More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3998 on replicon NC_011879
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011879  Achl_3998  ABC transporter related  100 
 
 
316 aa  641    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.296947 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3473  ABC transporter related  65.33 
 
 
315 aa  405  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1808  ABC transporter related  67.24 
 
 
294 aa  384  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000539962 
 
 
-
 
NC_002936  DET0851  sodium extrusion protein NatA, putative  36.58 
 
 
298 aa  221  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0484534  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0770  ABC transporter related  35.23 
 
 
298 aa  210  3e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_755  ABC transproter, ATP-binding protein  33.77 
 
 
298 aa  207  2e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0604586  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4512  ABC transporter, ATPase subunit  36.03 
 
 
305 aa  200  3e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16714  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0634  ABC transporter related  35.4 
 
 
299 aa  198  9e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000003558  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1115  ABC transporter-like protein  36.18 
 
 
292 aa  194  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.894559  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2672  ABC transporter related  36.55 
 
 
300 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.425869  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4618  sodium export ATP-binding protein  35.25 
 
 
294 aa  191  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4245  ABC transporter ATP-binding protein  34.92 
 
 
303 aa  189  4e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.198772  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4257  ABC transporter ATP-binding protein  34.92 
 
 
303 aa  189  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129746  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4622  ABC transporter, ATP-binding protein  34.92 
 
 
294 aa  189  4e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4638  ABC transporter, ATP-binding protein  34.58 
 
 
294 aa  188  9e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.672601  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0617  ABC transporter, ATP-binding protein  34.92 
 
 
294 aa  188  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3210  ABC transporter-related protein  34.24 
 
 
294 aa  186  3e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1450  ABC transporter related protein  34.48 
 
 
299 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4338  ABC transporter related  34.23 
 
 
303 aa  186  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4405  ABC transporter ATP-binding protein  34.58 
 
 
303 aa  186  4e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4745  ABC transporter ATP-binding protein  34.58 
 
 
294 aa  186  4e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3029  ABC transporter related  37.46 
 
 
305 aa  186  5e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000334829 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4636  ABC transporter, ATP-binding protein  33.9 
 
 
294 aa  185  7e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4023  ABC transporter ATP-binding protein  34.01 
 
 
299 aa  185  7e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000993933 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1739  ABC transporter related protein  37.2 
 
 
305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.783462 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7297  ABC transporter related  32.43 
 
 
321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  40.45 
 
 
308 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1451  ABC transporter related protein  40.17 
 
 
266 aa  182  6e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0850349  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0858  ABC transporter related protein  35.41 
 
 
303 aa  182  8.000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00621522  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2557  ABC transporter related  36.33 
 
 
315 aa  182  8.000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.471575  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6164  ABC transporter related  36.82 
 
 
406 aa  182  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0995946  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2403  ABC transporter related protein  35.84 
 
 
309 aa  180  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.983822  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30210  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  33.11 
 
 
326 aa  178  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.816797  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0485  ABC transporter, ATP-binding protein  35.21 
 
 
301 aa  177  1e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2366  ABC transporter related  35.42 
 
 
299 aa  178  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2411  ABC transporter related  35.42 
 
 
299 aa  178  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0293991  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0835  ABC transporter related protein  37.5 
 
 
307 aa  177  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.240086  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5258  ABC transporter, ATP-binding protein  36.48 
 
 
294 aa  176  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1177  ABC transporter related  32.23 
 
 
298 aa  177  3e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0179844  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1385  ABC transporter related  42.36 
 
 
293 aa  176  7e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.208813  normal  0.990681 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2711  ABC transporter related protein  34.97 
 
 
305 aa  175  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358434  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0107  ABC transporter related  35.06 
 
 
326 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208875  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1945  ABC transporter related  40.89 
 
 
303 aa  175  9.999999999999999e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0153054  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2602  ABC transporter related  34.75 
 
 
341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.43511  normal  0.142388 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1057  ABC transporter related  34.52 
 
 
312 aa  173  3.9999999999999995e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000853274  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  36.88 
 
 
291 aa  172  6.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.381076  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_002950  PG0946  ABC transporter, ATP-binding protein  34.33 
 
 
319 aa  172  7.999999999999999e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.15139 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0732  ABC transporter related protein  34.21 
 
 
318 aa  170  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.515959  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0533  ABC transporter related  36.61 
 
 
317 aa  170  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000671777  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4965  ABC transporter related  39.2 
 
 
304 aa  169  4e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0904  ABC transporter-like protein  36.15 
 
 
293 aa  169  6e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.212918  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1795  ABC transporter related  35.14 
 
 
294 aa  169  7e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.881236  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1781  ABC transporter related  33.88 
 
 
297 aa  169  8e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2742  ABC transporter related  32.89 
 
 
292 aa  168  9e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0698  ATP-binding transport protein nata  32.56 
 
 
296 aa  168  9e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.702927  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0703  ABC transporter, ATP-binding protein  32.89 
 
 
296 aa  168  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.282688  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0361  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  35.93 
 
 
297 aa  167  2e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1731  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  35 
 
 
298 aa  167  2.9999999999999998e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000125196  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08261  ABC transporter, ATP-binding protein  32.34 
 
 
309 aa  165  9e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.915315  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1452  ABC transporter-like  35.48 
 
 
297 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218663  hitchhiker  0.00673378 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  36.65 
 
 
310 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4174  ABC transporter related  34.6 
 
 
295 aa  163  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  32.12 
 
 
305 aa  162  6e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1946  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  35.25 
 
 
309 aa  161  1e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.036978  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2040  ABC transporter related  31.79 
 
 
309 aa  161  1e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0581  ABC transporter related protein  34.9 
 
 
290 aa  160  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1274  ABC transporter related protein  32.58 
 
 
298 aa  159  6e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1485  ABC transporter related protein  34.54 
 
 
332 aa  158  9e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1534  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  36.32 
 
 
309 aa  157  2e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5049  ABC transporter related  35.94 
 
 
309 aa  157  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  33.33 
 
 
326 aa  157  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  36.21 
 
 
270 aa  154  1e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  34.19 
 
 
314 aa  154  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4701  ABC transporter related protein  36 
 
 
311 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483925  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0392  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.12 
 
 
347 aa  153  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  32.34 
 
 
282 aa  153  2.9999999999999998e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3411  ABC transporter related  34.53 
 
 
342 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0395155  hitchhiker  0.000120901 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  32.9 
 
 
314 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2963  ABC transporter-like  30.39 
 
 
316 aa  153  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.23893  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0298  ABC transporter related protein  35.02 
 
 
367 aa  153  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717985  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5104  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.59 
 
 
324 aa  152  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0010745  normal  0.559357 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0145  ABC transporter related  32.52 
 
 
295 aa  152  7e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0967597  decreased coverage  0.0026708 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  32.06 
 
 
339 aa  152  8e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151275 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  33.55 
 
 
314 aa  152  8e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0070  heme exporter protein CcmA  38.28 
 
 
337 aa  152  8e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.431821  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3642  ABC transporter related protein  34.95 
 
 
310 aa  151  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1309  ABC transporter related  31.15 
 
 
313 aa  151  2e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000289319  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4664  ABC transporter related  35.87 
 
 
318 aa  150  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.019733  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5639  ABC transporter related  34.62 
 
 
248 aa  150  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  32.77 
 
 
341 aa  150  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  35.02 
 
 
318 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0080  ABC transporter related  29.45 
 
 
305 aa  150  4e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5390  ABC transporter related protein  35.64 
 
 
305 aa  149  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.629555  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3790  ABC transporter related  36.29 
 
 
912 aa  149  5e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1173  ABC transporter related  36.12 
 
 
306 aa  149  7e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0227  ABC transporter related  30.17 
 
 
296 aa  149  8e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0536  ABC transporter related  36.18 
 
 
912 aa  148  9e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.94583  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18350  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  31.37 
 
 
313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0087  ABC transporter related  34.29 
 
 
341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal  0.704785 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0755  ABC transporter related  32.59 
 
 
305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.96491 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>