59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5103 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5103  import inner membrane translocase subunit Tim44  100 
 
 		 316 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5842  import inner membrane translocase subunit Tim44  81.25 
 
 		 318 aa  372  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2211  import inner membrane translocase subunit Tim44  65.34 
 
 		 318 aa  270  2e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.895169  normal  0.192893 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2529  import inner membrane translocase subunit Tim44  65 
 
 		 319 aa  258  7e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2254  import inner membrane translocase subunit Tim44  65 
 
 		 319 aa  258  9e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.349216  normal  0.0696359 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2165  hypothetical protein  53.21 
 
 		 312 aa  224  2e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.810394 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2567  import inner membrane translocase, subunit Tim44  50.97 
 
 		 312 aa  217  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0551  import inner membrane translocase subunit Tim44  60.21 
 
 		 324 aa  204  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031829 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6128  import inner membrane translocase subunit Tim44  44.88 
 
 		 331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.418522  normal  0.280335 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6540  import inner membrane translocase subunit Tim44  45.73 
 
 		 332 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.398166  normal  0.199544 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3268  import inner membrane translocase subunit Tim44  45.43 
 
 		 325 aa  191  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4404  import inner membrane translocase subunit Tim44  42.74 
 
 		 337 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.583271  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5490  hypothetical protein  48.44 
 
 		 325 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0334  import inner membrane translocase subunit Tim44  46.98 
 
 		 321 aa  169  6e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  0.137155 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1526  import inner membrane translocase, subunit Tim44  53.46 
 
 		 332 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.496585  normal  0.854494 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1701  import inner membrane translocase, subunit Tim44  49.74 
 
 		 331 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0311  import inner membrane translocase subunit Tim44  48.21 
 
 		 320 aa  162  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.0470868 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1921  import inner membrane translocase subunit Tim44  40.66 
 
 		 348 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.464054  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3590  hypothetical protein  44.86 
 
 		 270 aa  159  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3768  import inner membrane translocase, subunit Tim44  56.82 
 
 		 338 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1269  hypothetical protein  38.71 
 
 		 342 aa  152  5e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.753871  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2207  import inner membrane translocase subunit Tim44  45.54 
 
 		 329 aa  150  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1858  import inner membrane translocase subunit Tim44  44.62 
 
 		 333 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.767036  normal  0.41098 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3566  import inner membrane translocase, subunit Tim44  29.88 
 
 		 317 aa  94  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000205074  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1091  putative lipoprotein  31.99 
 
 		 321 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000494647  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0901  import inner membrane translocase, subunit Tim44  29.65 
 
 		 314 aa  79.3  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000201824  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1927  import inner membrane translocase, subunit Tim44  30.95 
 
 		 322 aa  79.3  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000885618  normal  0.873638 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1284  import inner membrane translocase subunit Tim44  29.63 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.45671e-16 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3295  import inner membrane translocase, subunit Tim44  30.94 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081668  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0785  import inner membrane translocase, subunit Tim44  32.66 
 
 		 314 aa  77  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0683467  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1788  import inner membrane translocase, subunit Tim44  29.06 
 
 		 341 aa  73.6  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000825798  normal  0.448103 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0482  import inner membrane translocase, subunit Tim44  33.11 
 
 		 331 aa  65.5  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2938  import inner membrane translocase subunit Tim44  26.76 
 
 		 318 aa  65.1  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000555932  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3250  import inner membrane translocase subunit Tim44  30.86 
 
 		 321 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1010  import inner membrane translocase subunit Tim44  31.62 
 
 		 322 aa  55.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0375  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.65 
 
 		 331 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0554  Tim44-like domain-contain protein  26.26 
 
 		 340 aa  53.5  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1256  hypothetical protein  28.44 
 
 		 204 aa  52.8  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0544  import inner membrane translocase subunit Tim44  25.7 
 
 		 295 aa  52.4  0.000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0990  import inner membrane translocase, subunit Tim44  30.47 
 
 		 295 aa  52  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2780  hypothetical protein  32.26 
 
 		 273 aa  50.8  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.300996 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0138  import inner membrane translocase, subunit Tim44  27.1 
 
 		 221 aa  49.7  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0568  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.82 
 
 		 340 aa  48.9  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2523  import inner membrane translocase subunit Tim44  31.85 
 
 		 333 aa  47  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0253878 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0214  import inner membrane translocase, subunit Tim44  25.69 
 
 		 306 aa  46.2  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.525387  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2758  import inner membrane translocase subunit Tim44  26.88 
 
 		 343 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.778073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5777  import inner membrane translocase subunit Tim44  30.83 
 
 		 448 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2119  import inner membrane translocase, subunit Tim44  26.88 
 
 		 343 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434025  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2731  import inner membrane translocase, subunit Tim44  26.88 
 
 		 343 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.767216  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1110  import inner membrane translocase subunit Tim44  25.48 
 
 		 298 aa  43.9  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.354142  normal  0.0303721 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0845  transmembrane protein  27.49 
 
 		 323 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376855  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0684  Tim44-like domain-containing protein  27.19 
 
 		 323 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2759  hypothetical protein  27.89 
 
 		 323 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2319  hypothetical protein  27.89 
 
 		 323 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0668  Tim44-like domain-containing protein  27.7 
 
 		 324 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0187  hypothetical protein  27.89 
 
 		 323 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2399  hypothetical protein  27.89 
 
 		 323 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1896  import inner membrane translocase, subunit Tim44  24.77 
 
 		 303 aa  43.1  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0839059  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4035  import inner membrane translocase, subunit Tim44  24.67 
 
 		 288 aa  42.7  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>