68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0998 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0998  import inner membrane translocase subunit Tim44  100 
 
 		 241 aa  477  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1374  import inner membrane translocase subunit Tim44  92.12 
 
 		 238 aa  431  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.314839  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3713  import inner membrane translocase subunit Tim44  71.67 
 
 		 237 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.500571 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1681  import inner membrane translocase subunit Tim44  69.26 
 
 		 242 aa  317  1e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1839  import inner membrane translocase subunit Tim44  69.29 
 
 		 239 aa  316  2e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.661091  normal  0.32542 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1560  import inner membrane translocase subunit Tim44  69.29 
 
 		 239 aa  316  2e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.69866 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0299  import inner membrane translocase, subunit Tim44  56.17 
 
 		 233 aa  258  7e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0421  import inner membrane translocase, subunit Tim44  52.72 
 
 		 235 aa  251  6e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2048  import inner membrane translocase subunit Tim44  55.88 
 
 		 250 aa  250  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.476328  normal  0.72544 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0400  import inner membrane translocase, subunit Tim44  53.62 
 
 		 235 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0305  import inner membrane translocase subunit Tim44  51.68 
 
 		 235 aa  246  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0156  hypothetical protein  52.77 
 
 		 233 aa  241  7.999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0117  import inner membrane translocase, subunit Tim44  49.79 
 
 		 234 aa  238  5e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0729784  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0107  hypothetical protein  51.25 
 
 		 234 aa  238  9e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3485  import inner membrane translocase, subunit Tim44  47.06 
 
 		 235 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3111  import inner membrane translocase subunit Tim44  48.16 
 
 		 260 aa  214  7e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.915706  normal  0.806338 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0009  Membrane associated transporter protein  48.35 
 
 		 232 aa  213  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3216  import inner membrane translocase subunit Tim44  47.28 
 
 		 234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1142  import inner membrane translocase subunit Tim44  45.99 
 
 		 239 aa  211  1e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00140401 
 
 
-
 
NC_004310  BR2074  hypothetical protein  45.33 
 
 		 235 aa  195  6e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1994  hypothetical protein  45.33 
 
 		 231 aa  194  7e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.289958  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3942  import inner membrane translocase subunit Tim44  46.09 
 
 		 234 aa  193  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.851876  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4268  import inner membrane translocase subunit Tim44  46.5 
 
 		 234 aa  192  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.331754 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0846  import inner membrane translocase subunit Tim44  43.91 
 
 		 231 aa  190  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.748239  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1248  import inner membrane translocase subunit Tim44  47.46 
 
 		 247 aa  188  8e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.99982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1294  Tim44 domain-containing protein  37.02 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.483295  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3608  hypothetical protein  38.49 
 
 		 219 aa  153  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.765658  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2676  import inner membrane translocase, subunit Tim44  40.17 
 
 		 219 aa  152  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.458481  normal  0.659475 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1239  hypothetical protein  39.33 
 
 		 219 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2900  import inner membrane translocase, subunit Tim44  39.33 
 
 		 219 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.203769  normal  0.596808 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2016  import inner membrane translocase, subunit Tim44  35.04 
 
 		 221 aa  137  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00392424 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2786  import inner membrane translocase, subunit Tim44  35.74 
 
 		 218 aa  135  7.000000000000001e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.242011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0138  import inner membrane translocase, subunit Tim44  34.58 
 
 		 221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3445  import inner membrane translocase  36.48 
 
 		 221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0584  import inner membrane translocase, subunit Tim44  35.34 
 
 		 247 aa  128  9.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0642637  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2855  import inner membrane translocase, subunit Tim44  32.91 
 
 		 218 aa  128  9.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.37899  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0191  import inner membrane translocase, subunit Tim44  34.06 
 
 		 235 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3830  import inner membrane translocase, subunit Tim44  33.48 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.492338  normal  0.0940527 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5038  import inner membrane translocase subunit Tim44  38.71 
 
 		 199 aa  97.8  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.356912 
 
 
-
 
NC_002978  WD0107  hypothetical protein  28.48 
 
 		 216 aa  93.6  2e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.262774  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2980  import inner membrane translocase, subunit Tim44  33.04 
 
 		 206 aa  92.8  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0778  membrane translocase, subunit Tim44  22.75 
 
 		 212 aa  89.7  3e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.132332  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0288  import inner membrane translocase subunit Tim44  32.22 
 
 		 226 aa  84.7  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0232  tim44-like domain-containing protein  23.21 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.217806  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0360  Tim44-like domain-containing protein  32.62 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0482  import inner membrane translocase, subunit Tim44  30.34 
 
 		 331 aa  74.7  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3119  hypothetical protein  24.47 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.448764 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33251  predicted protein  27.5 
 
 		 221 aa  58.2  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1284  import inner membrane translocase subunit Tim44  28.57 
 
 		 318 aa  54.3  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.45671e-16 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3566  import inner membrane translocase, subunit Tim44  27.91 
 
 		 317 aa  53.5  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000205074  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1091  putative lipoprotein  27.15 
 
 		 321 aa  53.1  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000494647  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3607  import inner membrane translocase, subunit Tim44  23.27 
 
 		 291 aa  51.6  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1927  import inner membrane translocase, subunit Tim44  28.47 
 
 		 322 aa  51.6  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000885618  normal  0.873638 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2938  import inner membrane translocase subunit Tim44  28 
 
 		 318 aa  51.6  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000555932  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4001  import inner membrane translocase subunit Tim44  21.63 
 
 		 287 aa  48.9  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4340  hypothetical protein  23.27 
 
 		 291 aa  48.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1550  hypothetical protein  23.55 
 
 		 291 aa  47.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0535221  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4117  import inner membrane translocase subunit Tim44  21.22 
 
 		 287 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_94921  MPT family transporter: inner membrane translocase (import) Tim44  22.58 
 
 		 286 aa  46.6  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.417325  normal  0.107445 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3250  import inner membrane translocase subunit Tim44  24.88 
 
 		 321 aa  45.8  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3295  import inner membrane translocase, subunit Tim44  27.46 
 
 		 318 aa  45.8  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081668  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0785  import inner membrane translocase, subunit Tim44  26.76 
 
 		 314 aa  45.4  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0683467  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4024  import inner membrane translocase subunit Tim44  22.45 
 
 		 287 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.149443  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3925  import inner membrane translocase subunit Tim44  22.45 
 
 		 287 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1010  import inner membrane translocase subunit Tim44  22.84 
 
 		 322 aa  43.9  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1788  import inner membrane translocase, subunit Tim44  22.82 
 
 		 341 aa  43.5  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000825798  normal  0.448103 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1256  hypothetical protein  29.85 
 
 		 204 aa  43.1  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01439  hypothetical protein  22.8 
 
 		 290 aa  42.7  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>