2676  hypothetical protein  28.62 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0861  import inner membrane translocase, subunit Tim44  24.47 
 
 		 333 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0675238 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1292  import inner membrane translocase, subunit Tim44  25.76 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268135  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0334  import inner membrane translocase subunit Tim44  26.19 
 
 		 339 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.946204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0868  import inner membrane translocase, subunit Tim44  29.46 
 
 		 335 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0797  import inner membrane translocase subunit Tim44  29.46 
 
 		 335 aa  70.9  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5460  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.12 
 
 		 338 aa  70.5  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.258661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0538  import inner membrane translocase, subunit Tim44  23.38 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0459  hypothetical protein  33.59 
 
 		 356 aa  69.7  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.923223 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0299  import inner membrane translocase, subunit Tim44  27.73 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2523  import inner membrane translocase subunit Tim44  25.75 
 
 		 333 aa  56.2  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0253878 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0421  import inner membrane translocase, subunit Tim44  26.72 
 
 		 235 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0156  hypothetical protein  27.39 
 
 		 233 aa  54.3  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0107  hypothetical protein  25.64 
 
 		 234 aa  53.1  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0400  import inner membrane translocase, subunit Tim44  25.86 
 
 		 235 aa  52.8  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2676  import inner membrane translocase, subunit Tim44  22.17 
 
 		 219 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.458481  normal  0.659475 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0117  import inner membrane translocase, subunit Tim44  24.03 
 
 		 234 aa  51.2  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0729784  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3445  import inner membrane translocase  22.58 
 
 		 221 aa  50.8  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2855  import inner membrane translocase, subunit Tim44  22.52 
 
 		 218 aa  50.8  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.37899  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3608  hypothetical protein  23.14 
 
 		 219 aa  50.8  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.765658  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0482  import inner membrane translocase, subunit Tim44  25.71 
 
 		 331 aa  48.9  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0305  import inner membrane translocase subunit Tim44  24.24 
 
 		 235 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1374  import inner membrane translocase subunit Tim44  23.63 
 
 		 238 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.314839  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1239  hypothetical protein  23.94 
 
 		 219 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2900  import inner membrane translocase, subunit Tim44  23.94 
 
 		 219 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.203769  normal  0.596808 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2786  import inner membrane translocase, subunit Tim44  25.89 
 
 		 218 aa  46.6  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.242011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0138  import inner membrane translocase, subunit Tim44  23.26 
 
 		 221 aa  45.8  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0998  import inner membrane translocase subunit Tim44  21.63 
 
 		 241 aa  44.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3713  import inner membrane translocase subunit Tim44  24.45 
 
 		 237 aa  43.9  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.500571 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1142  import inner membrane translocase subunit Tim44  22.37 
 
 		 239 aa  43.1  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00140401 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>