52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3768 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3768  import inner membrane translocase, subunit Tim44  100 
 
 		 338 aa  674    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4404  import inner membrane translocase subunit Tim44  78.95 
 
 		 337 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.583271  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1701  import inner membrane translocase, subunit Tim44  88.72 
 
 		 331 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2567  import inner membrane translocase, subunit Tim44  60.83 
 
 		 312 aa  314  9.999999999999999e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1526  import inner membrane translocase, subunit Tim44  69.44 
 
 		 332 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.496585  normal  0.854494 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2165  hypothetical protein  60.24 
 
 		 312 aa  299  4e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.810394 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5490  hypothetical protein  57.97 
 
 		 325 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2211  import inner membrane translocase subunit Tim44  44.29 
 
 		 318 aa  171  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.895169  normal  0.192893 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0334  import inner membrane translocase subunit Tim44  41.84 
 
 		 321 aa  171  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  0.137155 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0551  import inner membrane translocase subunit Tim44  48.47 
 
 		 324 aa  167  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031829 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6540  import inner membrane translocase subunit Tim44  39.14 
 
 		 332 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.398166  normal  0.199544 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2254  import inner membrane translocase subunit Tim44  44.64 
 
 		 319 aa  163  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.349216  normal  0.0696359 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2529  import inner membrane translocase subunit Tim44  44.64 
 
 		 319 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2207  import inner membrane translocase subunit Tim44  45.76 
 
 		 329 aa  162  6e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6128  import inner membrane translocase subunit Tim44  39.17 
 
 		 331 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.418522  normal  0.280335 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5842  import inner membrane translocase subunit Tim44  46.9 
 
 		 318 aa  158  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1921  import inner membrane translocase subunit Tim44  36.22 
 
 		 348 aa  149  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.464054  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5103  import inner membrane translocase subunit Tim44  57.25 
 
 		 316 aa  149  7e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_004310  BR1269  hypothetical protein  37.39 
 
 		 342 aa  144  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.753871  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3590  hypothetical protein  52.71 
 
 		 270 aa  139  6e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1858  import inner membrane translocase subunit Tim44  48.09 
 
 		 333 aa  129  6e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.767036  normal  0.41098 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3268  import inner membrane translocase subunit Tim44  50.74 
 
 		 325 aa  127  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0311  import inner membrane translocase subunit Tim44  49.62 
 
 		 320 aa  126  7e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.0470868 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1284  import inner membrane translocase subunit Tim44  30.21 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.45671e-16 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1927  import inner membrane translocase, subunit Tim44  32.92 
 
 		 322 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000885618  normal  0.873638 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0901  import inner membrane translocase, subunit Tim44  28.97 
 
 		 314 aa  82  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000201824  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1788  import inner membrane translocase, subunit Tim44  31.06 
 
 		 341 aa  82  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000825798  normal  0.448103 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1091  putative lipoprotein  35.94 
 
 		 321 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000494647  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3295  import inner membrane translocase, subunit Tim44  29.64 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081668  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3566  import inner membrane translocase, subunit Tim44  27.21 
 
 		 317 aa  79.3  0.00000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000205074  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0785  import inner membrane translocase, subunit Tim44  36.21 
 
 		 314 aa  73.6  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0683467  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3250  import inner membrane translocase subunit Tim44  33.62 
 
 		 321 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2938  import inner membrane translocase subunit Tim44  29.74 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000555932  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1010  import inner membrane translocase subunit Tim44  31.2 
 
 		 322 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0375  import inner membrane translocase subunit Tim44  31.13 
 
 		 331 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0482  import inner membrane translocase, subunit Tim44  34.75 
 
 		 331 aa  63.5  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0544  import inner membrane translocase subunit Tim44  23.72 
 
 		 295 aa  62.4  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0214  import inner membrane translocase, subunit Tim44  25.99 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.525387  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2119  import inner membrane translocase, subunit Tim44  28.4 
 
 		 343 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434025  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2731  import inner membrane translocase, subunit Tim44  28.4 
 
 		 343 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.767216  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2758  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.4 
 
 		 343 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.778073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1110  import inner membrane translocase subunit Tim44  25.89 
 
 		 298 aa  52.4  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.354142  normal  0.0303721 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2861  import inner membrane translocase subunit Tim44  25.21 
 
 		 308 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0650  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.28 
 
 		 330 aa  49.7  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.983868 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0554  Tim44-like domain-contain protein  26.92 
 
 		 340 aa  49.7  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2096  hypothetical protein  26.48 
 
 		 318 aa  49.3  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0739383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1898  import inner membrane translocase subunit Tim44  26.61 
 
 		 295 aa  49.3  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.859506  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2780  hypothetical protein  26.97 
 
 		 273 aa  48.5  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.300996 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2649  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.49 
 
 		 344 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.331938  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3047  import inner membrane translocase, subunit Tim44  26.25 
 
 		 272 aa  44.3  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6058  putative transporter  27.25 
 
 		 344 aa  43.5  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2782  import inner membrane translocase, subunit Tim44  27.19 
 
 		 344 aa  43.5  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>