24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2135 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2135  import inner membrane translocase subunit Tim44  100 
 
 
216 aa  443  1.0000000000000001e-124  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1788  import inner membrane translocase, subunit Tim44  27.56 
 
 
341 aa  72.8  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000825798  normal  0.448103 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1091  putative lipoprotein  32.45 
 
 
321 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000494647  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3250  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.63 
 
 
321 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3295  import inner membrane translocase, subunit Tim44  27.22 
 
 
318 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081668  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1010  import inner membrane translocase subunit Tim44  25.66 
 
 
322 aa  61.6  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1927  import inner membrane translocase, subunit Tim44  28.38 
 
 
322 aa  60.8  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000885618  normal  0.873638 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1240  hypothetical protein  25.95 
 
 
256 aa  60.1  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0197113  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3566  import inner membrane translocase, subunit Tim44  26.49 
 
 
317 aa  60.5  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000205074  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0785  import inner membrane translocase, subunit Tim44  26.32 
 
 
314 aa  57.4  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0683467  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1284  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.17 
 
 
318 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.45671e-16 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0901  import inner membrane translocase, subunit Tim44  24.16 
 
 
314 aa  56.6  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000201824  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2938  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.46 
 
 
318 aa  55.5  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000555932  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2980  import inner membrane translocase, subunit Tim44  28.06 
 
 
206 aa  52.8  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0482  import inner membrane translocase, subunit Tim44  26.95 
 
 
331 aa  50.8  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5777  import inner membrane translocase subunit Tim44  22.08 
 
 
448 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0138  import inner membrane translocase, subunit Tim44  27.82 
 
 
221 aa  45.8  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0156  hypothetical protein  28.67 
 
 
233 aa  45.4  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0299  import inner membrane translocase, subunit Tim44  29.17 
 
 
233 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0107  hypothetical protein  28.21 
 
 
234 aa  44.7  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0117  import inner membrane translocase, subunit Tim44  27.01 
 
 
234 aa  43.1  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0729784  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0544  import inner membrane translocase subunit Tim44  23.58 
 
 
295 aa  42.7  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3608  hypothetical protein  24.52 
 
 
219 aa  42.7  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.765658  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3216  import inner membrane translocase subunit Tim44  25.58 
 
 
234 aa  41.6  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>