96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1788 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1788  import inner membrane translocase, subunit Tim44  100 
 
 		 341 aa  687    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000825798  normal  0.448103 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3566  import inner membrane translocase, subunit Tim44  45.37 
 
 		 317 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000205074  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3295  import inner membrane translocase, subunit Tim44  46.43 
 
 		 318 aa  216  5e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081668  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0901  import inner membrane translocase, subunit Tim44  46.58 
 
 		 314 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000201824  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1284  import inner membrane translocase subunit Tim44  45.45 
 
 		 318 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.45671e-16 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3250  import inner membrane translocase subunit Tim44  49.02 
 
 		 321 aa  202  7e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1091  putative lipoprotein  41 
 
 		 321 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000494647  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1010  import inner membrane translocase subunit Tim44  44.88 
 
 		 322 aa  191  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2938  import inner membrane translocase subunit Tim44  44.71 
 
 		 318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000555932  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1927  import inner membrane translocase, subunit Tim44  43 
 
 		 322 aa  178  9e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000885618  normal  0.873638 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0785  import inner membrane translocase, subunit Tim44  44.5 
 
 		 314 aa  169  7e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0683467  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0482  import inner membrane translocase, subunit Tim44  30.06 
 
 		 331 aa  104  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0544  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.27 
 
 		 295 aa  95.5  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4404  import inner membrane translocase subunit Tim44  33.86 
 
 		 337 aa  87  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.583271  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0311  import inner membrane translocase subunit Tim44  34.43 
 
 		 320 aa  85.5  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.0470868 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2207  import inner membrane translocase subunit Tim44  31.61 
 
 		 329 aa  85.9  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2165  hypothetical protein  29.43 
 
 		 312 aa  82  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.810394 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3768  import inner membrane translocase, subunit Tim44  32.28 
 
 		 338 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5490  hypothetical protein  33.86 
 
 		 325 aa  82  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1526  import inner membrane translocase, subunit Tim44  32.8 
 
 		 332 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.496585  normal  0.854494 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2567  import inner membrane translocase, subunit Tim44  32 
 
 		 312 aa  80.1  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1701  import inner membrane translocase, subunit Tim44  31.2 
 
 		 331 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6540  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.33 
 
 		 332 aa  77  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.398166  normal  0.199544 
 
 
-
 
NC_004310  BR1269  hypothetical protein  31.67 
 
 		 342 aa  73.6  0.000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.753871  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0334  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.78 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  0.137155 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2135  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.56 
 
 		 216 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1921  import inner membrane translocase subunit Tim44  30 
 
 		 348 aa  70.1  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.464054  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6128  import inner membrane translocase subunit Tim44  25.96 
 
 		 331 aa  67  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.418522  normal  0.280335 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1858  import inner membrane translocase subunit Tim44  30.43 
 
 		 333 aa  66.6  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.767036  normal  0.41098 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3590  hypothetical protein  25.11 
 
 		 270 aa  65.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5103  import inner membrane translocase subunit Tim44  32 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1240  hypothetical protein  25 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0197113  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0375  import inner membrane translocase subunit Tim44  26.2 
 
 		 331 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2211  import inner membrane translocase subunit Tim44  24.89 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.895169  normal  0.192893 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5842  import inner membrane translocase subunit Tim44  31.54 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2529  import inner membrane translocase subunit Tim44  26.36 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2254  import inner membrane translocase subunit Tim44  26.36 
 
 		 319 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.349216  normal  0.0696359 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5646  import inner membrane translocase, subunit Tim44  24.25 
 
 		 292 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169336 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1560  import inner membrane translocase subunit Tim44  24.5 
 
 		 239 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.69866 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1839  import inner membrane translocase subunit Tim44  24.5 
 
 		 239 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.661091  normal  0.32542 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5066  import inner membrane translocase, subunit Tim44  24.5 
 
 		 281 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1681  import inner membrane translocase subunit Tim44  25.17 
 
 		 242 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0214  import inner membrane translocase, subunit Tim44  23.73 
 
 		 306 aa  55.8  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.525387  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5517  hypothetical protein  25.7 
 
 		 280 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0538  import inner membrane translocase, subunit Tim44  24.65 
 
 		 311 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2074  hypothetical protein  22.76 
 
 		 235 aa  54.3  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3713  import inner membrane translocase subunit Tim44  26.17 
 
 		 237 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.500571 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2319  hypothetical protein  25.72 
 
 		 323 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2399  hypothetical protein  25.72 
 
 		 323 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0990  import inner membrane translocase, subunit Tim44  24.67 
 
 		 295 aa  52.4  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2759  hypothetical protein  25.72 
 
 		 323 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0187  hypothetical protein  25.72 
 
 		 323 aa  52  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72930  hypothetical protein  23.64 
 
 		 285 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0846  import inner membrane translocase subunit Tim44  24.14 
 
 		 231 aa  51.6  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.748239  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2780  hypothetical protein  26.28 
 
 		 273 aa  51.2  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.300996 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1994  hypothetical protein  22.07 
 
 		 231 aa  50.8  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.289958  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2731  import inner membrane translocase, subunit Tim44  26.51 
 
 		 343 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.767216  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2119  import inner membrane translocase, subunit Tim44  26.51 
 
 		 343 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434025  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1898  import inner membrane translocase subunit Tim44  23.46 
 
 		 295 aa  50.4  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.859506  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2686  import inner membrane translocase subunit Tim44  25.37 
 
 		 462 aa  50.4  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0000948216  normal  0.213043 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3216  import inner membrane translocase subunit Tim44  24.46 
 
 		 234 aa  50.1  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0554  Tim44-like domain-contain protein  23.55 
 
 		 340 aa  49.7  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0668  Tim44-like domain-containing protein  25.36 
 
 		 324 aa  49.7  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2758  import inner membrane translocase subunit Tim44  26.51 
 
 		 343 aa  49.7  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.778073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3268  import inner membrane translocase subunit Tim44  25.45 
 
 		 325 aa  49.3  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0845  transmembrane protein  25.43 
 
 		 323 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376855  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3445  import inner membrane translocase  24.05 
 
 		 221 aa  48.1  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3485  import inner membrane translocase, subunit Tim44  23.04 
 
 		 235 aa  47.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5131  import inner membrane translocase subunit Tim44  23.78 
 
 		 284 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.499992  normal  0.12698 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5353  hypothetical protein  23.08 
 
 		 284 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.116139  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0684  Tim44-like domain-containing protein  25 
 
 		 323 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2065  import inner membrane translocase subunit Tim44  25.56 
 
 		 320 aa  47  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0100272 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3111  import inner membrane translocase subunit Tim44  23.17 
 
 		 260 aa  46.6  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.915706  normal  0.806338 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1012  hypothetical protein  26.85 
 
 		 273 aa  46.6  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5261  import inner membrane translocase, subunit Tim44  23.08 
 
 		 297 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0305  import inner membrane translocase subunit Tim44  23.49 
 
 		 235 aa  46.6  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0299  import inner membrane translocase, subunit Tim44  21.83 
 
 		 233 aa  46.2  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2048  import inner membrane translocase subunit Tim44  25.34 
 
 		 250 aa  46.2  0.0009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.476328  normal  0.72544 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0568  import inner membrane translocase subunit Tim44  24.62 
 
 		 340 aa  45.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1110  import inner membrane translocase subunit Tim44  23.85 
 
 		 298 aa  45.4  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.354142  normal  0.0303721 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00430  Tim44-like domain protein  25 
 
 		 284 aa  45.8  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.924994  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0107  hypothetical protein  22.7 
 
 		 234 aa  45.1  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5402  import inner membrane translocase subunit Tim44  22.38 
 
 		 284 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843666 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2855  import inner membrane translocase, subunit Tim44  22.22 
 
 		 218 aa  44.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.37899  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0138  import inner membrane translocase, subunit Tim44  23.56 
 
 		 221 aa  44.3  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4035  import inner membrane translocase, subunit Tim44  24.64 
 
 		 288 aa  43.9  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6058  putative transporter  24.09 
 
 		 344 aa  43.9  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0400  import inner membrane translocase, subunit Tim44  23.04 
 
 		 235 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0421  import inner membrane translocase, subunit Tim44  23.31 
 
 		 235 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0191  import inner membrane translocase, subunit Tim44  25.36 
 
 		 235 aa  43.9  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2786  import inner membrane translocase, subunit Tim44  22.98 
 
 		 218 aa  43.1  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.242011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3942  import inner membrane translocase subunit Tim44  21.52 
 
 		 234 aa  43.5  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.851876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0156  hypothetical protein  21.13 
 
 		 233 aa  43.1  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4268  import inner membrane translocase subunit Tim44  21.52 
 
 		 234 aa  42.7  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.331754 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4117  import inner membrane translocase subunit Tim44  21.08 
 
 		 287 aa  42.7  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4049  hypothetical protein  23.72 
 
 		 330 aa  42.7  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.631655 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>