52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0551 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0551  import inner membrane translocase subunit Tim44  100 
 
 		 324 aa  630  1e-180  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031829 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2211  import inner membrane translocase subunit Tim44  59.33 
 
 		 318 aa  247  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.895169  normal  0.192893 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5842  import inner membrane translocase subunit Tim44  61.85 
 
 		 318 aa  235  7e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2529  import inner membrane translocase subunit Tim44  58.48 
 
 		 319 aa  232  8.000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2254  import inner membrane translocase subunit Tim44  58.48 
 
 		 319 aa  231  1e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.349216  normal  0.0696359 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2567  import inner membrane translocase, subunit Tim44  51.41 
 
 		 312 aa  224  1e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2165  hypothetical protein  50.79 
 
 		 312 aa  219  5e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.810394 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5490  hypothetical protein  50.45 
 
 		 325 aa  206  6e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5103  import inner membrane translocase subunit Tim44  58.41 
 
 		 316 aa  203  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4404  import inner membrane translocase subunit Tim44  47.32 
 
 		 337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.583271  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3268  import inner membrane translocase subunit Tim44  50 
 
 		 325 aa  190  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6540  import inner membrane translocase subunit Tim44  43.24 
 
 		 332 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.398166  normal  0.199544 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6128  import inner membrane translocase subunit Tim44  43.16 
 
 		 331 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.418522  normal  0.280335 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0334  import inner membrane translocase subunit Tim44  47.39 
 
 		 321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  0.137155 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1526  import inner membrane translocase, subunit Tim44  49.24 
 
 		 332 aa  169  9e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.496585  normal  0.854494 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1701  import inner membrane translocase, subunit Tim44  49.76 
 
 		 331 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3768  import inner membrane translocase, subunit Tim44  58.21 
 
 		 338 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2207  import inner membrane translocase subunit Tim44  49.55 
 
 		 329 aa  160  3e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1921  import inner membrane translocase subunit Tim44  40 
 
 		 348 aa  159  8e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.464054  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3590  hypothetical protein  44.65 
 
 		 270 aa  155  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1269  hypothetical protein  42.26 
 
 		 342 aa  150  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.753871  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1858  import inner membrane translocase subunit Tim44  44.78 
 
 		 333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.767036  normal  0.41098 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0311  import inner membrane translocase subunit Tim44  52.48 
 
 		 320 aa  138  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.470069  normal  0.0470868 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0901  import inner membrane translocase, subunit Tim44  29.94 
 
 		 314 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000201824  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1284  import inner membrane translocase subunit Tim44  29.79 
 
 		 318 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.45671e-16 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3566  import inner membrane translocase, subunit Tim44  29.31 
 
 		 317 aa  73.6  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000205074  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1091  putative lipoprotein  33.53 
 
 		 321 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000494647  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1927  import inner membrane translocase, subunit Tim44  35.07 
 
 		 322 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000885618  normal  0.873638 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0482  import inner membrane translocase, subunit Tim44  34.13 
 
 		 331 aa  66.2  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0544  import inner membrane translocase subunit Tim44  24.32 
 
 		 295 aa  65.5  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0785  import inner membrane translocase, subunit Tim44  36.21 
 
 		 314 aa  62  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0683467  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0375  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.57 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3295  import inner membrane translocase, subunit Tim44  30.99 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081668  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2938  import inner membrane translocase subunit Tim44  29.91 
 
 		 318 aa  50.8  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000555932  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3250  import inner membrane translocase subunit Tim44  33.33 
 
 		 321 aa  50.4  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0554  Tim44-like domain-contain protein  29.97 
 
 		 340 aa  49.7  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2758  import inner membrane translocase subunit Tim44  29.45 
 
 		 343 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.778073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2731  import inner membrane translocase, subunit Tim44  29.45 
 
 		 343 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.767216  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2119  import inner membrane translocase, subunit Tim44  29.45 
 
 		 343 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434025  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1010  import inner membrane translocase subunit Tim44  32.5 
 
 		 322 aa  48.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5517  hypothetical protein  24.24 
 
 		 280 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2096  hypothetical protein  26.17 
 
 		 318 aa  46.2  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0739383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5646  import inner membrane translocase, subunit Tim44  25 
 
 		 292 aa  45.8  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169336 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5777  import inner membrane translocase subunit Tim44  27.83 
 
 		 448 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2399  hypothetical protein  28.82 
 
 		 323 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2861  import inner membrane translocase subunit Tim44  29.17 
 
 		 308 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0187  hypothetical protein  28.82 
 
 		 323 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2759  hypothetical protein  28.82 
 
 		 323 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2319  hypothetical protein  28.82 
 
 		 323 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0684  Tim44-like domain-containing protein  29.39 
 
 		 323 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0845  transmembrane protein  29.68 
 
 		 323 aa  42.7  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.376855  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1898  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.69 
 
 		 295 aa  42.7  0.009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.859506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>