66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0117 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0117  import inner membrane translocase, subunit Tim44  100 
 
 		 234 aa  475  1e-133  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0729784  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0107  hypothetical protein  89.66 
 
 		 234 aa  426  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0299  import inner membrane translocase, subunit Tim44  75.86 
 
 		 233 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0421  import inner membrane translocase, subunit Tim44  74.25 
 
 		 235 aa  362  3e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0400  import inner membrane translocase, subunit Tim44  72.96 
 
 		 235 aa  353  2e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0305  import inner membrane translocase subunit Tim44  73.82 
 
 		 235 aa  350  1e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0156  hypothetical protein  71.55 
 
 		 233 aa  347  1e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2048  import inner membrane translocase subunit Tim44  54.74 
 
 		 250 aa  255  5e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.476328  normal  0.72544 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1374  import inner membrane translocase subunit Tim44  49.36 
 
 		 238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.314839  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3216  import inner membrane translocase subunit Tim44  48.51 
 
 		 234 aa  223  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0998  import inner membrane translocase subunit Tim44  47.68 
 
 		 241 aa  222  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3713  import inner membrane translocase subunit Tim44  49.15 
 
 		 237 aa  221  7e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.500571 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3485  import inner membrane translocase, subunit Tim44  48.93 
 
 		 235 aa  219  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1839  import inner membrane translocase subunit Tim44  47.23 
 
 		 239 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.661091  normal  0.32542 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1560  import inner membrane translocase subunit Tim44  47.23 
 
 		 239 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.69866 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1681  import inner membrane translocase subunit Tim44  46.81 
 
 		 242 aa  211  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3942  import inner membrane translocase subunit Tim44  48.51 
 
 		 234 aa  208  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.851876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0009  Membrane associated transporter protein  48.31 
 
 		 232 aa  207  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4268  import inner membrane translocase subunit Tim44  48.51 
 
 		 234 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.331754 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1248  import inner membrane translocase subunit Tim44  48.91 
 
 		 247 aa  202  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.99982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0846  import inner membrane translocase subunit Tim44  48.43 
 
 		 231 aa  202  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.748239  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1142  import inner membrane translocase subunit Tim44  45.76 
 
 		 239 aa  202  3e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00140401 
 
 
-
 
NC_004310  BR2074  hypothetical protein  45.61 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1994  hypothetical protein  45.18 
 
 		 231 aa  196  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.289958  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1294  Tim44 domain-containing protein  41.67 
 
 		 230 aa  186  3e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.483295  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3111  import inner membrane translocase subunit Tim44  41.25 
 
 		 260 aa  179  2.9999999999999997e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.915706  normal  0.806338 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3608  hypothetical protein  38.36 
 
 		 219 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.765658  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1239  hypothetical protein  35 
 
 		 219 aa  143  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2900  import inner membrane translocase, subunit Tim44  34.58 
 
 		 219 aa  141  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.203769  normal  0.596808 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2676  import inner membrane translocase, subunit Tim44  34.17 
 
 		 219 aa  138  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.458481  normal  0.659475 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2786  import inner membrane translocase, subunit Tim44  35.74 
 
 		 218 aa  136  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.242011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2016  import inner membrane translocase, subunit Tim44  37.28 
 
 		 221 aa  134  9e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00392424 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2855  import inner membrane translocase, subunit Tim44  31.65 
 
 		 218 aa  131  9e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.37899  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0138  import inner membrane translocase, subunit Tim44  35.87 
 
 		 221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3445  import inner membrane translocase  35.04 
 
 		 221 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0584  import inner membrane translocase, subunit Tim44  35.5 
 
 		 247 aa  129  4.0000000000000003e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0642637  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3830  import inner membrane translocase, subunit Tim44  35.06 
 
 		 226 aa  123  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.492338  normal  0.0940527 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0191  import inner membrane translocase, subunit Tim44  35.09 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5038  import inner membrane translocase subunit Tim44  35.87 
 
 		 199 aa  113  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.356912 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0778  membrane translocase, subunit Tim44  29.86 
 
 		 212 aa  111  8.000000000000001e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.132332  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0288  import inner membrane translocase subunit Tim44  33.05 
 
 		 226 aa  105  5e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2980  import inner membrane translocase, subunit Tim44  33.48 
 
 		 206 aa  103  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0232  tim44-like domain-containing protein  28.51 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.217806  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0107  hypothetical protein  28.63 
 
 		 216 aa  90.5  2e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.262774  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0482  import inner membrane translocase, subunit Tim44  24.44 
 
 		 331 aa  78.6  0.00000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0360  Tim44-like domain-containing protein  26.36 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1004  putative transport protein  27.56 
 
 		 316 aa  57  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4001  import inner membrane translocase subunit Tim44  25 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3119  hypothetical protein  23.85 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.448764 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1091  putative lipoprotein  22.98 
 
 		 321 aa  55.8  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000494647  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4024  import inner membrane translocase subunit Tim44  26.29 
 
 		 287 aa  55.1  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.149443  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1927  import inner membrane translocase, subunit Tim44  25.5 
 
 		 322 aa  55.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000885618  normal  0.873638 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4340  hypothetical protein  24.14 
 
 		 291 aa  52.8  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_94921  MPT family transporter: inner membrane translocase (import) Tim44  24.83 
 
 		 286 aa  52.8  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.417325  normal  0.107445 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4117  import inner membrane translocase subunit Tim44  24.14 
 
 		 287 aa  52.4  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33251  predicted protein  27.41 
 
 		 221 aa  52.4  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3607  import inner membrane translocase, subunit Tim44  24.89 
 
 		 291 aa  51.2  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3925  import inner membrane translocase subunit Tim44  25.43 
 
 		 287 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004023  hypothetical protein  27.69 
 
 		 290 aa  48.9  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000578853  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1550  hypothetical protein  22.27 
 
 		 291 aa  47.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0535221  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1284  import inner membrane translocase subunit Tim44  25.29 
 
 		 318 aa  45.8  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.45671e-16 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01439  hypothetical protein  22.94 
 
 		 290 aa  44.7  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0544  import inner membrane translocase subunit Tim44  24.77 
 
 		 295 aa  43.5  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2135  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.01 
 
 		 216 aa  43.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2938  import inner membrane translocase subunit Tim44  23.33 
 
 		 318 aa  43.1  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000555932  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1256  hypothetical protein  25.76 
 
 		 204 aa  43.1  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>