51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6128 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012852  Rleg_6128  import inner membrane translocase subunit Tim44  100 
 
 		 331 aa  659    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.418522  normal  0.280335 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6540  import inner membrane translocase subunit Tim44  89.85 
 
 		 332 aa  517  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.398166  normal  0.199544 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1921  import inner membrane translocase subunit Tim44  51.57 
 
 		 348 aa  251  8.000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.464054  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1269  hypothetical protein  52.21 
 
 		 342 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.753871  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1858  import inner membrane translocase subunit Tim44  54.19 
 
 		 333 aa  224  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.767036  normal  0.41098 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3268  import inner membrane translocase subunit Tim44  50.48 
 
 		 325 aa  206  5e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3590  hypothetical protein  49.77 
 
 		 270 aa  199  3.9999999999999996e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2567  import inner membrane translocase, subunit Tim44  43.53 
 
 		 312 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2165  hypothetical protein  40.76 
 
 		 312 aa  179  4.999999999999999e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.810394 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5842  import inner membrane translocase subunit Tim44  46.98 
 
 		 318 aa  172  9e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5490  hypothetical protein  42.77 
 
 		 325 aa  168  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0334  import inner membrane translocase subunit Tim44  38.92 
 
 		 321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  0.137155 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5103  import inner membrane translocase subunit Tim44  46.07 
 
 		 316 aa  159  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4404  import inner membrane translocase subunit Tim44  41.23 
 
 		 337 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.583271  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2529  import inner membrane translocase subunit Tim44  40.14 
 
 		 319 aa  154  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2207  import inner membrane translocase subunit Tim44  45.45 
 
 		 329 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2254  import inner membrane translocase subunit Tim44  39.5 
 
 		 319 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.349216  normal  0.0696359 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2211  import inner membrane translocase subunit Tim44  41.26 
 
 		 318 aa  151  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.895169  normal  0.192893 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0551  import inner membrane translocase subunit Tim44  53.42 
 
 		 324 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031829 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1701  import inner membrane translocase, subunit Tim44  52.86 
 
 		 331 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1526  import inner membrane translocase, subunit Tim44  49.24 
 
 		 332 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.496585  normal  0.854494 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3768  import inner membrane translocase, subunit Tim44  50.72 
 
 		 338 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0311  import inner membrane translocase subunit Tim44  40 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.0470868 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1091  putative lipoprotein  33.03 
 
 		 321 aa  97.8  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000494647  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1927  import inner membrane translocase, subunit Tim44  32.08 
 
 		 322 aa  89.7  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000885618  normal  0.873638 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3566  import inner membrane translocase, subunit Tim44  28.57 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000205074  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0482  import inner membrane translocase, subunit Tim44  31.52 
 
 		 331 aa  81.3  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1284  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.19 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.45671e-16 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0901  import inner membrane translocase, subunit Tim44  28.71 
 
 		 314 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000201824  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1788  import inner membrane translocase, subunit Tim44  24.06 
 
 		 341 aa  72  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000825798  normal  0.448103 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0544  import inner membrane translocase subunit Tim44  23.75 
 
 		 295 aa  68.9  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0785  import inner membrane translocase, subunit Tim44  27.86 
 
 		 314 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0683467  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3295  import inner membrane translocase, subunit Tim44  30.33 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081668  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1010  import inner membrane translocase subunit Tim44  26.79 
 
 		 322 aa  61.6  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3250  import inner membrane translocase subunit Tim44  24.29 
 
 		 321 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0554  Tim44-like domain-contain protein  25.99 
 
 		 340 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0375  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.84 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2938  import inner membrane translocase subunit Tim44  26.96 
 
 		 318 aa  55.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000555932  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2758  import inner membrane translocase subunit Tim44  25.81 
 
 		 343 aa  53.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.778073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2759  hypothetical protein  27.06 
 
 		 323 aa  52.8  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0187  hypothetical protein  27.06 
 
 		 323 aa  52.8  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2319  hypothetical protein  27.06 
 
 		 323 aa  52.8  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2399  hypothetical protein  27.06 
 
 		 323 aa  52.8  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2731  import inner membrane translocase, subunit Tim44  25.51 
 
 		 343 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.767216  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2119  import inner membrane translocase, subunit Tim44  25.51 
 
 		 343 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434025  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0684  Tim44-like domain-containing protein  37.16 
 
 		 323 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0668  Tim44-like domain-containing protein  37.16 
 
 		 324 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0845  transmembrane protein  37.16 
 
 		 323 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376855  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0214  import inner membrane translocase, subunit Tim44  26.53 
 
 		 306 aa  50.4  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.525387  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2065  import inner membrane translocase subunit Tim44  25.91 
 
 		 320 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0100272 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2096  hypothetical protein  26.09 
 
 		 318 aa  47.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0739383  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>