232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2610 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2610  putative cyclase  100 
 
 
261 aa  538  9.999999999999999e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4050  cyclase family protein  45.18 
 
 
275 aa  203  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0384767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1211  cyclase family protein  44.3 
 
 
275 aa  196  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1973  cyclase family protein  41.53 
 
 
280 aa  186  4e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.720532  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1555  putative cyclase  37.83 
 
 
237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2035  cyclase family protein  39.82 
 
 
273 aa  177  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.968158  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1475  cyclase family protein  39.01 
 
 
284 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2933  cyclase family protein  38.2 
 
 
268 aa  169  5e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0520  cyclase family protein  36.12 
 
 
268 aa  165  5.9999999999999996e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669822  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3383  hypothetical protein  39.65 
 
 
272 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3029  cyclase family protein  39.65 
 
 
272 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.297763  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1749  twin-arginine translocation pathway signal  36.89 
 
 
272 aa  157  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.651596  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2674  cyclase family protein  35 
 
 
257 aa  155  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000430104  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3556  cyclase family protein  36.6 
 
 
249 aa  154  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1082  cyclase family protein  36.56 
 
 
247 aa  152  5.9999999999999996e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1498  cyclase family protein  36.1 
 
 
270 aa  151  8e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730756  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1902  putative cyclase  37.34 
 
 
280 aa  151  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1523  metal-dependent hydrolase  34.5 
 
 
244 aa  150  3e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.959878  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1255  cyclase family protein  33.48 
 
 
244 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2272  putative cyclase  36.82 
 
 
260 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3374  cyclase family protein  38.46 
 
 
319 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.640611  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4160  cyclase family protein  36.24 
 
 
249 aa  145  8.000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3295  Extracellular ligand-binding receptor  34.02 
 
 
249 aa  144  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0741916 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0140  cyclase family protein  37.89 
 
 
264 aa  144  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3970  cyclase family protein  36.24 
 
 
248 aa  143  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0115  metal-dependent hydrolase  33.33 
 
 
248 aa  142  5e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2674  cyclase family protein  33.2 
 
 
270 aa  141  9e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.962186  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1964  cyclase family protein  34.85 
 
 
259 aa  141  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01310  predicted metal-dependent hydrolase  33.75 
 
 
251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1937  cyclase family protein  32.56 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3859  hypothetical protein  36.28 
 
 
269 aa  139  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.912715 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0033  cyclase, putative  30.84 
 
 
247 aa  139  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0413  hypothetical protein  32.62 
 
 
250 aa  139  4.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.931168  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0403  hypothetical protein  32.62 
 
 
250 aa  139  4.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3051  hypothetical protein  31.25 
 
 
257 aa  138  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1835  hypothetical protein  35.12 
 
 
263 aa  137  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.162181  normal  0.188486 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1294  cyclase family protein  32.6 
 
 
265 aa  137  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000824208  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1337  putative cyclase  35.27 
 
 
258 aa  135  9e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0647  cyclase family protein  32.64 
 
 
259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1881  cyclase family protein  33.2 
 
 
267 aa  133  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232813  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3256  hypothetical protein  31.4 
 
 
260 aa  132  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.794257 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4925  cyclase family protein  34.31 
 
 
259 aa  132  6.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.346514  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2147  cyclase family protein  37.24 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267005  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0378  cyclase family protein  32.08 
 
 
262 aa  130  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0373  hypothetical protein  31.47 
 
 
243 aa  129  3e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000249402  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3341  cyclase family protein  31.2 
 
 
287 aa  129  4.0000000000000003e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal  0.0821262 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5434  putative cyclase  33.2 
 
 
259 aa  128  7.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1120  cyclase family protein  33.19 
 
 
278 aa  128  9.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140197  normal  0.104236 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5985  cyclase family protein  31.34 
 
 
308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180575  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0077  cyclase family protein  31.99 
 
 
303 aa  126  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1384  cyclase family protein  31.9 
 
 
306 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5013  cyclase family protein  36.54 
 
 
256 aa  125  9e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309055  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4027  cyclase family protein  36.97 
 
 
268 aa  124  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1664  cyclase, putative  29.2 
 
 
231 aa  123  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.547861  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0313  cyclase family protein  36.84 
 
 
256 aa  121  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5760  cyclase family protein  33.06 
 
 
310 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29365  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0142  putative cyclase  31.08 
 
 
320 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.470871  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2415  hypothetical protein  30.9 
 
 
231 aa  109  5e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2561  hypothetical protein  31.38 
 
 
230 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0564  cyclase family protein  30.83 
 
 
244 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0204288 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0677  cyclase superfamily protein  23.68 
 
 
220 aa  101  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.516879  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  29.28 
 
 
213 aa  99.8  4e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  28.7 
 
 
215 aa  94  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0973  cyclase family protein  31.72 
 
 
208 aa  94.4  2e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0579739 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1310  cyclase family protein  29.2 
 
 
216 aa  91.7  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.308551  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  27.39 
 
 
214 aa  90.1  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  29.95 
 
 
223 aa  88.2  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  23.89 
 
 
212 aa  87.4  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0986  hypothetical protein  30.64 
 
 
219 aa  87.4  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.428694  normal  0.859391 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2444  cyclase family protein  26.09 
 
 
214 aa  85.9  7e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0103  cyclase family protein  27.07 
 
 
211 aa  84  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2042  cyclase family protein  27.27 
 
 
210 aa  83.6  0.000000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0111986 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4071  cyclase family protein  29.65 
 
 
207 aa  82  0.000000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65145  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1205  cyclase family protein  27.88 
 
 
210 aa  82  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0461  hypothetical protein  26.43 
 
 
210 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4339  cyclase family protein  28.57 
 
 
217 aa  80.1  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0530585  decreased coverage  0.000845413 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0456  putative cyclase  25.22 
 
 
210 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  25.22 
 
 
210 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0408  putative cyclase  25.22 
 
 
210 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  27.27 
 
 
220 aa  78.2  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  25.55 
 
 
210 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0332  cyclase  25.55 
 
 
210 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  27.84 
 
 
217 aa  77.4  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  24.57 
 
 
216 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2609  cyclase family protein  29 
 
 
222 aa  77.4  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0346  hypothetical protein  25.55 
 
 
210 aa  77  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0361  hypothetical protein  25.55 
 
 
210 aa  77  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0395  putative cyclase  25.55 
 
 
210 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2262  cyclase family protein  22.75 
 
 
236 aa  75.5  0.0000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1029  cyclase family protein  25.78 
 
 
277 aa  75.5  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121896  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0341  cyclase family protein  24.34 
 
 
210 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2854  cyclase family protein  23.01 
 
 
213 aa  74.7  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0383  cyclase family protein  29.78 
 
 
205 aa  73.2  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.777945  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1077  cyclase family protein  25.22 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323976  normal  0.0992095 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  23.45 
 
 
219 aa  72.4  0.000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0130  cyclase family protein  27.68 
 
 
216 aa  72  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1870  putative cyclase  27.31 
 
 
217 aa  71.2  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124068  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1722  hypothetical protein  28.32 
 
 
201 aa  70.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.990715  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1641  cyclase family protein  26.91 
 
 
254 aa  70.5  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0937  cyclase family protein  27.98 
 
 
224 aa  68.2  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.227142  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>