13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_44351 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_44351  predicted protein  100 
 
 
510 aa  1060    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_94921  MPT family transporter: inner membrane translocase (import) Tim44  30.88 
 
 
286 aa  102  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.417325  normal  0.107445 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40652  predicted protein  26.32 
 
 
430 aa  85.5  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.470816  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03880  import inner membrane translocase subunit tim44, mitochondrial precursor, putative  26.6 
 
 
454 aa  80.1  0.00000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.826599  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01281  mitochondrial inner membrane translocase subunit TIM44, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09840)  22.88 
 
 
514 aa  78.6  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.513241  normal  0.247886 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2676  import inner membrane translocase, subunit Tim44  24.69 
 
 
219 aa  58.9  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.458481  normal  0.659475 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1239  hypothetical protein  21.88 
 
 
219 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2900  import inner membrane translocase, subunit Tim44  21.88 
 
 
219 aa  54.7  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.203769  normal  0.596808 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2855  import inner membrane translocase, subunit Tim44  21.05 
 
 
218 aa  52.4  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.37899  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1248  import inner membrane translocase subunit Tim44  26.97 
 
 
247 aa  50.4  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.99982  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3608  hypothetical protein  23.13 
 
 
219 aa  45.8  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.765658  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4268  import inner membrane translocase subunit Tim44  25 
 
 
234 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.331754 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1994  hypothetical protein  24.52 
 
 
231 aa  43.9  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.289958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>