69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4404 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4404  import inner membrane translocase subunit Tim44  100 
 
 		 337 aa  672    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.583271  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1701  import inner membrane translocase, subunit Tim44  78.3 
 
 		 331 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3768  import inner membrane translocase, subunit Tim44  78.53 
 
 		 338 aa  353  2e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2567  import inner membrane translocase, subunit Tim44  59.82 
 
 		 312 aa  309  5e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2165  hypothetical protein  61.01 
 
 		 312 aa  306  2.0000000000000002e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.810394 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1526  import inner membrane translocase, subunit Tim44  67.86 
 
 		 332 aa  305  7e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.496585  normal  0.854494 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5490  hypothetical protein  63.77 
 
 		 325 aa  301  7.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2211  import inner membrane translocase subunit Tim44  50.33 
 
 		 318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.895169  normal  0.192893 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0334  import inner membrane translocase subunit Tim44  46.91 
 
 		 321 aa  190  4e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  0.137155 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2529  import inner membrane translocase subunit Tim44  49.67 
 
 		 319 aa  181  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2254  import inner membrane translocase subunit Tim44  49.67 
 
 		 319 aa  181  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.349216  normal  0.0696359 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2207  import inner membrane translocase subunit Tim44  50.46 
 
 		 329 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5842  import inner membrane translocase subunit Tim44  47.75 
 
 		 318 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6540  import inner membrane translocase subunit Tim44  40.99 
 
 		 332 aa  169  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.398166  normal  0.199544 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1921  import inner membrane translocase subunit Tim44  38.53 
 
 		 348 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.464054  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6128  import inner membrane translocase subunit Tim44  40.37 
 
 		 331 aa  162  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.418522  normal  0.280335 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0551  import inner membrane translocase subunit Tim44  56.55 
 
 		 324 aa  160  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031829 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5103  import inner membrane translocase subunit Tim44  49.73 
 
 		 316 aa  156  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3268  import inner membrane translocase subunit Tim44  41.8 
 
 		 325 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1269  hypothetical protein  37.46 
 
 		 342 aa  147  4.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.753871  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3590  hypothetical protein  51.16 
 
 		 270 aa  137  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0311  import inner membrane translocase subunit Tim44  51.05 
 
 		 320 aa  135  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.0470868 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1858  import inner membrane translocase subunit Tim44  47.52 
 
 		 333 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.767036  normal  0.41098 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1284  import inner membrane translocase subunit Tim44  29.14 
 
 		 318 aa  91.3  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.45671e-16 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0901  import inner membrane translocase, subunit Tim44  29.01 
 
 		 314 aa  88.2  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000201824  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1788  import inner membrane translocase, subunit Tim44  33.86 
 
 		 341 aa  85.1  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000825798  normal  0.448103 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3566  import inner membrane translocase, subunit Tim44  28.42 
 
 		 317 aa  84.3  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000205074  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1927  import inner membrane translocase, subunit Tim44  35.2 
 
 		 322 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000885618  normal  0.873638 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1091  putative lipoprotein  30.18 
 
 		 321 aa  82.8  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000494647  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0785  import inner membrane translocase, subunit Tim44  32.18 
 
 		 314 aa  79.3  0.00000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0683467  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3295  import inner membrane translocase, subunit Tim44  29.65 
 
 		 318 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081668  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2938  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.91 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000555932  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3250  import inner membrane translocase subunit Tim44  33.62 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0375  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.83 
 
 		 331 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1010  import inner membrane translocase subunit Tim44  31.2 
 
 		 322 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0482  import inner membrane translocase, subunit Tim44  34.68 
 
 		 331 aa  69.3  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0544  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.87 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2780  hypothetical protein  27.51 
 
 		 273 aa  58.9  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.300996 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2758  import inner membrane translocase subunit Tim44  30.3 
 
 		 343 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.778073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2731  import inner membrane translocase, subunit Tim44  30.3 
 
 		 343 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.767216  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2119  import inner membrane translocase, subunit Tim44  30.3 
 
 		 343 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434025  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0214  import inner membrane translocase, subunit Tim44  27.45 
 
 		 306 aa  54.3  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.525387  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0554  Tim44-like domain-contain protein  28.19 
 
 		 340 aa  52.8  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2399  hypothetical protein  28.24 
 
 		 323 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0187  hypothetical protein  28.24 
 
 		 323 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2319  hypothetical protein  28.24 
 
 		 323 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2759  hypothetical protein  28.24 
 
 		 323 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2096  hypothetical protein  27.38 
 
 		 318 aa  50.4  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0739383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0568  import inner membrane translocase subunit Tim44  26.04 
 
 		 340 aa  50.1  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0845  transmembrane protein  28.63 
 
 		 323 aa  50.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376855  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1898  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.76 
 
 		 295 aa  49.7  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.859506  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0668  Tim44-like domain-containing protein  28.24 
 
 		 324 aa  49.3  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00430  Tim44-like domain protein  28.05 
 
 		 284 aa  48.9  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.924994  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2649  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.04 
 
 		 344 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.331938  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2861  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.35 
 
 		 308 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2782  import inner membrane translocase, subunit Tim44  27.04 
 
 		 344 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0684  Tim44-like domain-containing protein  26.39 
 
 		 323 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0650  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.4 
 
 		 330 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.983868 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5646  import inner membrane translocase, subunit Tim44  24.55 
 
 		 292 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169336 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2523  import inner membrane translocase subunit Tim44  30.66 
 
 		 333 aa  46.2  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0253878 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1110  import inner membrane translocase subunit Tim44  24.33 
 
 		 298 aa  46.2  0.0009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.354142  normal  0.0303721 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1256  hypothetical protein  28.02 
 
 		 204 aa  45.8  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0138  import inner membrane translocase, subunit Tim44  25.69 
 
 		 221 aa  44.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3047  import inner membrane translocase, subunit Tim44  24.56 
 
 		 272 aa  45.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6058  putative transporter  26.67 
 
 		 344 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4049  hypothetical protein  27.67 
 
 		 330 aa  43.9  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.631655 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5066  import inner membrane translocase, subunit Tim44  23.62 
 
 		 281 aa  43.5  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5517  hypothetical protein  23.19 
 
 		 280 aa  42.7  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1012  hypothetical protein  26.98 
 
 		 273 aa  42.7  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>