58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1142 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1142  import inner membrane translocase subunit Tim44  100 
 
 		 239 aa  479  1e-134  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00140401 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0299  import inner membrane translocase, subunit Tim44  48.1 
 
 		 233 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0421  import inner membrane translocase, subunit Tim44  46.44 
 
 		 235 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0305  import inner membrane translocase subunit Tim44  46.44 
 
 		 235 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0156  hypothetical protein  46.22 
 
 		 233 aa  214  8e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1839  import inner membrane translocase subunit Tim44  48.95 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.661091  normal  0.32542 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1560  import inner membrane translocase subunit Tim44  48.95 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.69866 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0117  import inner membrane translocase, subunit Tim44  45.8 
 
 		 234 aa  211  5.999999999999999e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0729784  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1374  import inner membrane translocase subunit Tim44  45.15 
 
 		 238 aa  211  7e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.314839  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3713  import inner membrane translocase subunit Tim44  47.23 
 
 		 237 aa  211  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.500571 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0400  import inner membrane translocase, subunit Tim44  45.23 
 
 		 235 aa  210  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0998  import inner membrane translocase subunit Tim44  45.99 
 
 		 241 aa  210  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0107  hypothetical protein  44.54 
 
 		 234 aa  207  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3485  import inner membrane translocase, subunit Tim44  44.07 
 
 		 235 aa  206  4e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1681  import inner membrane translocase subunit Tim44  47.52 
 
 		 242 aa  203  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2048  import inner membrane translocase subunit Tim44  43.64 
 
 		 250 aa  203  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.476328  normal  0.72544 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3111  import inner membrane translocase subunit Tim44  45.42 
 
 		 260 aa  202  3e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.915706  normal  0.806338 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0009  Membrane associated transporter protein  43.97 
 
 		 232 aa  192  5e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4268  import inner membrane translocase subunit Tim44  43.78 
 
 		 234 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.331754 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3942  import inner membrane translocase subunit Tim44  43.78 
 
 		 234 aa  188  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.851876  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2074  hypothetical protein  44.59 
 
 		 235 aa  187  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1994  hypothetical protein  44.14 
 
 		 231 aa  185  6e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.289958  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1248  import inner membrane translocase subunit Tim44  44.64 
 
 		 247 aa  184  8e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.99982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3216  import inner membrane translocase subunit Tim44  41.84 
 
 		 234 aa  181  6e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0846  import inner membrane translocase subunit Tim44  43.05 
 
 		 231 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.748239  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1294  Tim44 domain-containing protein  37.18 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.483295  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3608  hypothetical protein  36.52 
 
 		 219 aa  143  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.765658  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2016  import inner membrane translocase, subunit Tim44  37.61 
 
 		 221 aa  142  4e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00392424 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2855  import inner membrane translocase, subunit Tim44  33.77 
 
 		 218 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.37899  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0584  import inner membrane translocase, subunit Tim44  38.1 
 
 		 247 aa  135  8e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0642637  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0138  import inner membrane translocase, subunit Tim44  37.87 
 
 		 221 aa  134  9e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2676  import inner membrane translocase, subunit Tim44  32.62 
 
 		 219 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.458481  normal  0.659475 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2786  import inner membrane translocase, subunit Tim44  35.44 
 
 		 218 aa  131  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.242011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3830  import inner membrane translocase, subunit Tim44  33.91 
 
 		 226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.492338  normal  0.0940527 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1239  hypothetical protein  30.9 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2900  import inner membrane translocase, subunit Tim44  30.9 
 
 		 219 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.203769  normal  0.596808 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3445  import inner membrane translocase  29.75 
 
 		 221 aa  122  5e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0191  import inner membrane translocase, subunit Tim44  33.18 
 
 		 235 aa  113  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0288  import inner membrane translocase subunit Tim44  31.82 
 
 		 226 aa  95.9  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0778  membrane translocase, subunit Tim44  24.77 
 
 		 212 aa  95.1  9e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.132332  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0232  tim44-like domain-containing protein  24.77 
 
 		 212 aa  93.6  2e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.217806  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5038  import inner membrane translocase subunit Tim44  31.7 
 
 		 199 aa  91.3  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.356912 
 
 
-
 
NC_002978  WD0107  hypothetical protein  30.28 
 
 		 216 aa  87  3e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.262774  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2980  import inner membrane translocase, subunit Tim44  31.74 
 
 		 206 aa  86.7  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0482  import inner membrane translocase, subunit Tim44  26.81 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0360  Tim44-like domain-containing protein  28.12 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4001  import inner membrane translocase subunit Tim44  23.83 
 
 		 287 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4117  import inner membrane translocase subunit Tim44  23.4 
 
 		 287 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3119  hypothetical protein  22.37 
 
 		 295 aa  49.3  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.448764 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3925  import inner membrane translocase subunit Tim44  22.98 
 
 		 287 aa  49.3  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4024  import inner membrane translocase subunit Tim44  22.98 
 
 		 287 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.149443  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4340  hypothetical protein  24.02 
 
 		 291 aa  47.8  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0334  import inner membrane translocase subunit Tim44  31.01 
 
 		 321 aa  46.2  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  0.137155 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33251  predicted protein  24.18 
 
 		 221 aa  45.4  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3607  import inner membrane translocase, subunit Tim44  22.57 
 
 		 291 aa  44.7  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2207  import inner membrane translocase subunit Tim44  30 
 
 		 329 aa  45.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004023  hypothetical protein  22.57 
 
 		 290 aa  43.1  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000578853  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1269  hypothetical protein  29.73 
 
 		 342 aa  42  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.753871  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>