48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5842 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5842  import inner membrane translocase subunit Tim44  100 
 
 		 318 aa  617  1e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5103  import inner membrane translocase subunit Tim44  81.88 
 
 		 316 aa  348  6e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2211  import inner membrane translocase subunit Tim44  61.23 
 
 		 318 aa  266  5e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.895169  normal  0.192893 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2254  import inner membrane translocase subunit Tim44  60.12 
 
 		 319 aa  248  7e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.349216  normal  0.0696359 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2529  import inner membrane translocase subunit Tim44  60.62 
 
 		 319 aa  248  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2165  hypothetical protein  51.61 
 
 		 312 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.810394 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2567  import inner membrane translocase, subunit Tim44  47.76 
 
 		 312 aa  212  7e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0551  import inner membrane translocase subunit Tim44  61.54 
 
 		 324 aa  205  8e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031829 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6540  import inner membrane translocase subunit Tim44  48.1 
 
 		 332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.398166  normal  0.199544 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4404  import inner membrane translocase subunit Tim44  45.3 
 
 		 337 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.583271  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6128  import inner membrane translocase subunit Tim44  48.25 
 
 		 331 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.418522  normal  0.280335 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3268  import inner membrane translocase subunit Tim44  48.53 
 
 		 325 aa  190  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5490  hypothetical protein  49.37 
 
 		 325 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1921  import inner membrane translocase subunit Tim44  45.07 
 
 		 348 aa  181  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.464054  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1526  import inner membrane translocase, subunit Tim44  48.32 
 
 		 332 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.496585  normal  0.854494 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3590  hypothetical protein  45.79 
 
 		 270 aa  165  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1701  import inner membrane translocase, subunit Tim44  46.6 
 
 		 331 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0334  import inner membrane translocase subunit Tim44  47.7 
 
 		 321 aa  162  8.000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  0.137155 
 
 
-
 
NC_004310  BR1269  hypothetical protein  42.99 
 
 		 342 aa  160  4e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.753871  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2207  import inner membrane translocase subunit Tim44  43.85 
 
 		 329 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3768  import inner membrane translocase, subunit Tim44  46.11 
 
 		 338 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0311  import inner membrane translocase subunit Tim44  50.63 
 
 		 320 aa  141  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.0470868 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1858  import inner membrane translocase subunit Tim44  54.14 
 
 		 333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.767036  normal  0.41098 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0901  import inner membrane translocase, subunit Tim44  30 
 
 		 314 aa  95.5  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000201824  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1091  putative lipoprotein  33.12 
 
 		 321 aa  90.5  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000494647  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3566  import inner membrane translocase, subunit Tim44  31.17 
 
 		 317 aa  88.6  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000205074  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1284  import inner membrane translocase subunit Tim44  29.38 
 
 		 318 aa  87.4  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.45671e-16 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0785  import inner membrane translocase, subunit Tim44  34.48 
 
 		 314 aa  83.2  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0683467  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1927  import inner membrane translocase, subunit Tim44  31.88 
 
 		 322 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000885618  normal  0.873638 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3295  import inner membrane translocase, subunit Tim44  31.52 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081668  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1788  import inner membrane translocase, subunit Tim44  29.27 
 
 		 341 aa  70.5  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000825798  normal  0.448103 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0482  import inner membrane translocase, subunit Tim44  33.78 
 
 		 331 aa  66.2  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2938  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.91 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000555932  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3250  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.62 
 
 		 321 aa  63.2  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0375  import inner membrane translocase subunit Tim44  26.25 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1010  import inner membrane translocase subunit Tim44  31.2 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0544  import inner membrane translocase subunit Tim44  23.56 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5777  import inner membrane translocase subunit Tim44  31.93 
 
 		 448 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1898  import inner membrane translocase subunit Tim44  26.01 
 
 		 295 aa  50.8  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.859506  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0138  import inner membrane translocase, subunit Tim44  26.94 
 
 		 221 aa  48.9  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2523  import inner membrane translocase subunit Tim44  30.37 
 
 		 333 aa  48.5  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0253878 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4932  hypothetical protein  35.65 
 
 		 389 aa  47  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1256  hypothetical protein  27.19 
 
 		 204 aa  47.4  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0990  import inner membrane translocase, subunit Tim44  28.88 
 
 		 295 aa  46.2  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0554  Tim44-like domain-contain protein  27.01 
 
 		 340 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2780  hypothetical protein  28.57 
 
 		 273 aa  45.8  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.300996 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0568  import inner membrane translocase subunit Tim44  26.29 
 
 		 340 aa  45.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0214  import inner membrane translocase, subunit Tim44  23.51 
 
 		 306 aa  43.5  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.525387  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>