56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2048 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2048  import inner membrane translocase subunit Tim44  100 
 
 		 250 aa  493  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.476328  normal  0.72544 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0299  import inner membrane translocase, subunit Tim44  59.32 
 
 		 233 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0156  hypothetical protein  59.66 
 
 		 233 aa  268  4e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0421  import inner membrane translocase, subunit Tim44  57.56 
 
 		 235 aa  268  5e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0400  import inner membrane translocase, subunit Tim44  58.97 
 
 		 235 aa  264  8.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0107  hypothetical protein  57.02 
 
 		 234 aa  264  8.999999999999999e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0305  import inner membrane translocase subunit Tim44  56.84 
 
 		 235 aa  261  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0117  import inner membrane translocase, subunit Tim44  54.74 
 
 		 234 aa  255  6e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0729784  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1374  import inner membrane translocase subunit Tim44  55.08 
 
 		 238 aa  241  6e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.314839  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0998  import inner membrane translocase subunit Tim44  55.46 
 
 		 241 aa  241  7.999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1560  import inner membrane translocase subunit Tim44  52.12 
 
 		 239 aa  233  3e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.69866 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1839  import inner membrane translocase subunit Tim44  52.12 
 
 		 239 aa  233  3e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.661091  normal  0.32542 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1681  import inner membrane translocase subunit Tim44  51.05 
 
 		 242 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3713  import inner membrane translocase subunit Tim44  51.06 
 
 		 237 aa  224  7e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.500571 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0009  Membrane associated transporter protein  49.58 
 
 		 232 aa  219  3e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3485  import inner membrane translocase, subunit Tim44  49.37 
 
 		 235 aa  217  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1248  import inner membrane translocase subunit Tim44  50.85 
 
 		 247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.99982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3216  import inner membrane translocase subunit Tim44  47.66 
 
 		 234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1142  import inner membrane translocase subunit Tim44  43.16 
 
 		 239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00140401 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0846  import inner membrane translocase subunit Tim44  46.67 
 
 		 231 aa  199  3e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.748239  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2074  hypothetical protein  46.67 
 
 		 235 aa  198  7.999999999999999e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1994  hypothetical protein  46.22 
 
 		 231 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.289958  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3942  import inner membrane translocase subunit Tim44  45.96 
 
 		 234 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.851876  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4268  import inner membrane translocase subunit Tim44  46.38 
 
 		 234 aa  191  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.331754 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3111  import inner membrane translocase subunit Tim44  41.56 
 
 		 260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.915706  normal  0.806338 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1294  Tim44 domain-containing protein  37.18 
 
 		 230 aa  169  5e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.483295  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3608  hypothetical protein  38.7 
 
 		 219 aa  153  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.765658  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2016  import inner membrane translocase, subunit Tim44  39.22 
 
 		 221 aa  148  8e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00392424 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2676  import inner membrane translocase, subunit Tim44  36.8 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.458481  normal  0.659475 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2855  import inner membrane translocase, subunit Tim44  36.05 
 
 		 218 aa  142  7e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.37899  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2786  import inner membrane translocase, subunit Tim44  38.56 
 
 		 218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.242011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1239  hypothetical protein  35.93 
 
 		 219 aa  136  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2900  import inner membrane translocase, subunit Tim44  35.93 
 
 		 219 aa  135  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.203769  normal  0.596808 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0191  import inner membrane translocase, subunit Tim44  39.3 
 
 		 235 aa  136  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3445  import inner membrane translocase  36.91 
 
 		 221 aa  134  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0584  import inner membrane translocase, subunit Tim44  37.45 
 
 		 247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0642637  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3830  import inner membrane translocase, subunit Tim44  38.89 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.492338  normal  0.0940527 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0138  import inner membrane translocase, subunit Tim44  36.28 
 
 		 221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5038  import inner membrane translocase subunit Tim44  35.65 
 
 		 199 aa  109  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.356912 
 
 
-
 
NC_002978  WD0107  hypothetical protein  25.86 
 
 		 216 aa  102  8e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.262774  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2980  import inner membrane translocase, subunit Tim44  35.5 
 
 		 206 aa  101  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0232  tim44-like domain-containing protein  23.68 
 
 		 212 aa  96.7  3e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.217806  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0778  membrane translocase, subunit Tim44  24.23 
 
 		 212 aa  96.7  3e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.132332  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0288  import inner membrane translocase subunit Tim44  33.06 
 
 		 226 aa  96.7  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0360  Tim44-like domain-containing protein  34.11 
 
 		 208 aa  74.7  0.000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0482  import inner membrane translocase, subunit Tim44  27.59 
 
 		 331 aa  66.2  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1091  putative lipoprotein  25.9 
 
 		 321 aa  54.7  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000494647  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3119  hypothetical protein  22.32 
 
 		 295 aa  48.9  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.448764 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1927  import inner membrane translocase, subunit Tim44  25.15 
 
 		 322 aa  47.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000885618  normal  0.873638 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1004  putative transport protein  25.19 
 
 		 316 aa  47  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1788  import inner membrane translocase, subunit Tim44  24.32 
 
 		 341 aa  46.6  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000825798  normal  0.448103 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1256  hypothetical protein  25.22 
 
 		 204 aa  45.8  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4001  import inner membrane translocase subunit Tim44  23.21 
 
 		 287 aa  45.8  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4024  import inner membrane translocase subunit Tim44  22.36 
 
 		 287 aa  45.4  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.149443  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_94921  MPT family transporter: inner membrane translocase (import) Tim44  21.38 
 
 		 286 aa  43.1  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.417325  normal  0.107445 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4117  import inner membrane translocase subunit Tim44  21.52 
 
 		 287 aa  42.4  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>