63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2676 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2676  import inner membrane translocase, subunit Tim44  100 
 
 		 219 aa  437  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.458481  normal  0.659475 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1239  hypothetical protein  91.78 
 
 		 219 aa  410  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2900  import inner membrane translocase, subunit Tim44  91.78 
 
 		 219 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.203769  normal  0.596808 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2855  import inner membrane translocase, subunit Tim44  61.75 
 
 		 218 aa  279  2e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.37899  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3445  import inner membrane translocase  64.71 
 
 		 221 aa  278  4e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0191  import inner membrane translocase, subunit Tim44  65.53 
 
 		 235 aa  246  1e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2786  import inner membrane translocase, subunit Tim44  52.94 
 
 		 218 aa  231  5e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.242011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1374  import inner membrane translocase subunit Tim44  40.85 
 
 		 238 aa  153  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.314839  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0998  import inner membrane translocase subunit Tim44  39.59 
 
 		 241 aa  152  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1248  import inner membrane translocase subunit Tim44  39.48 
 
 		 247 aa  146  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.99982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2048  import inner membrane translocase subunit Tim44  36.8 
 
 		 250 aa  144  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.476328  normal  0.72544 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0400  import inner membrane translocase, subunit Tim44  34.17 
 
 		 235 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0299  import inner membrane translocase, subunit Tim44  34.2 
 
 		 233 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0305  import inner membrane translocase subunit Tim44  33.47 
 
 		 235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0156  hypothetical protein  32.5 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0421  import inner membrane translocase, subunit Tim44  33.19 
 
 		 235 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0117  import inner membrane translocase, subunit Tim44  34.17 
 
 		 234 aa  138  4.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0729784  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3111  import inner membrane translocase subunit Tim44  35.83 
 
 		 260 aa  137  8.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.915706  normal  0.806338 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4268  import inner membrane translocase subunit Tim44  36.09 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.331754 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3608  hypothetical protein  35.91 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.765658  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3942  import inner membrane translocase subunit Tim44  35.65 
 
 		 234 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.851876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0107  hypothetical protein  33.47 
 
 		 234 aa  135  7.000000000000001e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3713  import inner membrane translocase subunit Tim44  34.93 
 
 		 237 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.500571 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1839  import inner membrane translocase subunit Tim44  37.72 
 
 		 239 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.661091  normal  0.32542 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1560  import inner membrane translocase subunit Tim44  37.72 
 
 		 239 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.69866 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1681  import inner membrane translocase subunit Tim44  37.23 
 
 		 242 aa  132  5e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1142  import inner membrane translocase subunit Tim44  33.33 
 
 		 239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00140401 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3216  import inner membrane translocase subunit Tim44  35.4 
 
 		 234 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0009  Membrane associated transporter protein  36.21 
 
 		 232 aa  129  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2016  import inner membrane translocase, subunit Tim44  35.02 
 
 		 221 aa  128  6e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00392424 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3485  import inner membrane translocase, subunit Tim44  35.16 
 
 		 235 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2074  hypothetical protein  34.4 
 
 		 235 aa  125  7e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1994  hypothetical protein  33.94 
 
 		 231 aa  124  9e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.289958  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0584  import inner membrane translocase, subunit Tim44  34.58 
 
 		 247 aa  120  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0642637  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0138  import inner membrane translocase, subunit Tim44  36.57 
 
 		 221 aa  119  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0846  import inner membrane translocase subunit Tim44  33.18 
 
 		 231 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.748239  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1294  Tim44 domain-containing protein  31.48 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.483295  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3830  import inner membrane translocase, subunit Tim44  34.65 
 
 		 226 aa  106  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.492338  normal  0.0940527 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5038  import inner membrane translocase subunit Tim44  31.28 
 
 		 199 aa  102  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.356912 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0288  import inner membrane translocase subunit Tim44  33.94 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0107  hypothetical protein  26.39 
 
 		 216 aa  96.3  3e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.262774  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2980  import inner membrane translocase, subunit Tim44  29.25 
 
 		 206 aa  86.7  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0232  tim44-like domain-containing protein  22.62 
 
 		 212 aa  85.9  5e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.217806  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0778  membrane translocase, subunit Tim44  23.39 
 
 		 212 aa  81.6  0.000000000000009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.132332  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0360  Tim44-like domain-containing protein  27.78 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44351  predicted protein  24.69 
 
 		 510 aa  58.9  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0482  import inner membrane translocase, subunit Tim44  25.54 
 
 		 331 aa  58.5  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3119  hypothetical protein  32.59 
 
 		 295 aa  53.9  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.448764 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_94921  MPT family transporter: inner membrane translocase (import) Tim44  22.07 
 
 		 286 aa  53.5  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.417325  normal  0.107445 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3925  import inner membrane translocase subunit Tim44  22.12 
 
 		 287 aa  51.6  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4117  import inner membrane translocase subunit Tim44  21.96 
 
 		 287 aa  51.6  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3607  import inner membrane translocase, subunit Tim44  22.17 
 
 		 291 aa  51.6  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4001  import inner membrane translocase subunit Tim44  22.27 
 
 		 287 aa  49.7  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1110  import inner membrane translocase subunit Tim44  25.49 
 
 		 298 aa  48.5  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.354142  normal  0.0303721 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4340  hypothetical protein  21.23 
 
 		 291 aa  48.5  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4024  import inner membrane translocase subunit Tim44  21.5 
 
 		 287 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.149443  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1091  putative lipoprotein  27.33 
 
 		 321 aa  48.1  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000494647  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1927  import inner membrane translocase, subunit Tim44  22.67 
 
 		 322 aa  46.2  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000885618  normal  0.873638 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1550  hypothetical protein  22.77 
 
 		 291 aa  45.1  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0535221  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5490  hypothetical protein  30.51 
 
 		 325 aa  45.1  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0334  import inner membrane translocase subunit Tim44  25.42 
 
 		 321 aa  42.7  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  0.137155 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0303  import inner membrane translocase subunit Tim44  25.29 
 
 		 283 aa  42.4  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000256366  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0785  import inner membrane translocase, subunit Tim44  22.88 
 
 		 314 aa  42  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0683467  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>