52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0311 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0311  import inner membrane translocase subunit Tim44  100 
 
 		 320 aa  631  1e-180  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.0470868 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2567  import inner membrane translocase, subunit Tim44  44.44 
 
 		 312 aa  161  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5842  import inner membrane translocase subunit Tim44  47.12 
 
 		 318 aa  154  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2165  hypothetical protein  44.5 
 
 		 312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.810394 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3268  import inner membrane translocase subunit Tim44  40.58 
 
 		 325 aa  142  6e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5490  hypothetical protein  40.94 
 
 		 325 aa  138  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4404  import inner membrane translocase subunit Tim44  41.35 
 
 		 337 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.583271  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0551  import inner membrane translocase subunit Tim44  52.48 
 
 		 324 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031829 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1526  import inner membrane translocase, subunit Tim44  50 
 
 		 332 aa  135  9e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.496585  normal  0.854494 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1921  import inner membrane translocase subunit Tim44  32.09 
 
 		 348 aa  135  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.464054  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5103  import inner membrane translocase subunit Tim44  51.82 
 
 		 316 aa  133  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1701  import inner membrane translocase, subunit Tim44  48.92 
 
 		 331 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2211  import inner membrane translocase subunit Tim44  51.11 
 
 		 318 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.895169  normal  0.192893 
 
 
-
 
NC_004310  BR1269  hypothetical protein  31.55 
 
 		 342 aa  129  6e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.753871  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3768  import inner membrane translocase, subunit Tim44  49.62 
 
 		 338 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2207  import inner membrane translocase subunit Tim44  44.87 
 
 		 329 aa  126  6e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2254  import inner membrane translocase subunit Tim44  49.23 
 
 		 319 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.349216  normal  0.0696359 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2529  import inner membrane translocase subunit Tim44  48.84 
 
 		 319 aa  119  6e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3590  hypothetical protein  42.04 
 
 		 270 aa  118  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0334  import inner membrane translocase subunit Tim44  38.42 
 
 		 321 aa  116  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  0.137155 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1858  import inner membrane translocase subunit Tim44  43.26 
 
 		 333 aa  114  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.767036  normal  0.41098 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6540  import inner membrane translocase subunit Tim44  41.48 
 
 		 332 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.398166  normal  0.199544 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6128  import inner membrane translocase subunit Tim44  40 
 
 		 331 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.418522  normal  0.280335 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1284  import inner membrane translocase subunit Tim44  30.91 
 
 		 318 aa  101  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.45671e-16 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1091  putative lipoprotein  32.68 
 
 		 321 aa  99.8  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000494647  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1927  import inner membrane translocase, subunit Tim44  38.52 
 
 		 322 aa  98.2  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000885618  normal  0.873638 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0482  import inner membrane translocase, subunit Tim44  36.23 
 
 		 331 aa  89.7  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2938  import inner membrane translocase subunit Tim44  37.3 
 
 		 318 aa  88.6  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000555932  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3566  import inner membrane translocase, subunit Tim44  31.33 
 
 		 317 aa  85.1  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000205074  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3295  import inner membrane translocase, subunit Tim44  36.67 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081668  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0785  import inner membrane translocase, subunit Tim44  37.4 
 
 		 314 aa  84.3  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0683467  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1788  import inner membrane translocase, subunit Tim44  34.43 
 
 		 341 aa  83.2  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000825798  normal  0.448103 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0901  import inner membrane translocase, subunit Tim44  29.19 
 
 		 314 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000201824  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3250  import inner membrane translocase subunit Tim44  32.28 
 
 		 321 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1010  import inner membrane translocase subunit Tim44  33.06 
 
 		 322 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0544  import inner membrane translocase subunit Tim44  29.75 
 
 		 295 aa  70.9  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0432  import inner membrane translocase, subunit Tim44  27.41 
 
 		 327 aa  55.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1240  hypothetical protein  26.27 
 
 		 256 aa  54.7  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0197113  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0375  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.69 
 
 		 331 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2780  hypothetical protein  27.5 
 
 		 273 aa  49.3  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.300996 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2686  import inner membrane translocase subunit Tim44  23.81 
 
 		 462 aa  47.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0000948216  normal  0.213043 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0299  import inner membrane translocase, subunit Tim44  28.7 
 
 		 233 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1012  hypothetical protein  27.2 
 
 		 273 aa  46.6  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0305  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.68 
 
 		 235 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3111  import inner membrane translocase subunit Tim44  25.42 
 
 		 260 aa  45.8  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.915706  normal  0.806338 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0156  hypothetical protein  27.83 
 
 		 233 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0400  import inner membrane translocase, subunit Tim44  26.79 
 
 		 235 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0846  import inner membrane translocase subunit Tim44  24.14 
 
 		 231 aa  43.5  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.748239  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0349  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.24 
 
 		 339 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.415982 
 
 
-
 
NC_004310  BR2074  hypothetical protein  25.86 
 
 		 235 aa  42.7  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0334  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.24 
 
 		 339 aa  42.7  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.946204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2758  import inner membrane translocase subunit Tim44  24.11 
 
 		 343 aa  42.4  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.778073  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>