41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1858 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1858  import inner membrane translocase subunit Tim44  100 
 
 		 333 aa  659    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.767036  normal  0.41098 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6540  import inner membrane translocase subunit Tim44  57.1 
 
 		 332 aa  298  6e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.398166  normal  0.199544 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6128  import inner membrane translocase subunit Tim44  54.79 
 
 		 331 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.418522  normal  0.280335 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1921  import inner membrane translocase subunit Tim44  48.4 
 
 		 348 aa  225  9e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.464054  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1269  hypothetical protein  46.78 
 
 		 342 aa  222  6e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.753871  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3590  hypothetical protein  53.92 
 
 		 270 aa  222  8e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3268  import inner membrane translocase subunit Tim44  47.65 
 
 		 325 aa  189  7e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5490  hypothetical protein  41.72 
 
 		 325 aa  168  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2567  import inner membrane translocase, subunit Tim44  38.86 
 
 		 312 aa  167  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2165  hypothetical protein  42.65 
 
 		 312 aa  158  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.810394 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4404  import inner membrane translocase subunit Tim44  40.35 
 
 		 337 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.583271  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2211  import inner membrane translocase subunit Tim44  42.37 
 
 		 318 aa  155  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.895169  normal  0.192893 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2207  import inner membrane translocase subunit Tim44  40.94 
 
 		 329 aa  151  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0334  import inner membrane translocase subunit Tim44  38.76 
 
 		 321 aa  151  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  0.137155 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5842  import inner membrane translocase subunit Tim44  45.71 
 
 		 318 aa  145  9e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2254  import inner membrane translocase subunit Tim44  38.19 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.349216  normal  0.0696359 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2529  import inner membrane translocase subunit Tim44  37.86 
 
 		 319 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0551  import inner membrane translocase subunit Tim44  48.95 
 
 		 324 aa  133  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031829 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1701  import inner membrane translocase, subunit Tim44  41.03 
 
 		 331 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3768  import inner membrane translocase, subunit Tim44  48.09 
 
 		 338 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1526  import inner membrane translocase, subunit Tim44  47.33 
 
 		 332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.496585  normal  0.854494 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5103  import inner membrane translocase subunit Tim44  51.49 
 
 		 316 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0311  import inner membrane translocase subunit Tim44  36.56 
 
 		 320 aa  120  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.0470868 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0482  import inner membrane translocase, subunit Tim44  34.96 
 
 		 331 aa  81.3  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1091  putative lipoprotein  27.27 
 
 		 321 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000494647  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1788  import inner membrane translocase, subunit Tim44  27.33 
 
 		 341 aa  68.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000825798  normal  0.448103 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1927  import inner membrane translocase, subunit Tim44  31.58 
 
 		 322 aa  67  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000885618  normal  0.873638 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3566  import inner membrane translocase, subunit Tim44  25.78 
 
 		 317 aa  66.6  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000205074  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0901  import inner membrane translocase, subunit Tim44  28.62 
 
 		 314 aa  65.9  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000201824  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0785  import inner membrane translocase, subunit Tim44  32.31 
 
 		 314 aa  63.9  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0683467  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0375  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.98 
 
 		 331 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3295  import inner membrane translocase, subunit Tim44  26.71 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081668  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1284  import inner membrane translocase subunit Tim44  26.19 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.45671e-16 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3250  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.46 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1010  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.81 
 
 		 322 aa  55.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0544  import inner membrane translocase subunit Tim44  22.12 
 
 		 295 aa  52.4  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0138  import inner membrane translocase, subunit Tim44  28.22 
 
 		 221 aa  47  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0156  hypothetical protein  30.97 
 
 		 233 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0299  import inner membrane translocase, subunit Tim44  27.27 
 
 		 233 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0400  import inner membrane translocase, subunit Tim44  30.3 
 
 		 235 aa  43.1  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2900  import inner membrane translocase, subunit Tim44  28.95 
 
 		 219 aa  42.7  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.203769  normal  0.596808 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>