78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2207 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2207  import inner membrane translocase subunit Tim44  100 
 
 		 329 aa  645    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0334  import inner membrane translocase subunit Tim44  56.93 
 
 		 321 aa  242  7.999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  0.137155 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2165  hypothetical protein  47.69 
 
 		 312 aa  218  8.999999999999998e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.810394 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2567  import inner membrane translocase, subunit Tim44  46.81 
 
 		 312 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4404  import inner membrane translocase subunit Tim44  48.32 
 
 		 337 aa  209  7e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.583271  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5490  hypothetical protein  50.15 
 
 		 325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6540  import inner membrane translocase subunit Tim44  46.81 
 
 		 332 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.398166  normal  0.199544 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6128  import inner membrane translocase subunit Tim44  45.05 
 
 		 331 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.418522  normal  0.280335 
 
 
-
 
NC_004310  BR1269  hypothetical protein  41.45 
 
 		 342 aa  187  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.753871  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1921  import inner membrane translocase subunit Tim44  41.36 
 
 		 348 aa  182  6e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.464054  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2211  import inner membrane translocase subunit Tim44  46.89 
 
 		 318 aa  173  5e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.895169  normal  0.192893 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3268  import inner membrane translocase subunit Tim44  42.95 
 
 		 325 aa  166  6.9999999999999995e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1701  import inner membrane translocase, subunit Tim44  44.98 
 
 		 331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3768  import inner membrane translocase, subunit Tim44  55.88 
 
 		 338 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3590  hypothetical protein  44.95 
 
 		 270 aa  160  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1526  import inner membrane translocase, subunit Tim44  52.26 
 
 		 332 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.496585  normal  0.854494 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2529  import inner membrane translocase subunit Tim44  48.65 
 
 		 319 aa  158  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2254  import inner membrane translocase subunit Tim44  48.65 
 
 		 319 aa  158  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.349216  normal  0.0696359 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5842  import inner membrane translocase subunit Tim44  42.81 
 
 		 318 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0551  import inner membrane translocase subunit Tim44  55.47 
 
 		 324 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031829 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5103  import inner membrane translocase subunit Tim44  55.22 
 
 		 316 aa  145  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1858  import inner membrane translocase subunit Tim44  53.12 
 
 		 333 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.767036  normal  0.41098 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0311  import inner membrane translocase subunit Tim44  44.87 
 
 		 320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.0470868 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1927  import inner membrane translocase, subunit Tim44  32.57 
 
 		 322 aa  97.4  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000885618  normal  0.873638 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1284  import inner membrane translocase subunit Tim44  30.09 
 
 		 318 aa  97.1  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.45671e-16 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0482  import inner membrane translocase, subunit Tim44  29.53 
 
 		 331 aa  91.7  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1091  putative lipoprotein  33.43 
 
 		 321 aa  91.3  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000494647  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1788  import inner membrane translocase, subunit Tim44  28.44 
 
 		 341 aa  88.2  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000825798  normal  0.448103 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0901  import inner membrane translocase, subunit Tim44  29.24 
 
 		 314 aa  86.7  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000201824  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0544  import inner membrane translocase subunit Tim44  26.73 
 
 		 295 aa  83.2  0.000000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3566  import inner membrane translocase, subunit Tim44  29.62 
 
 		 317 aa  83.2  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000205074  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3295  import inner membrane translocase, subunit Tim44  33.06 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081668  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0785  import inner membrane translocase, subunit Tim44  34.71 
 
 		 314 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0683467  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3250  import inner membrane translocase subunit Tim44  29.02 
 
 		 321 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1010  import inner membrane translocase subunit Tim44  33.06 
 
 		 322 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2938  import inner membrane translocase subunit Tim44  30.58 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000555932  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0214  import inner membrane translocase, subunit Tim44  26.44 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.525387  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1898  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.06 
 
 		 295 aa  55.8  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.859506  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2065  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.95 
 
 		 320 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0100272 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0299  import inner membrane translocase, subunit Tim44  33.04 
 
 		 233 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2758  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.03 
 
 		 343 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.778073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2731  import inner membrane translocase, subunit Tim44  28.03 
 
 		 343 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.767216  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1110  import inner membrane translocase subunit Tim44  25.93 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.354142  normal  0.0303721 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2119  import inner membrane translocase, subunit Tim44  28.03 
 
 		 343 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434025  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2780  hypothetical protein  30.48 
 
 		 273 aa  51.2  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.300996 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2096  hypothetical protein  27.34 
 
 		 318 aa  51.2  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0739383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1560  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.15 
 
 		 239 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.69866 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0156  hypothetical protein  30.71 
 
 		 233 aa  49.7  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1839  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.15 
 
 		 239 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.661091  normal  0.32542 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1256  hypothetical protein  27.35 
 
 		 204 aa  48.9  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4035  import inner membrane translocase, subunit Tim44  27.23 
 
 		 288 aa  48.1  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2649  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.16 
 
 		 344 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.331938  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3216  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.18 
 
 		 234 aa  48.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2074  hypothetical protein  25.44 
 
 		 235 aa  48.5  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2900  import inner membrane translocase, subunit Tim44  24.39 
 
 		 219 aa  47  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.203769  normal  0.596808 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2782  import inner membrane translocase, subunit Tim44  27.87 
 
 		 344 aa  46.6  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0990  import inner membrane translocase, subunit Tim44  24.89 
 
 		 295 aa  46.6  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1994  hypothetical protein  24.56 
 
 		 231 aa  45.8  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.289958  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0421  import inner membrane translocase, subunit Tim44  28.35 
 
 		 235 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3445  import inner membrane translocase  23.42 
 
 		 221 aa  45.4  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2399  hypothetical protein  27.25 
 
 		 323 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0187  hypothetical protein  27.25 
 
 		 323 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2759  hypothetical protein  27.25 
 
 		 323 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2319  hypothetical protein  27.25 
 
 		 323 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1142  import inner membrane translocase subunit Tim44  30 
 
 		 239 aa  44.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00140401 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0554  Tim44-like domain-contain protein  25.34 
 
 		 340 aa  45.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1681  import inner membrane translocase subunit Tim44  24.56 
 
 		 242 aa  44.3  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4268  import inner membrane translocase subunit Tim44  29.06 
 
 		 234 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.331754 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0138  import inner membrane translocase, subunit Tim44  28.07 
 
 		 221 aa  43.5  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0846  import inner membrane translocase subunit Tim44  23.68 
 
 		 231 aa  43.5  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.748239  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3942  import inner membrane translocase subunit Tim44  29.06 
 
 		 234 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.851876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3485  import inner membrane translocase, subunit Tim44  29.41 
 
 		 235 aa  43.9  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2786  import inner membrane translocase, subunit Tim44  32.03 
 
 		 218 aa  43.5  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.242011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1239  hypothetical protein  23.58 
 
 		 219 aa  43.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0305  import inner membrane translocase subunit Tim44  26.98 
 
 		 235 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0684  Tim44-like domain-containing protein  26.98 
 
 		 323 aa  42.7  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2523  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.21 
 
 		 333 aa  42.7  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0253878 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0668  Tim44-like domain-containing protein  26.43 
 
 		 324 aa  42.4  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>