51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3590 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3590  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  543  1e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1858  import inner membrane translocase subunit Tim44  54.59 
 
 		 333 aa  216  4e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.767036  normal  0.41098 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6540  import inner membrane translocase subunit Tim44  54.95 
 
 		 332 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.398166  normal  0.199544 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1921  import inner membrane translocase subunit Tim44  47.62 
 
 		 348 aa  203  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.464054  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1269  hypothetical protein  50.88 
 
 		 342 aa  202  4e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.753871  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6128  import inner membrane translocase subunit Tim44  51.8 
 
 		 331 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.418522  normal  0.280335 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2165  hypothetical protein  42.92 
 
 		 312 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.810394 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2211  import inner membrane translocase subunit Tim44  42.52 
 
 		 318 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.895169  normal  0.192893 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2207  import inner membrane translocase subunit Tim44  56.72 
 
 		 329 aa  155  6e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5842  import inner membrane translocase subunit Tim44  43.44 
 
 		 318 aa  152  8e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2529  import inner membrane translocase subunit Tim44  42.06 
 
 		 319 aa  151  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2254  import inner membrane translocase subunit Tim44  42.06 
 
 		 319 aa  151  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.349216  normal  0.0696359 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5490  hypothetical protein  39.55 
 
 		 325 aa  148  7e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4404  import inner membrane translocase subunit Tim44  40.54 
 
 		 337 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.583271  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3268  import inner membrane translocase subunit Tim44  43.68 
 
 		 325 aa  145  7.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2567  import inner membrane translocase, subunit Tim44  54.26 
 
 		 312 aa  145  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0551  import inner membrane translocase subunit Tim44  42.86 
 
 		 324 aa  141  9e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031829 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5103  import inner membrane translocase subunit Tim44  43.35 
 
 		 316 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1526  import inner membrane translocase, subunit Tim44  47.06 
 
 		 332 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.496585  normal  0.854494 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3768  import inner membrane translocase, subunit Tim44  51.91 
 
 		 338 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1701  import inner membrane translocase, subunit Tim44  51.16 
 
 		 331 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0334  import inner membrane translocase subunit Tim44  39.64 
 
 		 321 aa  130  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  0.137155 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0311  import inner membrane translocase subunit Tim44  42.04 
 
 		 320 aa  119  7e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.0470868 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1091  putative lipoprotein  32.62 
 
 		 321 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000494647  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0482  import inner membrane translocase, subunit Tim44  36.59 
 
 		 331 aa  77.4  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3566  import inner membrane translocase, subunit Tim44  28.19 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000205074  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3295  import inner membrane translocase, subunit Tim44  29.73 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081668  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1788  import inner membrane translocase, subunit Tim44  26.11 
 
 		 341 aa  66.6  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000825798  normal  0.448103 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1927  import inner membrane translocase, subunit Tim44  27.98 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000885618  normal  0.873638 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0901  import inner membrane translocase, subunit Tim44  28.64 
 
 		 314 aa  63.9  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000201824  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0785  import inner membrane translocase, subunit Tim44  30.43 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0683467  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1284  import inner membrane translocase subunit Tim44  24.77 
 
 		 318 aa  57  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.45671e-16 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3250  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.95 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0544  import inner membrane translocase subunit Tim44  26.19 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1010  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.95 
 
 		 322 aa  54.3  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0299  import inner membrane translocase, subunit Tim44  32.73 
 
 		 233 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2938  import inner membrane translocase subunit Tim44  22.69 
 
 		 318 aa  52  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000555932  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0400  import inner membrane translocase, subunit Tim44  33.33 
 
 		 235 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3111  import inner membrane translocase subunit Tim44  33.05 
 
 		 260 aa  48.1  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.915706  normal  0.806338 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0421  import inner membrane translocase, subunit Tim44  35.64 
 
 		 235 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2900  import inner membrane translocase, subunit Tim44  28.07 
 
 		 219 aa  47  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.203769  normal  0.596808 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0305  import inner membrane translocase subunit Tim44  29.09 
 
 		 235 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0117  import inner membrane translocase, subunit Tim44  23.94 
 
 		 234 aa  45.8  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0729784  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0156  hypothetical protein  29.09 
 
 		 233 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2065  import inner membrane translocase subunit Tim44  22.35 
 
 		 320 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0100272 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1239  hypothetical protein  27.19 
 
 		 219 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0360  Tim44-like domain-containing protein  27.35 
 
 		 208 aa  43.1  0.005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0214  import inner membrane translocase, subunit Tim44  25.54 
 
 		 306 aa  43.1  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.525387  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2096  hypothetical protein  23.51 
 
 		 318 aa  42.7  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0739383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0107  hypothetical protein  24.58 
 
 		 234 aa  42.4  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0375  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.41 
 
 		 331 aa  42.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>